当前位置: X-MOL 学术ChemRxiv › 论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
分子对接和模拟研究预测乳酸辅酶A作为P300定向乳酸化的底物
ChemRxiv Pub Date : 2020-08-07 , DOI: 10.26434/chemrxiv.12770360.v1
Rushikesh Patel Ajay Kumar Kiran Bharat Lokhande K.V. Swamy Jayanta K. pal Prof. Nilesh Kumar Sharma

背景技术根据沃伯格效应,已知癌细胞产生乳酸而不是丙酮酸作为终产物,并且乳酸的积累与代谢重编程有关。然而,在乳酸的非代谢作用方面,尤其是在表观遗传调控过程中组蛋白的修饰方面,存在着实质性的研究方法。本研究利用计算机分子对接和分子动力学研究来确定实现表观遗传变化的组蛋白的潜在乳化机理。在癌细胞和非癌细胞中 在这里,我们测试了三种潜在的乳酸化底物来源,即乳酸(CHEBI ID:24996),乳酸-CoA(CHEBI ID:15529)和(R)-Slactoylglutathione(PubChem ID-440018)。组蛋白乙酰转移酶p300(HAT p300)酶(PDB ID:结果被认为是乳酸化过程的潜在候选者。结果在所研究的乳酸化过程的底物中,分子对接揭示了乳酸辅酶A与p300酶的高效结合亲和力(对接能为-8.6 Kcal / Mol)。另一方面,乳酸和(R)-S-Lactoylglutathione没有显示与HAT p300酶的任何显着和特异性结合。此外,分子动力学模拟研究表明,p300的底物结合位点上的乳酸辅酶A与氨基酸残基ASP-1399,HIS1402,ARG-1410,THR1411,TYR1414,TRP1436,ASP1454和LYS1456稳定结合。支持丙酸辅酶A是由HAT p300酶进行乳化作用的潜在底物。然而,在癌症和非癌症支持细胞(例如巨噬细胞)的生理水平上未检测到乳糖酰辅酶A。基于我们的数据和对乳酰化的现有观点,作者提出了促肿瘤细菌参与其中,该细菌将乳酸转化为乳酰-CoA,并且乳酰-CoA被穿梭至肿瘤微环境中的巨噬细胞。由于乳酰辅酶A进入巨噬细胞(抗肿瘤),乳酰化过程允许转录变化并实现M1至M2巨噬细胞极化(促肿瘤),进而促进肿瘤的生长和存活。



"点击查看英文标题和摘要"

更新日期:2020-08-08
down
wechat
bug