Clinical exome sequencing (CES) has become a routine diagnostic tool in several pediatric subspecialties, with a reported average diagnostic yield of ~25% in this patient poulation. The utility of CES in the United Arab Emirates (UAE) has not been previously investigated, most likely due to the lack of the appropriate tertiary pediatric centers and diagnostic genomic facilities in this country. Here, we report, for the first time, CES findings on a multispecialty pediatric cohort in the UAE (N = 51). This cohort, which was mostly Emirati (86%; 44/51), was followed at Al Jalila Children's Hospital (AJCH), the first and only dedicated tertiary pediatric center in the country. CES demonstrates a high diagnostic yield (41%; 21/51) in this cohort, where 55% (28/51) had previous non-diagnostic genetic testing while for the remaining individuals (45%), CES was the first-tier test. Given the reported high consanguinity rate in this population, 48% of the positive cases (10/21) were due to genes associated with recessive conditions. However, 11 out of 21 positive cases (52%) were due to heterozygous pathogenic variants in genes known to cause dominantly inherited disorders, including a case with a dual diagnosis attributed to two different genes (2%; 1/51), and another case with a novel de novo variant and new phenotypic features for a known gene (2%; 1/51). Overall, we have identified 13 novel clinically significant variants and showed that application of CES as a first-tier test plays a significant role in genetic diagnosis and management of Emirati pediatric patients.

中文翻译：

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临床外显子组测序在复杂的阿联酋儿科队列中的实用性。

临床外显子组测序（CES）已成为一些儿科亚科的常规诊断工具，据报道，该患者群的平均诊断产率约为25％。以前尚未对阿拉伯联合酋长国（UAE）中CES的用途进行过调查，这很可能是由于该国缺乏适当的三级儿科中心和诊断基因组设施。在这里，我们首次报告CES在阿联酋多学科儿科队列中的发现（N = 51）。该队列主要是阿联酋（86％; 44/51），随后是该国第一个也是唯一的专科儿科中心Al Jalila儿童医院（AJCH）。CES展示了该队列的高诊断率（41％; 21/51），其中55％（28/51）曾接受过非诊断性基因检测，而其余个体（45％）则是CES。鉴于据报道该人群的高血缘率，有48％的阳性病例（10/21）是由于与隐性疾病相关的基因引起的。但是，在21例阳性病例中，有11例（52％）是由于已知导致显性遗传性疾病的基因中的杂合致病变异，包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％; 1/51），另一个是具有新型从头变异和已知基因新表型特征的案例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。CES是第一级测试。鉴于据报道该人群的高血缘率，有48％的阳性病例（10/21）是由于与隐性疾病相关的基因引起的。但是，在21例阳性病例中，有11例（52％）是由于已知导致显性遗传性疾病的基因中的杂合致病变异，包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％; 1/51），另一个是具有新的从头变异和已知基因的新表型特征的案例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。CES是第一级测试。鉴于据报道该人群的高血缘率，有48％的阳性病例（10/21）是由于与隐性疾病相关的基因引起的。但是，在21例阳性病例中，有11例（52％）是由于已知导致显性遗传性疾病的基因中的杂合致病变异，包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％; 1/51），另一个是具有新型从头变异和已知基因新表型特征的案例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。阳性病例中有48％（10/21）是由于与隐性疾病相关的基因引起的。但是，在21例阳性病例中，有11例（52％）是由于已知导致显性遗传性疾病的基因中的杂合致病变异，包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％; 1/51），另一个具有新型从头变异和已知基因新表型特征的案例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。阳性病例中有48％（10/21）是由于与隐性疾病相关的基因引起的。但是，在21例阳性病例中，有11例（52％）是由于已知导致显性遗传性疾病的基因中的杂合致病变异，包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％; 1/51），另一个具有新的从头变异和已知基因的新表型特征的案例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％； 1/51），另一例具有新颖的从头变异体和已知基因的新表型特征的病例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。包括一例双重诊断归因于两个不同基因的病例（2％； 1/51），另一例具有新颖的从头变异体和已知基因的新表型特征的病例（2％； 1/51）。总体而言，我们已经鉴定出13种具有临床意义的新变异，并表明CES作为一线检测的应用在阿联酋儿科患者的基因诊断和管理中起着重要作用。