The genus Passiflora shows a large variation in chromosome numbers (2n = 12, 14, 18, 20, 22, 24, 36, 72) and in the distribution of ribosomal DNA (rDNA) sites. Most species of the subgenus Passiflora, however, have n = 9 and two pairs of 35S rDNA sites, such as species of economic importance Passiflora edulis and Passiflora alata. Species of another clade from the same subgenus, which includes Passiflora watsoniana, have three pairs of 35S rDNA sites. This karyotypic variability suggests a possible break in synteny within the subgenus Passiflora, but with maintenance of n = 9 in most species. To investigate synteny in three species of this subgenus, comparative cytogenetic mapping was performed in P. alata and P. watsoniana using BAC markers previously developed for P. edulis. In addition, the distribution of 35S and 5S rDNA sites and LTR retrotransposons Ty1-Copia and Ty3-Gypsy were investigated. The used single-copy BAC clones resulted in distinct dot-like signals exclusively in terminal or subterminal regions of the chromosomes. No synteny break with regard to the chromosomal distribution of these BACs or the rDNA sites could be detected, except for an additional 35S rDNA site on chromosome 3 of P. watsoniana. LTR elements showed proximal or uniformly dispersed patterns. The results revealed a similar distribution of BAC markers between species, preferably in the terminal regions, which is compatible with an increased accumulation of repetitive sequences preferentially in proximal regions of the chromosomes associated with an increase in genome size.

中文翻译：

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使用 BAC-FISH 的 Passiflora alata 和 P. watsoniana (Passifloraceae) 的比较细胞遗传图谱

西番莲属在染色体数目（2n = 12、14、18、20、22、24、36、72）和核糖体 DNA (rDNA) 位点的分布方面表现出很大的变化。然而，西番莲亚属的大多数物种具有 n = 9 和两对 35S rDNA 位点，例如具有重要经济意义的物种西番莲和西番莲。来自同一亚属的另一个进化枝的物种，包括 Passiflora watsoniana，具有三对 35S rDNA 位点。这种核型变异表明西番莲亚属内的同线性可能中断，但在大多数物种中保持 n = 9。为了研究该亚属的三个物种的同线性，使用先前为 P. edulis 开发的 BAC 标记在 P. alata 和 P. watsoniana 中进行了比较细胞遗传作图。此外，研究了 35S 和 5S rDNA 位点和 LTR 逆转录转座子 Ty1-Copia 和 Ty3-Gypsy 的分布。使用的单拷贝 BAC 克隆在染色体的末端或亚末端区域产生独特的点状信号。没有检测到这些 BAC 的染色体分布或 rDNA 位点的同线性断裂，除了 P. watoniana 3 号染色体上的额外 35S rDNA 位点。LTR 元素显示近端或均匀分散的模式。结果揭示了物种之间 BAC 标记的相似分布，优选在末端区域，这与优先在染色体近端区域中与基因组大小增加相关的重复序列的积累增加相容。使用的单拷贝 BAC 克隆在染色体的末端或亚末端区域产生独特的点状信号。没有检测到这些 BAC 的染色体分布或 rDNA 位点的同线性断裂，除了 P. watoniana 3 号染色体上的额外 35S rDNA 位点。LTR 元素显示近端或均匀分散的模式。结果揭示了物种之间 BAC 标记的相似分布，优选在末端区域，这与优先在染色体近端区域中与基因组大小增加相关的重复序列的积累增加相容。使用的单拷贝 BAC 克隆在染色体的末端或亚末端区域产生独特的点状信号。没有检测到这些 BAC 的染色体分布或 rDNA 位点的同线性断裂，除了 P. watoniana 3 号染色体上的额外 35S rDNA 位点。LTR 元素显示近端或均匀分散的模式。结果揭示了物种之间 BAC 标记的相似分布，优选在末端区域，这与优先在染色体近端区域中与基因组大小增加相关的重复序列的积累增加相容。没有检测到这些 BAC 的染色体分布或 rDNA 位点的同线性断裂，除了 P. watoniana 3 号染色体上的额外 35S rDNA 位点。LTR 元素显示近端或均匀分散的模式。结果揭示了物种之间 BAC 标记的相似分布，优选在末端区域，这与优先在染色体近端区域中与基因组大小增加相关的重复序列的积累增加相容。没有检测到这些 BAC 的染色体分布或 rDNA 位点的同线性断裂，除了 P. watoniana 3 号染色体上的额外 35S rDNA 位点。LTR 元素显示近端或均匀分散的模式。结果揭示了物种之间 BAC 标记的相似分布，优选在末端区域，这与优先在染色体近端区域中与基因组大小增加相关的重复序列的积累增加相容。