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How many species of angulate tortoises occur in Southern Africa? (Testudines: Testudinidae: Chersina )
Zoologica Scripta ( IF 2.3 ) Pub Date : 2020-04-20 , DOI: 10.1111/zsc.12418
Cäcilia Spitzweg 1 , Melita Vamberger 1 , Flora Ihlow 1 , Uwe Fritz 1 , Margaretha D. Hofmeyr 2
Affiliation  

Using range‐wide sampling and 1,143 bp of mtDNA (cytochrome b gene) and 14 microsatellite loci, we examined genetic differentiation in the widely distributed Southern African angulate tortoise (Chersina angulata). We found evidence for two genealogical lineages that differ in both genetic marker systems and their preferred habitat conditions. According to a fossil‐calibrated molecular clock for all African tortoise lineages using 1,870 bp mitochondrial and 1,416 bp nuclear DNA, the two lineages of C. angulata diverged in the Pliocene (approx. 3.8 million years ago). Species distribution models reveal that the ranges of the two lineages shifted little since the Last Glacial Maximum, which is in agreement with the demographic population descriptors suggestive of stationary populations that did not experience expansion. One lineage occurs in the west, and the other in the south of the extant distribution range. In the geographic contact zone, the two lineages hybridize extensively, providing evidence for their conspecificity under the biological species concept. Each lineage could be recognized as a distinct subspecies, but the ill‐defined geographic origins of the type material of the available names prevent their identification with any taxon. With respect to the nuclear genomic markers, the western lineage shows further north‐south substructuring. A few genetically mismatched tortoises are interpreted as human translocations. Our study underlines that confiscated or captive angulate tortoises of unknown geographic provenance should not be released without prior genetic screening to avoid genetic pollution of wild populations.

中文翻译:

南部非洲有多少种有角陆龟?(Testudines: Testudinidae: Chesina )

使用范围广泛的采样和 1,143 bp 的 mtDNA(细胞色素 b 基因)和 14 个微卫星位点,我们检查了广泛分布的南部非洲有角陆龟(Chersina angulata)的遗传分化。我们发现了两个谱系谱系的证据,它们在遗传标记系统及其首选栖息地条件上都不同。根据使用 1,870 bp 线粒体 DNA 和 1,416 bp 核 DNA 对所有非洲陆龟谱系进行化石校准的分子钟,C. angulata 的两个谱系在上新世(大约 380 万年前)出现分歧。物种分布模型显示,自末次盛冰期以来,这两个谱系的范围几乎没有变化,这与人口统计描述一致,表明没有经历扩张的静止种群。一个世系出现在西方,另一个在现存分布范围的南部。在地理接触区,两个谱系广泛杂交,为它们在生物物种概念下的同种性提供了证据。每个谱系都可以被识别为一个不同的亚种,但是可用名称类型材料的不明确地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。在地理接触区,两个谱系广泛杂交,为它们在生物物种概念下的同种性提供了证据。每个谱系都可以被识别为一个不同的亚种,但是可用名称类型材料的不明确地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。在地理接触区,两个谱系广泛杂交,为它们在生物物种概念下的同种性提供了证据。每个谱系都可以被识别为一个不同的亚种,但是可用名称类型材料的不明确地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。为它们在生物物种概念下的同种性提供证据。每个谱系都可以被识别为一个不同的亚种,但是可用名称类型材料的不明确地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。为它们在生物物种概念下的同种性提供证据。每个谱系都可以被识别为一个不同的亚种,但是可用名称类型材料的不明确地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。但是可用名称的类型材料的不明确的地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。但是可用名称的类型材料的不明确的地理起源阻止了它们与任何分类单元的识别。关于核基因组标记,西方谱系显示出进一步的南北亚结构。一些基因不匹配的陆龟被解释为人类易位。我们的研究强调,在没有事先进行基因筛查的情况下,不应释放被没收或圈养的未知地理来源的角龟,以避免对野生种群的基因污染。
更新日期:2020-04-20
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