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Core regulatory circuitries in defining cancer cell identity across the malignant spectrum.
Open Biology ( IF 4.5 ) Pub Date : 2020-07-08 , DOI: 10.1098/rsob.200121
Leila Jahangiri 1, 2 , Loukia Tsaprouni 1 , Ricky M Trigg 2, 3 , John A Williams 4, 5, 6 , Georgios V Gkoutos 4, 5, 7, 8, 9, 10 , Suzanne D Turner 2 , Joao Pereira 11
Affiliation  

Gene expression programmes driving cell identity are established by tightly regulated transcription factors that auto- and cross-regulate in a feed-forward manner, forming core regulatory circuitries (CRCs). CRC transcription factors create and engage super-enhancers by recruiting acetylation writers depositing permissive H3K27ac chromatin marks. These super-enhancers are largely associated with BET proteins, including BRD4, that influence higher-order chromatin structure. The orchestration of these events triggers accessibility of RNA polymerase machinery and the imposition of lineage-specific gene expression. In cancers, CRCs drive cell identity by superimposing developmental programmes on a background of genetic alterations. Further, the establishment and maintenance of oncogenic states are reliant on CRCs that drive factors involved in tumour development. Hence, the molecular dissection of CRC components driving cell identity and cancer state can contribute to elucidating mechanisms of diversion from pre-determined developmental programmes and highlight cancer dependencies. These insights can provide valuable opportunities for identifying and re-purposing drug targets. In this article, we review the current understanding of CRCs across solid and liquid malignancies and avenues of investigation for drug development efforts. We also review techniques used to understand CRCs and elaborate the indication of discussed CRC transcription factors in the wider context of cancer CRC models.



中文翻译:

定义整个恶性谱中癌细胞身份的核心调节电路。

驱动细胞身份的基因表达程序是通过严格调节的转录因子建立的,这些转录因子以前馈方式自动和交叉调节,形成核心调节回路 (CRC)。CRC 转录因子通过招募乙酰化写入者沉积允许的 H3K27ac 染色质标记来创建和使用超级增强子。这些超级增强子主要与 BET 蛋白相关,包括 BRD4,影响高阶染色质结构。这些事件的编排触发了 RNA 聚合酶机制的可及性和谱系特异性基因表达的施加。在癌症中,CRC 通过在遗传改变的背景上叠加发育程序来驱动细胞身份。更远,致癌状态的建立和维持依赖于驱动参与肿瘤发展的因素的 CRC。因此,驱动细胞身份和癌症状态的 CRC 成分的分子解剖有助于阐明从预先确定的发育程序中转移的机制,并突出癌症依赖性。这些见解可以为识别和重新利用药物靶点提供宝贵的机会。在本文中,我们回顾了目前对固体和液体恶性肿瘤中 CRC 的理解以及药物开发工作的调查途径。我们还回顾了用于理解 CRC 的技术,并在更广泛的癌症 CRC 模型背景下详细阐述了所讨论的 CRC 转录因子的指示。驱动细胞身份和癌症状态的 CRC 成分的分子解剖有助于阐明从预先确定的发育程序中转移的机制,并突出癌症依赖性。这些见解可以为识别和重新利用药物靶点提供宝贵的机会。在本文中,我们回顾了目前对固体和液体恶性肿瘤中 CRC 的理解以及药物开发工作的调查途径。我们还回顾了用于理解 CRC 的技术,并在更广泛的癌症 CRC 模型背景下详细阐述了所讨论的 CRC 转录因子的指示。驱动细胞身份和癌症状态的 CRC 成分的分子解剖有助于阐明从预先确定的发育程序中转移的机制,并突出癌症依赖性。这些见解可以为识别和重新利用药物靶点提供宝贵的机会。在本文中,我们回顾了目前对固体和液体恶性肿瘤中 CRC 的理解以及药物开发工作的调查途径。我们还回顾了用于理解 CRC 的技术,并在更广泛的癌症 CRC 模型背景下详细阐述了所讨论的 CRC 转录因子的指示。这些见解可以为识别和重新利用药物靶点提供宝贵的机会。在本文中,我们回顾了目前对固体和液体恶性肿瘤中 CRC 的理解以及药物开发工作的调查途径。我们还回顾了用于理解 CRC 的技术,并在更广泛的癌症 CRC 模型背景下详细阐述了所讨论的 CRC 转录因子的指示。这些见解可以为识别和重新利用药物靶点提供宝贵的机会。在本文中,我们回顾了目前对固体和液体恶性肿瘤中 CRC 的理解以及药物开发工作的调查途径。我们还回顾了用于理解 CRC 的技术,并在更广泛的癌症 CRC 模型背景下详细阐述了所讨论的 CRC 转录因子的指示。

更新日期:2020-07-20
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