Any forms of valorization of microorganisms would require accurate identity recognition to ensure repeatability, reproducibility and quality assurance. This study aimed to evaluate the effectiveness of different primers for identifying cultured eukaryotic microalgae using a simple 18S rDNA approach. A total of 34 isolated microalgae and one culture collection were utilized in the search for an effective molecular identification method for microalgae. Ammonium formate was applied to marine microalgae prior to DNA extraction. The microalgal DNA was extracted using a commercial kit and subjected directly to PCR amplification using four different published 18S rDNA primers. The DNA sequences were analysed using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) and phylogenetic trees to determine the microalgae identity. The identity was further validated with conventional morphological taxonomic identification, and the relationship of microalgal morphology and genetic materials was also determined. The microalgal DNA was successfully amplified, including marine species without prior cleaning. In addition, the ss5 + ss3 primer pair was found to be an ideal primer set among the tested primers for identifying microalgae. Overall, molecular identification showed relative matching with morphological identification (82.86%). This study is important because it serves as a platform to develop a standardized eukaryotic microalgae identification method. In addition, this method could help to ease the eukaryotic microalgae identification process and enrich the current reference databases such as GenBank.

中文翻译：

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一种简单的18S rDNA方法，用于鉴定培养的真核微藻，重点是引物。

任何形式的微生物增值都需要准确的身份识别，以确保可重复性，可再现性和质量保证。这项研究旨在评估使用简单的18S rDNA方法鉴定不同引物对培养的真核微藻的有效性。总共使用34个分离的微藻和一个培养物收集物来寻找有效的微藻分子鉴定方法。在提取DNA之前，将甲酸铵施用于海洋微藻。使用商业试剂盒提取微藻DNA，并使用四种不同的已公开的18S rDNA引物直接进行PCR扩增。使用基本局部比对搜索工具（BLAST）和系统发育树分析了DNA序列，以确定微藻的身份。通过常规形态学分类学鉴定进一步验证了身份，并确定了微藻形态学与遗传物质的关系。无需事先清洁即可成功扩增微藻DNA，包括海洋物种。另外，发现在鉴定微藻的被测试引物中，ss5 + ss3引物对是理想的引物组。总体而言，分子鉴定与形态鉴定相对匹配（82.86％）。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。并确定了微藻形态与遗传物质的关系。无需事先清洁即可成功扩增微藻DNA，包括海洋物种。另外，发现在鉴定微藻的被测试引物中，ss5 + ss3引物对是理想的引物组。总体而言，分子鉴定与形态鉴定相对匹配（82.86％）。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。并确定了微藻形态与遗传物质的关系。无需事先清洁即可成功扩增微藻DNA，包括海洋物种。另外，发现在鉴定微藻的被测试引物中，ss5 + ss3引物对是理想的引物组。总体而言，分子鉴定与形态鉴定相对匹配（82.86％）。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。包括未经事先清洁的海洋物种。另外，发现在鉴定微藻的被测试引物中，ss5 + ss3引物对是理想的引物组。总体而言，分子鉴定与形态鉴定相对匹配（82.86％）。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。包括未经事先清洁的海洋物种。另外，发现在鉴定微藻的被测试引物中，ss5 + ss3引物对是理想的引物组。总体而言，分子鉴定与形态鉴定相对匹配（82.86％）。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。这项研究很重要，因为它可以作为开发标准化真核微藻鉴定方法的平台。另外，这种方法可以帮助简化真核微藻的鉴定过程，并丰富当前的参考数据库，如GenBank。