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Exome sequencing in 57 patients with self-limited focal epilepsies of childhood with typical or atypical presentations suggests novel candidate genes
European Journal of Paediatric Neurology ( IF 2.3 ) Pub Date : 2020-07-01 , DOI: 10.1016/j.ejpn.2020.05.003
Gabrielle Rudolf 1 , Julitta de Bellescize 2 , Anne de Saint Martin 3 , Alexis Arzimanoglou 2 , Maria Paola Valenti Hirsch 4 , Audrey Labalme 5 , Clotilde Boulay 1 , Thomas Simonet 6 , Anne Boland 7 , Jean François Deleuze 7 , Patrick Nitschké 8 , Emmanuelle Ollivier 8 , Damien Sanlaville 9 , Edouard Hirsch 1 , Jamel Chelly 10 , Gaetan Lesca 9
Affiliation  

OBJECTIVE Self-limited focal epilepsies of childhood (SFEC) are amongst the best defined and most frequent epilepsy syndromes affecting children with usually normal developmental milestones. They include core syndromes such as Rolandic epilepsy or "Benign" epilepsy with Centro-Temporal Spikes and the benign occipital epilepsies, the early onset Panayiotopoulos syndrome and the late-onset Gastaut type. Atypical forms exist for all of them. Atypical Rolandic epilepsies are conceptualized as belonging to a continuum reaching from the "benign" RE to the severe end of the Landau-Kleffner (LKS) and Continuous Spike-Waves during Sleep syndromes (CSWS). GRIN2A has been shown to cause the epilepsy-aphasia continuum that includes some patients with atypical Rolandic epilepsy with frequent speech disorders, LKS and CSWS. In the present study, we searched novel genes causing SFEC with typical or atypical presentations. METHODS Exome sequencing was performed in 57 trios. Patients presented with typical or atypical SFEC, negative for GRIN2A pathogenic variant. RESULTS We found rare candidate variants in 20 patients. Thirteen had occurred de novo and were mostly associated to atypical Rolandic Epilepsy. Two of them could be considered as disease related: a null variant in GRIN2B and a missense variant in CAMK2A. Others were considered good candidates, including a substitution affecting a splice site in CACNG2 and missense variants in genes encoding enzymes involved in chromatin remodeling. SIGNIFICANCE Our results further illustrate the fact that atypical SFEC are more likely to have Mendelian inheritance than typical SFEC.

中文翻译:

57 例具有典型或非典型表现的儿童自限性局灶性癫痫患者的外显子组测序提示新的候选基因

目的 儿童自限性局灶性癫痫 (SFEC) 是定义最明确和最常见的癫痫综合征之一,影响通常具有正常发育里程碑的儿童。它们包括核心综合征,如 Rolandic 癫痫或“良性”癫痫伴中央颞棘波和良性枕部癫痫、早发性 Panayiotopoulos 综合征和晚发性 Gastaut 型。所有这些都存在非典型形式。非典型 Rolandic 癫痫被概念化为属于从“良性”RE 到 Landau-Kleffner (LKS) 和睡眠综合征期间的连续尖峰波 (​​CSWS) 的严重端的连续体。GRIN2A 已被证明会导致癫痫-失语连续体,其中包括一些患有非典型 Rolandic 癫痫并伴有频繁言语障碍、LKS 和 CSWS 的患者。在本研究中,我们搜索了具有典型或非典型表现的导致 SFEC 的新基因。方法 外显子组测序在 57 个三人组中进行。患者表现为典型或非典型 SFEC,GRIN2A 致病性变异阴性。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。我们搜索了具有典型或非典型表现的导致 SFEC 的新基因。方法 外显子组测序在 57 个三人组中进行。患者表现为典型或非典型 SFEC,GRIN2A 致病性变异阴性。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。我们搜索了具有典型或非典型表现的导致 SFEC 的新基因。方法 外显子组测序在 57 个三人组中进行。患者表现为典型或非典型 SFEC,GRIN2A 致病性变异阴性。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。方法 外显子组测序在 57 个三人组中进行。患者表现为典型或非典型 SFEC,GRIN2A 致病性变异阴性。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。方法 外显子组测序在 57 个三人组中进行。患者表现为典型或非典型 SFEC,GRIN2A 致病性变异阴性。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。结果 我们在 20 名患者中发现了罕见的候选变异。13 例是新发的,大多与非典型 Rolandic 癫痫有关。其中两个可以被认为与疾病相关:GRIN2B 中的无效变异和 CAMK2A 中的错义变异。其他被认为是很好的候选者,包括影响 CACNG2 中剪接位点的替换和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。包括影响 CACNG2 中剪接位点的取代和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。包括影响 CACNG2 剪接位点的取代和编码参与染色质重塑的酶的基因中的错义变异。意义 我们的结果进一步说明了一个事实,即非典型 SFEC 比典型 SFEC 更可能具有孟德尔遗传。
更新日期:2020-07-01
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