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An Activated GOPS-poly-L-Lysine- Coated Glass Surface for the Immobilization of 60mer Oligonucleotides
Engineering in Life Sciences ( IF 2.7 ) Pub Date : 2005-10-01 , DOI: 10.1002/elsc.200520097
Q Wu 1 , W Ma 1 , R Shi 1 , B Zhang 1 , X Mao 1 , W Zheng 2
Affiliation  

To explore a method for enhancing the immobilization and hybridization efficiency of oligonucleotides on DNA microarrays, conventional protocols of poly‐L‐lysine coating were modified by means of surface chemistry, namely, the slides were prepared by the covalently coupling of poly‐L‐lysine to a glycidoxy‐modified glass surface. The modified slides were then used to print microarrays for the detection of the SARS coronavirus by means of 60mer oligonucleotide probes. The characteristics of the modified slides concerning immobilization efficiency, hybridization dynamics, and probe stripping cycles were determined. The improved surface exhibited high immobilization efficiency, a good quality uniformity, and satisfactory hybridization dynamics. The spotting concentration of 10 μmol/L can meet the requirements of detection; the spots were approximately 170 nm in diameter; the mean fluorescence intensity of the SARS spots were between 3.2 × 104 and 5.0 × 104 after hybridization. Furthermore, the microarrays prepared by this method demonstrated more resistance to consecutive probe stripping cycles. The activated GOPS‐PLL slide could undergo hybridization stripping cycles for at least three cycles, and the highest loss in fluorescence intensity was found to be only 11.9 % after the third hybridization. The modified slides using the above‐mentioned method were superior to those slides treated with conventional approaches, which theoretically agrees with the fact that modification by surface chemistry attaches the DNA covalently firmly to the slides. This protocol may have great promise in the future for application in large‐scale manufacture.

中文翻译:

用于固定 60 聚体寡核苷酸的活化 GOPS-聚-L-赖氨酸涂层玻璃表面

为了探索一种提高寡核苷酸在 DNA 微阵列上的固定化和杂交效率的方法,通过表面化学方法修改了聚 L-赖氨酸涂层的常规方案,即通过聚-L-赖氨酸的共价偶联制备载玻片到环氧丙氧基改性的玻璃表面。然后使用修改后的载玻片打印微阵列,通过 60 聚体寡核苷酸探针检测 SARS 冠状病毒。确定了关于固定效率、杂交动力学和探针剥离周期的改进载玻片的特征。改进后的表面表现出高固定效率、良好的质量均匀性和令人满意的杂交动力学。10 μmol/L的点样浓度即可满足检测要求;这些斑点的直径大约为 170 纳米;杂交后SARS斑点的平均荧光强度在3.2×104和5.0×104之间。此外,通过这种方法制备的微阵列表现出对连续探针剥离循环的更大抵抗力。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。杂交后SARS斑点的平均荧光强度在3.2×104和5.0×104之间。此外,通过这种方法制备的微阵列表现出对连续探针剥离循环的更大抵抗力。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。杂交后SARS斑点的平均荧光强度在3.2×104和5.0×104之间。此外,通过这种方法制备的微阵列表现出对连续探针剥离循环的更大抵抗力。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。0 × 104 杂交后。此外,通过这种方法制备的微阵列表现出对连续探针剥离循环的更大抵抗力。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。0 × 104 杂交后。此外,通过这种方法制备的微阵列表现出对连续探针剥离循环的更大抵抗力。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。激活的 GOPS-PLL 载玻片可以进行至少三个循环的杂交剥离循环,并且发现第三次杂交后荧光强度的最高损失仅为 11.9%。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。使用上述方法修饰的载玻片优于使用常规方法处理的载玻片,这在理论上与通过表面化学修饰将 DNA 共价牢固地连接到载玻片上的事实一致。该协议在未来在大规模制造中的应用可能具有很大的前景。
更新日期:2005-10-01
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