BMI is a strong indicator of complications from type I diabetes, especially under intensive treatment. We have genotyped 435 type 1 diabetics using Illumina Infinium Omni Express Exome-8 v1.4 arrays and performed mitoGWAS on BMI. We identified additive interactions between mitochondrial and nuclear variants in genes associated with mitochondrial functioning MitoCarta2.0 and confirmed and refined the results on external cohorts: the Framingham Heart Study (FHS) and GTEx data. Linear mixed model analysis was performed using the GENESIS package in R/Bioconductor. We find a borderline significant association between the mitochondrial variant rs28357980, localized to MT-ND2, and BMI (β = − 0.69, p = 0.056). This BMI association was confirmed on 1889 patients from FHS cohort (β = − 0.312, p = 0.047). Next, we searched for additive interactions between mitochondrial and nuclear variants. MT-ND2 variants interacted with variants in the genes SIRT3, ATP5B, CYCS, TFB2M and POLRMT. TFB2M is a mitochondrial transcription factor and together with TFAM creates a transcription promoter complex for the mitochondrial polymerase POLRMT. We have found an interaction between rs3021088 in MT-ND2 and rs6701836 in TFB2M leading to BMI decrease (inter_pval = 0.0241), while interaction of rs3021088 in MT-ND2 and rs41542013 in POLRMT led to BMI increase (inter_pval = 0.0004). The influence of these interactions on BMI was confirmed in external cohorts. Here, we have shown that variants in the mitochondrial genome as well as additive interactions between mitochondrial and nuclear SNPs influence BMI in T1DM and general cohorts.

中文翻译：

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线粒体GWAS与T1DM患者的BMI与核线粒体上皮的关系。

BMI是I型糖尿病并发症的有力指标，尤其是在强化治疗下。我们已经使用Illumina Infinium Omni Express Exome-8 v1.4阵列对435位1型糖尿病患者进行了基因分型，并在BMI上进行了mitoGWAS。我们在与线粒体功能性MitoCarta2.0相关的基因中发现了线粒体与核变异之间的加性相互作用，并确认并完善了外部队列研究的结果：弗雷明汉心脏研究（FHS）和GTEx数据。使用R / Bioconductor中的GENESIS软件包进行线性混合模型分析。我们发现位于MT-ND2的线粒体变体rs28357980与BMI之间存在临界的显着关联（β= − 0.69，p = 0.056）。BHS关联在FHS队列中的1889位患者中得到证实（β= − 0.312，p = 0.047）。下一个，我们寻找线粒体和核变异体之间的加性相互作用。MT-ND2变体与SIRT3，ATP5B，CYCS，TFB2M和POLRMT基因中的变体相互作用。TFB2M是线粒体转录因子，与TFAM一起为线粒体聚合酶POLRMT创建转录启动子复合体。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。MT-ND2变体与SIRT3，ATP5B，CYCS，TFB2M和POLRMT基因中的变体相互作用。TFB2M是线粒体转录因子，与TFAM一起为线粒体聚合酶POLRMT创建转录启动子复合体。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。MT-ND2变体与SIRT3，ATP5B，CYCS，TFB2M和POLRMT基因中的变体相互作用。TFB2M是线粒体转录因子，与TFAM一起为线粒体聚合酶POLRMT创建了转录启动子复合体。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。TFB2M是线粒体转录因子，与TFAM一起为线粒体聚合酶POLRMT创建了转录启动子复合体。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。TFB2M是线粒体转录因子，与TFAM一起为线粒体聚合酶POLRMT创建转录启动子复合体。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。我们发现MT-ND2中的rs3021088和TFB2M中的rs6701836之间的相互作用导致BMI降低（inter_pval = 0.0241），而MT-ND2中的rs3021088和POLRMT中的rs41542013相互作用导致BMI升高（inter_pval = 0.0004）。这些相互作用对BMI的影响在外部队列中得到证实。在这里，我们已经表明，线粒体基因组中的变异以及线粒体和核SNP之间的加性相互作用都会影响T1DM和一般人群的BMI。