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Theoretical study on endocrine disrupting effects of polychlorinated dibenzo-p-dioxins using molecular docking simulation.
Journal of Applied Toxicology ( IF 2.7 ) Pub Date : 2020-07-12 , DOI: 10.1002/jat.4039
Lukman K Akinola 1, 2 , Adamu Uzairu 1 , Gideon A Shallangwa 1 , Stephen E Abechi 1
Affiliation  

Polychlorinated dibenzo‐p‐dioxins (PCDDs) are hypothesized to exert their toxic effects in wildlife and humans via endocrine disruption. However, very scanty information is available on the underlying molecular interactions that trigger this disruption. In this study, molecular docking simulation was used to predict the susceptibility of 12 nuclear receptors to disruption via PCDD bindings. Findings revealed that androgen (AR and AR an), estrogen (ER α and ER β), glucocorticoid (GR) and thyroid hormone (TR α and TR β) receptors are the most probable protein targets that bind to PCDDs. Further molecular docking analyses showed that PCDD molecules mimic the modes of interaction observed for the co‐crystallized ligands of the affected receptors, resulting in the formation of ligand‐receptor complexes that were stabilized through electrostatic, van der Waals, pi‐effect and hydrophobic interactions with 18, 17, 17, 16, 18, eight and four amino acid residues in the active sites of AR, AR an, ER α, ER β, GR, TR α and TR β respectively. The commonalities of these interacting amino acid residues with those utilized by dihydrotestosterone in AR, bicalutamide in AR an, 17β‐estradiol in ER α, 17β‐estradiol in ER β, cortisol in GR, thyromimetic GC‐1 in TR α and thyromimetic GC‐1 in TR β are 86%, 74%, 94%, 80%, 82%, 50% and 43% respectively. The results obtained in this study provide supporting evidence that PCDD molecules may interfere with the endocrine system via binding interactions with some vital amino acid residues in the binding pockets of AR, ERs, GRs and TRs.

中文翻译:

基于分子对接模拟的多氯二苯并对二恶英内分泌干扰作用的理论研究[J].

多氯化二苯并p- 二恶英 (PCDD) 被假设通过内分泌干扰对野生动物和人类产生毒性作用。然而,关于触发这种破坏的潜在分子相互作用的信息非常少。在这项研究中,分子对接模拟用于预测 12 种核受体对 PCDD 结合破坏的敏感性。研究结果表明,雄激素(AR 和 AR an)、雌激素(ER α 和 ER β)、糖皮质激素(GR)和甲状腺激素(TR α 和 TR β)受体是最有可能与 PCDD 结合的蛋白质靶标。进一步的分子对接分析表明,PCDD 分子模拟了在受影响受体的共结晶配体中观察到的相互作用模式,导致配体-受体复合物的形成,这些复合物通过静电、范德华力、分别与 AR、AR an、ER α、ER β、GR、TR α 和 TR β 的活性位点中的 18、17、17、16、18、8 和 4 个氨基酸残基的 pi 效应和疏水相互作用。这些相互作用的氨基酸残基与 AR 中的双氢睾酮、​​AR 中的比卡鲁胺、ER α 中的 17β-雌二醇、ER β 中的 17β-雌二醇、GR 中的皮质醇、TR α 中的拟甲状腺素 GC-1 和拟甲状腺素 GC- 所使用的氨基酸残基的共性TR β中的1分别为86%、74%、94%、80%、82%、50%和43%。本研究中获得的结果提供了支持证据,即 PCDD 分子可能通过与 AR、ER、GR 和 TR 结合口袋中的一些重要氨基酸残基的结合相互作用来干扰内分泌系统。TR α 和 TR β 分别。这些相互作用的氨基酸残基与 AR 中的双氢睾酮、​​AR 中的比卡鲁胺、ER α 中的 17β-雌二醇、ER β 中的 17β-雌二醇、GR 中的皮质醇、TR α 中的拟甲状腺素 GC-1 和拟甲状腺素 GC- 所使用的氨基酸残基的共性TR β中的1分别为86%、74%、94%、80%、82%、50%和43%。本研究中获得的结果提供了支持证据,即 PCDD 分子可能通过与 AR、ER、GR 和 TR 结合口袋中的一些重要氨基酸残基的结合相互作用来干扰内分泌系统。TR α 和 TR β 分别。这些相互作用的氨基酸残基与 AR 中的双氢睾酮、​​AR 中的比卡鲁胺、ER α 中的 17β-雌二醇、ER β 中的 17β-雌二醇、GR 中的皮质醇、TR α 中的拟甲状腺素 GC-1 和拟甲状腺素 GC- 所使用的氨基酸残基的共性TR β中的1分别为86%、74%、94%、80%、82%、50%和43%。本研究中获得的结果提供了支持证据,即 PCDD 分子可能通过与 AR、ER、GR 和 TR 结合口袋中的一些重要氨基酸残基的结合相互作用来干扰内分泌系统。分别为 50% 和 43%。本研究中获得的结果提供了支持证据,即 PCDD 分子可能通过与 AR、ER、GR 和 TR 结合口袋中的一些重要氨基酸残基的结合相互作用来干扰内分泌系统。分别为 50% 和 43%。本研究中获得的结果提供了支持证据,即 PCDD 分子可能通过与 AR、ER、GR 和 TR 结合口袋中的一些重要氨基酸残基的结合相互作用来干扰内分泌系统。
更新日期:2020-07-12
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