Abstract RNA viruses are major threats to global society and mass outbreaks can cause long-lasting damage to international economies. RNA and related retro viruses represent a large and diverse family that contribute to the onset of human diseases such as AIDS; certain cancers like T cell lymphoma; severe acute respiratory illnesses as seen with COVID-19; and others. The hallmark of this viral family is the storage of genetic material in the form of RNA, and upon infecting host cells, their RNA genomes reprogram the cellular environment to favor productive viral replication. RNA is a multifunctional biomolecule that not only stores and transmits heritable information, but it also has the capacity to catalyze complex biochemical reactions. It is therefore no surprise that RNA viruses use this functional diversity to their advantage to sustain chronic or lifelong infections. Efforts to subvert RNA viruses therefore requires a deep understanding of the mechanisms by which these pathogens usurp cellular machinery. Here, we briefly summarize several experimental techniques that individually inform on key physicochemical features of viral RNA genomes and their interactions with proteins. Each of these techniques provide important vantage points to understand the complexities of virus-host interactions, but we attempt to make the case that by integrating these and similar methods, more vivid descriptions of how viruses reprogram the cellular environment emerges. These vivid descriptions should expedite the identification of novel therapeutic targets.

中文翻译：

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揭示 RNA 病毒重新编程细胞环境机制的综合方法

摘要 RNA 病毒是全球社会的主要威胁，大规模爆发可能对国际经济造成长期损害。RNA 和相关的逆转录病毒代表了一个庞大而多样的家族，它们导致了艾滋病等人类疾病的发作；某些癌症，如 T 细胞淋巴瘤；与 COVID-19 一起出现的严重急性呼吸道疾病；和别的。这个病毒家族的标志是以 RNA 的形式存储遗传物质，并且在感染宿主细胞后，它们的 RNA 基因组会重新编程细胞环境以促进病毒复制。RNA 是一种多功能生物分子，不仅可以储存和传递遗传信息，而且还具有催化复杂生化反应的能力。因此，RNA 病毒利用这种功能多样性来维持慢性或终生感染也就不足为奇了。因此，破坏 RNA 病毒的努力需要深入了解这些病原体篡夺细胞机器的机制。在这里，我们简要总结了几种实验技术，这些技术分别告知病毒 RNA 基因组的关键物理化学特征及其与蛋白质的相互作用。这些技术中的每一种都为理解病毒与宿主相互作用的复杂性提供了重要的优势，但我们试图证明，通过整合这些和类似的方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。因此，破坏 RNA 病毒的努力需要深入了解这些病原体篡夺细胞机器的机制。在这里，我们简要总结了几种实验技术，这些技术分别告知病毒 RNA 基因组的关键物理化学特征及其与蛋白质的相互作用。这些技术中的每一种都为理解病毒与宿主相互作用的复杂性提供了重要的优势，但我们试图证明，通过整合这些和类似的方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。因此，破坏 RNA 病毒的努力需要深入了解这些病原体篡夺细胞机器的机制。在这里，我们简要总结了几种实验技术，这些技术分别告知病毒 RNA 基因组的关键物理化学特征及其与蛋白质的相互作用。这些技术中的每一种都为理解病毒与宿主相互作用的复杂性提供了重要的优势，但我们试图证明，通过整合这些和类似的方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。我们简要总结了几种实验技术，这些技术分别告知病毒 RNA 基因组的关键物理化学特征及其与蛋白质的相互作用。这些技术中的每一种都为理解病毒与宿主相互作用的复杂性提供了重要的优势，但我们试图证明，通过整合这些和类似的方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。我们简要总结了几种实验技术，这些技术分别告知病毒 RNA 基因组的关键物理化学特征及其与蛋白质的相互作用。这些技术中的每一种都为理解病毒与宿主相互作用的复杂性提供了重要的优势，但我们试图证明，通过整合这些和类似的方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。但我们试图证明，通过整合这些方法和类似方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。但我们试图证明，通过整合这些方法和类似方法，可以更生动地描述病毒如何重新编程细胞环境。这些生动的描述应该会加快新治疗靶点的识别。