Vascular endothelial growth factor A (VEGF-A) is a chemokine that induces proliferation and migration of vascular endothelial cells and is essential for both physiological and pathological angiogenesis. It is known for its high heritability (> 60%) and involvement in most common morbidities, which makes it a potentially interesting biomarker. Large GWAS studies have already assessed polymorphisms related to VEGF-A. However, no previous research has provided epigenome-wide insight in regulation of VEGF-A. VEGF-A concentrations of healthy participants from the STANISLAS Family Study (n = 201) were comprehensively assessed for association with DNA methylation. Genome-wide DNA methylation profiles were determined in whole blood DNA using the 450K Infinium BeadChip Array (Illumina). VEGF-A concentration in PBMC extracts was detected using a high-sensitivity multiplex Cytokine Array (Randox Laboratories, UK). Epigenome-wide association analysis identified 41 methylation sites significantly associated with VEGF-A concentrations derived from PBMC extracts. Twenty CpG sites within 13 chromosomes reached Holm-Bonferroni significance. Significant values ranged from P = 1.08 × 10−7 to P = 5.64 × 10−15. This study exposed twenty significant CpG sites linking DNA methylation to VEGF-A concentration. Methylation detected in promoter regions, such as TPX2 and HAS-1, could explain previously reported associations with the VEGFA gene. Methylation may also help in the understanding of the regulatory mechanisms of other genes located in the vicinity of detected CpG sites.

中文翻译：

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健康个体的表观基因组关联研究确定了与 DNA 甲基化和 PBMC 提取物 VEGF-A 浓度的显着关联。

血管内皮生长因子 A (VEGF-A) 是一种趋化因子，可诱导血管内皮细胞的增殖和迁移，对生理和病理血管生成都至关重要。它以其高遗传力 (> 60%) 和参与最常见的发病率而闻名，这使其成为潜在的有趣生物标志物。大型 GWAS 研究已经评估了与 VEGF-A 相关的多态性。然而，之前的研究没有提供有关 VEGF-A 调节的表观基因组范围的见解。对来自 STANISLAS 家庭研究（n = 201）的健康参与者的 VEGF-A 浓度进行了全面评估，以确定与 DNA 甲基化的关联。使用 450K Infinium BeadChip Array (Illumina) 在全血 DNA 中测定全基因组 DNA 甲基化谱。使用高灵敏度多重细胞因子阵列（Randox Laboratories，UK）检测 PBMC 提取物中的 VEGF-A 浓度。表观基因组关联分析确定了 41 个甲基化位点与来自 PBMC 提取物的 VEGF-A 浓度显着相关。13 条染色体内的 20 个 CpG 位点达到 Holm-Bonferroni 意义。显着值范围从 P = 1.08 × 10−7 到 P = 5.64 × 10−15。该研究暴露了 20 个将 DNA 甲基化与 VEGF-A 浓度联系起来的重要 CpG 位点。在启动子区域（如 TPX2 和 HAS-1）中检测到的甲基化可以解释先前报道的与 VEGFA 基因的关联。甲基化还有助于了解位于检测到的 CpG 位点附近的其他基因的调控机制。表观基因组关联分析确定了 41 个甲基化位点与来自 PBMC 提取物的 VEGF-A 浓度显着相关。13 条染色体内的 20 个 CpG 位点达到 Holm-Bonferroni 意义。显着值范围从 P = 1.08 × 10−7 到 P = 5.64 × 10−15。该研究暴露了 20 个将 DNA 甲基化与 VEGF-A 浓度联系起来的重要 CpG 位点。在启动子区域（如 TPX2 和 HAS-1）中检测到的甲基化可以解释先前报道的与 VEGFA 基因的关联。甲基化还有助于了解位于检测到的 CpG 位点附近的其他基因的调控机制。表观基因组关联分析确定了 41 个甲基化位点与来自 PBMC 提取物的 VEGF-A 浓度显着相关。13 条染色体内的 20 个 CpG 位点达到 Holm-Bonferroni 意义。显着值范围从 P = 1.08 × 10−7 到 P = 5.64 × 10−15。该研究暴露了 20 个将 DNA 甲基化与 VEGF-A 浓度联系起来的重要 CpG 位点。在启动子区域（如 TPX2 和 HAS-1）中检测到的甲基化可以解释先前报道的与 VEGFA 基因的关联。甲基化还有助于了解位于检测到的 CpG 位点附近的其他基因的调控机制。13 条染色体内的 20 个 CpG 位点达到 Holm-Bonferroni 意义。显着值范围从 P = 1.08 × 10−7 到 P = 5.64 × 10−15。该研究暴露了 20 个将 DNA 甲基化与 VEGF-A 浓度联系起来的重要 CpG 位点。在启动子区域（如 TPX2 和 HAS-1）中检测到的甲基化可以解释先前报道的与 VEGFA 基因的关联。甲基化还有助于了解位于检测到的 CpG 位点附近的其他基因的调控机制。13 条染色体内的 20 个 CpG 位点达到 Holm-Bonferroni 意义。显着值范围从 P = 1.08 × 10−7 到 P = 5.64 × 10−15。该研究暴露了 20 个将 DNA 甲基化与 VEGF-A 浓度联系起来的重要 CpG 位点。在启动子区域（如 TPX2 和 HAS-1）中检测到的甲基化可以解释先前报道的与 VEGFA 基因的关联。甲基化还有助于了解位于检测到的 CpG 位点附近的其他基因的调控机制。