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Affinity selection–mass spectrometry for the discovery of pharmacologically active compounds from combinatorial libraries and natural products
Journal of Mass Spectrometry ( IF 1.9 ) Pub Date : 2020-08-18 , DOI: 10.1002/jms.4647
Ruth N Muchiri 1 , Richard B van Breemen 1, 2
Affiliation  

Invented to address the high‐throughput screening (HTS) demands of combinatorial chemistry, affinity selection–mass spectrometry (AS‐MS) utilizes binding interactions between ligands and receptors to isolate pharmacologically active compounds from mixtures of small molecules and then relies on the selectivity, sensitivity, and speed of mass spectrometry to identify them. No radiolabels, fluorophores, or chromophores are required. Although many variations of AS‐MS have been devised, three approaches have emerged as the most flexible, productive, and popular, and they differ primarily in how ligand–receptor complexes are separated from nonbinding compounds in the mixture. These are pulsed ultrafiltration (PUF) AS‐MS, size exclusion chromatography (SEC) AS‐MS, and magnetic microbead affinity selection screening (MagMASS). PUF and SEC AS‐MS are solution‐phase screening approaches, and MagMASS uses receptors immobilized on magnetic microbeads. Because pools of compounds are screened using AS‐MS, each containing hundreds to thousands of potential ligands, hundreds of thousands of compounds can be screened per day. AS‐MS is also compatible with complex mixtures of chemically diverse natural products in extracts of botanicals and fungi and microbial cultures, which often contain fluorophores and chromophores that can interfere with convention HTS. Unlike conventional HTS, AS‐MS may be used to discover ligands binding to allosteric as well as orthosteric receptor sites, and AS‐MS has been useful for discovering ligands to targets that are not easily incorporated into conventional HTS such as membrane‐bound receptors.

中文翻译:

亲和选择-质谱法用于从组合库和天然产物中发现药理活性化合物

为了满足组合化学的高通量筛选 (HTS) 需求,亲和选择质谱 (AS-MS) 利用配体和受体之间的结合相互作用从小分子混合物中分离出药理活性化合物,然后依赖于选择性,质谱法的灵敏度和速度来识别它们。不需要放射性标记、荧光团或发色团。尽管已经设计了许多 AS-MS 变体,但三种方法已经成为最灵活、最高效和最流行的方法,它们的主要区别在于如何将配体 - 受体复合物与混合物中的非结合化合物分离。这些是脉冲超滤 (PUF) AS-MS、尺寸排阻色谱 (SEC) AS-MS 和磁微珠亲和筛选 (MagMASS)。PUF 和 SEC AS-MS 是液相筛选方法,而 MagMASS 使用固定在磁微珠上的受体。由于使用 AS-MS 筛选化合物库,每个化合物库都包含数百到数千个潜在配体,因此每天可以筛选数十万种化合物。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。MagMASS 使用固定在磁微珠上的受体。由于使用 AS-MS 筛选化合物库,每个化合物库都包含数百到数千个潜在配体,因此每天可以筛选数十万种化合物。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。MagMASS 使用固定在磁微珠上的受体。由于使用 AS-MS 筛选化合物库,每个化合物库都包含数百到数千个潜在配体,因此每天可以筛选数十万种化合物。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。每个都包含成百上千的潜在配体,每天可以筛选数十万种化合物。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。每个都包含成百上千的潜在配体,每天可以筛选数十万种化合物。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。AS-MS 还与植物提取物、真菌和微生物培养物中化学性质多样的天然产物的复杂混合物兼容,这些混合物通常含有会干扰常规 HTS 的荧光团和发色团。与传统的 HTS 不同,AS-MS 可用于发现与变构和正构受体位点结合的配体,而 AS-MS 可用于发现不易掺入常规 HTS 的靶标(如膜结合受体)的配体。
更新日期:2020-08-18
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