Scales and otoliths (ear stones) from fish are routinely sampled for age estimation and fisheries management purposes. Growth records from scales and otoliths can be used to generate long-term time series data, and in combination with environmental data, can reveal species specific population responses to a changing climate. Additionally, scale and otolith microchemical data can be utilized to investigate fish habitat usage. A common problem associated with biological collections, is that while sample intake grows, long-term physical storage is rarely a priority, and much of the sampling took place before the advent of open-access digital infrastructure. Material is often collected to meet short-term objectives and resources are seldom committed to maintaining and archiving collections. As a consequence, precious samples are frequently stored in many different and unsuitable locations, and may become lost or separated from associated metadata. The Marine Institute's ecological research station in in Newport, Co. Mayo, Ireland, holds a multi-decadal (1928–2020) collection of scales and otoliths from various fish species, gathered from many geographic locations. Here we present an open-source database model and archiving system to consolidate and digitize this collection, and show how this case study infrastructure could be used for other biological sample collections. The system utilizes the FAIR (Findable Accessible Interoperable and Reusable) open-data principles, and includes a physical repository, sample metadata catalogue, and image library.

定期对鱼的鳞和耳石（耳石）进行采样，以估计年龄和进行渔业管理。来自规模和耳石的生长记录可用于生成长期时间序列数据，并与环境数据结合使用，可揭示特定物种对气候变化的响应。此外，规模和耳石微化学数据可以用来调查鱼类栖息地的使用。与生物采集有关的一个普遍问题是，随着样品摄入量的增加，长期的物理存储很少成为优先事项，并且许多采样是在开放获取数字基础设施出现之前进行的。通常会收集资料以满足短期目标，并且很少将资源用于维护和存档馆藏。作为结果，珍贵的样本经常存储在许多不同且不合适的位置，并且可能会丢失或与关联的元数据分离。海洋研究所在爱尔兰梅奥市纽波特市的生态研究站拥有数十年（1928年至2020年）的鱼鳞和耳石收集，这些鱼鳞和耳石来自许多地理位置。在这里，我们提出了一个开源数据库模型和归档系统，以整合和数字化此采集，并展示了该案例研究基础架构如何可用于其他生物样品采集。该系统利用FAIR（可找到，可访问，可互操作和可重用）开放数据原理，并包括一个物理存储库，示例元数据目录和图像库。海洋研究所在爱尔兰梅奥市纽波特市的生态研究站拥有数十年（1928年至2020年）的鱼鳞和耳石收集，这些鱼鳞和耳石来自许多地理位置。在这里，我们提出了一个开源数据库模型和归档系统，以整合和数字化此采集，并展示了该案例研究基础架构如何可用于其他生物样品采集。该系统利用FAIR（可找到，可访问，可互操作和可重用）开放数据原理，并包括一个物理存储库，示例元数据目录和图像库。海洋研究所在爱尔兰梅奥市纽波特市的生态研究站拥有数十年（1928年至2020年）的鱼鳞和耳石收集，这些鱼鳞和耳石来自许多地理位置。在这里，我们提出了一个开源数据库模型和归档系统，以整合和数字化此采集，并展示了该案例研究基础架构如何可用于其他生物样品采集。该系统利用FAIR（可找到，可访问，可互操作和可重用）开放数据原理，并包括一个物理存储库，示例元数据目录和图像库。在这里，我们提出了一个开源数据库模型和归档系统，以整合和数字化此采集，并展示了该案例研究基础架构如何可用于其他生物样品采集。该系统利用FAIR（可查找，可访问，可互操作和可重用）开放数据原理，并包括一个物理存储库，示例元数据目录和图像库。在这里，我们提出了一个开源数据库模型和归档系统，以整合和数字化此采集，并展示了该案例研究基础架构如何可用于其他生物样品采集。该系统利用FAIR（可找到，可访问，可互操作和可重用）开放数据原理，并包括一个物理存储库，示例元数据目录和图像库。