Dietary metabarcoding—the process of taxonomic identification of food species from DNA in consumer guts or faeces—has been rapidly adopted by ecologists to gain insights into biocontrol, invasive species and the structure of food webs. However, an outstanding issue with metabarcoding is the semi‐quantitative nature of the data it provides: because metabarcoding is likely to produce false negatives for some prey more often than for other prey, we cannot infer relative frequencies of prey in the diet. To correct for this, we can adjust detected prey frequencies using DNA detectability half‐lives unique to each predator–prey combination. Because the feeding experiments required to deduce these half‐lives are time‐ and resource‐intensive, our ability to weight the frequency of observations using their detectability has thus far been limited to systems with just a few prey. Here, we present a meta‐analysis of 24 spider prey DNA half‐lives and show that these half‐lives are predictable given predator and prey mass, predator family, digestion temperature and DNA amplicon length. We further provide a new technique for weighting observations with half‐lives, which allows not just for the ranking of prey in the diet, but reveals the proportion of the diet each prey comprises. Lastly, we apply this method to published dietary metabarcoding data to calculate half‐lives and proportion of the predator's diet for 35 prey families, demonstrating that this technique can generate improved understanding of diets in real, diverse systems.

中文翻译：

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使用猎物 DNA 消化率的模式来量化捕食者的饮食。

饮食元条形码——从消费者肠道或粪便中的 DNA 对食物物种进行分类鉴定的过程——已被生态学家迅速采用，以深入了解生物控制、入侵物种和食物网的结构。然而，元条形码的一个突出问题是它提供的数据的半定量性质：因为元条形码可能比其他猎物更频繁地为某些猎物产生假阴性，我们无法推断饮食中猎物的相对频率。为了纠正这一点，我们可以使用每个捕食者 - 猎物组合独有的 DNA 可检测性半衰期来调整检测到的猎物频率。因为推断这些半衰期所需的喂养实验是时间和资源密集型的，迄今为止，我们使用可探测性来衡量观察频率的能力仅限于只有几个猎物的系统。在这里，我们对 24 种蜘蛛猎物 DNA 半衰期进行了荟萃分析，并表明这些半衰期是可预测的，给定捕食者和猎物质量、捕食者家族、消化温度和 DNA 扩增子长度。我们进一步提供了一种用半衰期对观察进行加权的新技术，它不仅可以对饮食中的猎物进行排名，还可以揭示每个猎物在饮食中所占的比例。最后，我们将这种方法应用于已发表的饮食元条形码数据，以计算 35 个猎物家族的捕食者饮食的半衰期和比例，证明该技术可以提高对真实、多样化系统中饮食的理解。我们对 24 种蜘蛛猎物 DNA 半衰期进行了荟萃分析，并表明这些半衰期是可预测的，给定捕食者和猎物质量、捕食者家族、消化温度和 DNA 扩增子长度。我们进一步提供了一种用半衰期对观察进行加权的新技术，它不仅可以对饮食中的猎物进行排名，还可以揭示每个猎物在饮食中所占的比例。最后，我们将这种方法应用于已发表的饮食元条形码数据，以计算 35 个猎物家族的捕食者饮食的半衰期和比例，证明该技术可以提高对真实、多样化系统中饮食的理解。我们对 24 种蜘蛛猎物 DNA 半衰期进行了荟萃分析，并表明这些半衰期是可预测的，给定捕食者和猎物质量、捕食者家族、消化温度和 DNA 扩增子长度。我们进一步提供了一种用半衰期对观察进行加权的新技术，它不仅可以对饮食中的猎物进行排名，还可以揭示每个猎物在饮食中所占的比例。最后，我们将这种方法应用于已发表的饮食元条形码数据，以计算 35 个猎物家族的捕食者饮食的半衰期和比例，证明该技术可以提高对真实、多样化系统中饮食的理解。我们进一步提供了一种用半衰期对观察进行加权的新技术，它不仅可以对饮食中的猎物进行排名，还可以揭示每个猎物在饮食中所占的比例。最后，我们将这种方法应用于已发表的饮食元条形码数据，以计算 35 个猎物家族的捕食者饮食的半衰期和比例，证明该技术可以提高对真实、多样化系统中饮食的理解。我们进一步提供了一种用半衰期对观察进行加权的新技术，它不仅可以对饮食中的猎物进行排名，还可以揭示每个猎物在饮食中所占的比例。最后，我们将这种方法应用于已发表的饮食元条形码数据，以计算 35 个猎物家族的捕食者饮食的半衰期和比例，证明该技术可以提高对真实、多样化系统中饮食的理解。