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Genetic architecture of inherited retinal degeneration in Germany: A large cohort study from a single diagnostic center over a 9-year period.
Human Mutation ( IF 3.3 ) Pub Date : 2020-06-12 , DOI: 10.1002/humu.24064
Nicole Weisschuh 1 , Carolin D Obermaier 2, 3 , Florian Battke 3 , Antje Bernd 1, 4 , Laura Kuehlewein 1, 4 , Fadi Nasser 4 , Ditta Zobor 1 , Eberhart Zrenner 1, 5 , Eva Weber 1 , Bernd Wissinger 1 , Saskia Biskup 2, 3 , Katarina Stingl 4 , Susanne Kohl 1
Affiliation  

We aimed to unravel the molecular genetic basis of inherited retinal degeneration (IRD) in a comprehensive cohort of patients diagnosed in the largest center for IRD in Germany. A cohort of 2,158 affected patients from 1,785 families diagnosed with IRD was analyzed by targeted next‐generation sequencing (NGS). Patients with single‐gene disorders (i.e., choroideremia and retinoschisis) were analyzed by Sanger sequencing and multiplex ligation‐dependent probe amplification. Our study cohort accounts for ∼7% of the estimated 30,000 patients with IRD in Germany, thereby providing representative data for both the prevalence of IRDs and the mutation spectrum of IRD genes for the population in Germany. We achieved a molecular diagnostic rate of 35–95%, depending on the clinical entities, with a high detection rate for achromatopsia, retinoschisis, and choroideremia, and a low detection rate for central areolar choroidal dystrophy and macular dystrophy. A total of 1,161 distinct variants were identified, including 501 novel variants, reaffirming the known vast genetic heterogeneity of IRD in a mainly outbred European population. This study demonstrates the clinical utility of panel‐based NGS in a large and highly heterogeneous cohort from an outbred population and for the first time gives a comprehensive representation of the genetic landscape of IRDs in Germany. The data are valuable and crucial for the scientific community and healthcare providers, but also for the pharmaceutical industry in the progressing field of personalized medicine and gene therapy.

中文翻译:

德国遗传性视网膜变性的遗传结构:来自单一诊断中心的一项为期 9 年的大型队列研究。

我们旨在在德国最大的 IRD 中心诊断出的综合患者队列中解开遗传性视网膜变性 (IRD) 的分子遗传学基础。通过靶向下一代测序 (NGS) 分析了来自 1,785 个被诊断患有 IRD 家庭的 2,158 名受影响患者。通过 Sanger 测序和多重连接依赖性探针扩增对单基因疾病(即无脉络膜血症和视网膜劈裂症)患者进行分析。我们的研究队列约占德国 30,000 名 IRD 患者的 7%,从而为德国人群的 IRD 患病率和 IRD 基因突变谱提供了代表性数据。我们实现了 35-95% 的分子诊断率,具体取决于临床实体,对全色盲、视网膜劈裂症、和脉络膜血症,以及中央乳晕脉络膜营养不良和黄斑营养不良的检出率低。总共确定了 1,161 个不同的变异,包括 501 个新变异,重申了在主要远交的欧洲人群中 IRD 已知的巨大遗传异质性。这项研究证明了基于面板的 NGS 在来自远交种群的大型且高度异质的队列中的临床效用,并首次全面展示了德国 IRD 的遗传景观。这些数据对于科学界和医疗保健提供者来说是宝贵且至关重要的,对于个性化医疗和基因治疗这一不断发展的领域中的制药行业来说也是如此。确定了 161 个不同的变异,包括 501 个新变异,重申了在主要远交的欧洲人群中 IRD 已知的巨大遗传异质性。这项研究证明了基于面板的 NGS 在来自远交种群的大型且高度异质的队列中的临床效用,并首次全面展示了德国 IRD 的遗传景观。这些数据对于科学界和医疗保健提供者来说是宝贵且至关重要的,对于个性化医疗和基因治疗这一不断发展的领域中的制药行业来说也是如此。确定了 161 个不同的变异,包括 501 个新变异,重申了在主要远交的欧洲人群中 IRD 已知的巨大遗传异质性。这项研究证明了基于面板的 NGS 在来自远交种群的大型且高度异质的队列中的临床效用,并首次全面展示了德国 IRD 的遗传景观。这些数据对于科学界和医疗保健提供者来说是宝贵且至关重要的,对于个性化医疗和基因治疗这一不断发展的领域中的制药行业来说也是如此。这项研究证明了基于面板的 NGS 在来自远交种群的大型且高度异质的队列中的临床效用,并首次全面展示了德国 IRD 的遗传景观。这些数据对于科学界和医疗保健提供者来说是宝贵且至关重要的,对于个性化医疗和基因治疗这一不断发展的领域中的制药行业来说也是如此。这项研究证明了基于面板的 NGS 在来自远交种群的大型且高度异质的队列中的临床效用,并首次全面展示了德国 IRD 的遗传景观。这些数据对于科学界和医疗保健提供者来说是宝贵且至关重要的,对于个性化医疗和基因治疗这一不断发展的领域中的制药行业来说也是如此。
更新日期:2020-06-12
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