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Identification of loci controlling phenology, fruit quality and post-harvest quantitative parameters in Japanese plum (Prunus salicina Lindl.)
Postharvest Biology and Technology ( IF 6.4 ) Pub Date : 2020-11-01 , DOI: 10.1016/j.postharvbio.2020.111292
Juan Alfonso Salazar , Igor Pacheco , Patricio Zapata , Paulina Shinya , David Ruiz , Pedro Martínez-Gómez , R. Infante

Abstract Japanese plums are popular fruits since they are exceptionally nutritious with high fiber and antioxidant content. This work has aimed to analyze the most critical phenology, fruit quality and postharvest parameters from a genomic point of view to identify molecular markers closely linked to the most significant Quantitative trait loci (QTLs). A genetic linkage map of an F1 population of 151 individuals from the cross '98–99’ × 'Angeleno' was constructed using previously reported Single Nucleotide polymorphism (SNP) data and 25 additional Simple Sequence Repeat (SSR) markers. Twenty-three phenotypic traits evaluated during three harvest seasons were assayed to estimate best linear unbiased predictors by using two genomic association QTL analysis approaches: General Linear Model-based single marker-trait associations (GLM) and Multiple QTL Model analyses (MQM). In addition, loss of weight and chlorophyll degradation between days 1 and 7 as well as fruit softening for days 1, 4, and 7 were monitored during two consecutive seasons. The most significant identified QTLs were linked to fruit development period and fruit weight in Linkage Groups (LG) 4 and 2, respectively. Regarding postharvest parameters, the identified QTLs related to chlorophyll degradation and loss of weight showed lower significance than phenology or fruit quality traits. In contrast, minor QTLs for fruit firmness evolution using destructive and non-destructive methods were confirmed in LG 4 and 5.

中文翻译:

鉴定日本李 (Prunus salicina Lindl.) 中控制物候、果实品质和采后定量参数的位点

摘要 日本李子是一种受欢迎的水果,因为它们富含纤维和抗氧化剂,营养丰富。这项工作旨在从基因组的角度分析最关键的物候、果实质量和采后参数,以识别与最重要的数量性状基因座 (QTL) 密切相关的分子标记。使用先前报道的单核苷酸多态性 (SNP) 数据和 25 个额外的简单序列重复 (SSR) 标记构建了来自杂交 '98–99' × 'Angeleno' 的 151 个个体的 F1 群体的遗传连锁图。通过使用两种基因组关联 QTL 分析方法,分析了在三个收获季节评估的 23 个表型性状,以估计最佳线性无偏预测因子:基于一般线性模型的单标记性状关联 (GLM) 和多 QTL 模型分析 (MQM)。此外,在连续两个季节监测了第 1 天和第 7 天之间的体重减轻和叶绿素降解以及第 1、4 和 7 天的果实软化情况。鉴定出的最显着 QTL 分别与连锁组 (LG) 4 和 2 中的果实发育期和果实重量相关。关于收获后参数,与叶绿素降解和重量损失相关的已鉴定 QTL 的显着性低于物候或果实品质性状。相比之下,在 LG 4 和 5 中证实了使用破坏性和非破坏性方法进行果实硬度进化的次要 QTL。在连续两个季节监测第 1 天和第 7 天之间的重量损失和叶绿素降解以及第 1、4 和 7 天的果实软化情况。鉴定出的最显着 QTL 分别与连锁组 (LG) 4 和 2 中的果实发育期和果实重量相关。关于收获后参数,与叶绿素降解和重量损失相关的已鉴定 QTL 的显着性低于物候或果实品质性状。相比之下,在 LG 4 和 5 中证实了使用破坏性和非破坏性方法进行果实硬度进化的次要 QTL。在连续两个季节监测第 1 天和第 7 天之间的重量损失和叶绿素降解以及第 1、4 和 7 天的果实软化情况。鉴定出的最显着 QTL 分别与连锁组 (LG) 4 和 2 中的果实发育期和果实重量相关。关于收获后参数,与叶绿素降解和重量损失相关的已鉴定 QTL 的显着性低于物候或果实品质性状。相比之下,在 LG 4 和 5 中证实了使用破坏性和非破坏性方法进行果实硬度进化的次要 QTL。与叶绿素降解和重量损失相关的已鉴定 QTL 的显着性低于物候或果实品质性状。相比之下,在 LG 4 和 5 中证实了使用破坏性和非破坏性方法进行果实硬度进化的次要 QTL。与叶绿素降解和重量损失相关的已鉴定 QTL 的显着性低于物候或果实品质性状。相比之下,在 LG 4 和 5 中证实了使用破坏性和非破坏性方法进行果实硬度进化的次要 QTL。
更新日期:2020-11-01
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