The composition of intestinal microbiota commonly varies among animal hosts and may affect host health. However, we have limited knowledge about the different relative roles of assembly processes, such as drift, dispersal and environmental selection, for the composition of gut microbiota. Here, we conducted a field study analyzing intestinal microbial communities of two fish species that either have (perch) or lack (roach) a stomach. We used a suite of statistical tools to evaluate the role of different assembly processes for intestine microbiota, including null model analysis (Chase et al., 2011; Fine and Kembel, 2011; Stegen et al., 2013), SourceTracker analysis (Knights et al., 2011) and several multivariate analyses, such as pRDA and PLS analysis. Drift, dispersal (i.e., microbes associated with food sources) and environmental factors (i.e., diet, host habitats), appeared to be of equal importance for the assembly of intestinal microbial communities in roach, while drift appeared most important in perch, followed by dispersal and environmental selection. Furthermore, we found that microbes associated with macroinvertebrates had a positive association to fish body condition (weight/length3) whereas microbes associated with zooplankton had a negative association to fish body condition. These results emphasize the important combined roles of drift, dispersal and environmental selection in shaping the host-associated microbial communities. We conclude that general conclusions about fish as a whole are not justified since different species differ in the relative roles of these important drivers of community assembly.

中文翻译：

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环境选择、扩散和漂移在带胃和不带胃淡水鱼肠道微生物群落组装中的不同作用

肠道微生物群的组成通常因动物宿主而异，并可能影响宿主健康。然而，我们对组装过程（如漂移、扩散和环境选择）对肠道微生物群组成的不同相对作用的了解有限。在这里，我们进行了一项实地研究，分析了有（鲈鱼）或没有（蟑螂）胃的两种鱼类的肠道微生物群落。我们使用了一套统计工具来评估不同组装过程对肠道微生物群的作用，包括无效模型分析（Chase 等人，2011 年；Fine 和 Kembel，2011 年；Stegen 等人，2013 年）、SourceTracker 分析（Knights 等人） al., 2011) 和几个多变量分析，如 pRDA 和 PLS 分析。漂移、扩散（即与食物来源相关的微生物）和环境因素（即，饮食、宿主栖息地），似乎对蟑螂肠道微生物群落的组装同样重要，而漂移在鲈鱼中似乎最重要，其次是扩散和环境选择。此外，我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。似乎对蟑螂肠道微生物群落的组装同样重要，而漂移在鲈鱼中似乎最重要，其次是扩散和环境选择。此外，我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。似乎对蟑螂肠道微生物群落的组装同样重要，而漂移在鲈鱼中似乎最重要，其次是扩散和环境选择。此外，我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。其次是分散和环境选择。此外，我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。其次是分散和环境选择。此外，我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。我们发现与大型无脊椎动物相关的微生物与鱼体状况（体重/长度3）呈正相关，而与浮游动物相关的微生物与鱼体状况呈负相关。这些结果强调了漂移、扩散和环境选择在塑造宿主相关微生物群落方面的重要综合作用。我们得出的结论是，关于鱼类整体的一般结论是不合理的，因为不同物种在这些重要的群落组装驱动因素的相对作用上有所不同。