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Genetic diversity among wild pomegranate (Punica granatum) in Azad Jammu and Kashmir region of Pakistan
Electronic Journal of Biotechnology ( IF 2.3 ) Pub Date : 2020-07-01 , DOI: 10.1016/j.ejbt.2020.06.002
Sadia Aziz , Syeda Firdous , Hifz Rahman , Shahid Iqbal Awan , Vincent Michael , Geoffrey Meru

Abstract Background Pomegranate (Punica granatum L.), one of the most important tropical fruits in Azad Jammu and Kashmir regions of Pakistan, is highly valued for its nutrition and medicinal purposes. Although pomegranate is native to this region, the genetic diversity among wild pomegranate accessions is currently unknown. Such information would be vital for germplasm conservation and breeding efforts. In the current study, genetic diversity among forty-eight wild pomegranate accessions collected from different agro-ecological zones of Azad Jammu and Kashmir was assessed using 41 simple sequence repeat (SSR) markers. Results The markers revealed 303 alleles averaging 7.39 alleles per marker. Polymorphic information content ranged from 0.12 (PGCT093B) to 0.88 (Pom006), with a mean of 0.54. The average genetic distance (GD) across all genotypes was 0.52, and was lowest between Chattar Class and Thorar genotypes (GD = 0.27), but highest between Khun Bandway and Akhor Ban (GD = 0.74). A neighbor-joining dendrogram separated the genotypes into three major clusters, with further sub-clustering within each cluster. Conclusions Overall, the results presented here show significant genetic diversity among wild pomegranate accessions in Azad Jammu and Kashmir region of Pakistan. These accessions present a valuable genetic resource to breeding and cultivar improvement programs within the region. How to cite: Aziz S, Firdous S, Rahman H, et al. Genetic diversity among wild pomegranate (Punica granatum) in Azad Jammu and Kashmir region of Pakistan. Electron J Biotechnol 2020;46. https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002 .

中文翻译:

巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴(Punica granatum)的遗传多样性

摘要背景石榴(Punica granatum L.)是巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区最重要的热带水果之一,因其营养和药用价值而受到高度重视。尽管石榴原产于该地区,但目前尚不清楚野生石榴品种之间的遗传多样性。这些信息对于种质保存和育种工作至关重要。在目前的研究中,使用 41 个简单序列重复 (SSR) 标记评估了从 Azad 查谟和克什米尔不同农业生态区收集的 48 个野生石榴种质的遗传多样性。结果 标记显示 303 个等位基因,平均每个标记有 7.39 个等位基因。多态信息含量从0.12(PGCT093B)到0.88(Pom006),均值为0.54。所有基因型的平均遗传距离 (GD) 为 0.52,在 Chattar Class 和 Thorar 基因型之间最低(GD = 0.27),但在 Khun Bandway 和 Akhor Ban 之间最高(GD = 0.74)。邻居连接树状图将基因型分为三个主要集群,每个集群内进一步细分。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。并且在 Chattar Class 和 Thorar 基因型之间最低(GD = 0.27),但在 Khun Bandway 和 Akhor Ban 之间最高(GD = 0.74)。邻居连接树状图将基因型分为三个主要集群,每个集群内进一步细分。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。并且在 Chattar Class 和 Thorar 基因型之间最低(GD = 0.27),但在 Khun Bandway 和 Akhor Ban 之间最高(GD = 0.74)。相邻连接树状图将基因型分为三个主要簇,每个簇内有进一步的子簇。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。但在 Khun Bandway 和 Akhor Ban 之间最高(GD = 0.74)。邻居连接树状图将基因型分为三个主要集群,每个集群内进一步细分。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。但在 Khun Bandway 和 Akhor Ban 之间最高(GD = 0.74)。邻居连接树状图将基因型分为三个主要集群,每个集群内进一步细分。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。结论 总体而言,此处呈现的结果显示巴基斯坦 Azad 查谟和克什米尔地区的野生石榴种质之间存在显着的遗传多样性。这些种质为该地区的育种和品种改良计划提供了宝贵的遗传资源。如何引用:Aziz S、Firdous S、Rahman H 等。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。巴基斯坦阿扎德查谟和克什米尔地区野生石榴 (Punica granatum) 的遗传多样性。电子 J 生物技术 2020;46。https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2020.06.002。
更新日期:2020-07-01
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