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Development of a multiplex real-time PCR assay for the identification and quantification of group-specific Bacillus spp. and the genus Paenibacillus.
International Journal of Food Microbiology ( IF 5.4 ) Pub Date : 2020-03-14 , DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108573
Miyo Nakano 1
Affiliation  

Spoilage microorganisms can occur at many points throughout food production systems. Bacillus spp. and Paenibacillus spp. are important aerobic spoilage bacteria in various sectors of the food industry. In this study, we developed a rapid detection and quantification technique for Bacillus group-specific and the genus Paenibacillus by using multiplex quantitative PCR (mqPCR). The 1st was the Bacillus cereus group containing B. cereus and B. weihenstephanensis; the 2nd was the B. subtilis group containing B. subtilis, B. licheniformis, B. safensis, and B. pumilus; the 3rd was the B. simplex group containing B. megaterium and B. simplex; and the 4th was the genus Paenibacillus. Depending on the assays, the detection limit was 10 copy numbers. In addition, mqPCR assays were validated by spiking potato salad and milk samples with four strains; B. weihenstephanensis, B. licheniformis, B. megaterium, and P. lautus. The detection dynamic range for potato salad was 105 CFU/mL-101 CFU/mL with B. weihenstephanensis and B. licheniformis, and 105 CFU/mL-102 CFU/mL with B. megaterium and P. lautus, while, for milk, all strains were 105 CFU/mL-102 CFU/mL. We also stored these food matrices spiked with four bacterial suspensions (approximately 103 CFU/mL) at various temperatures. Results showed that B. weihenstephanensis and B. licheniformis were able to grow in potato salad, whereas, the populations of B. weihenstephanensis, B. licheniformis, and P. lautus increased in milk. Consequently, the mqPCR assays developed here in facilitated the differentiation, quantification, and confirmation of the presence of the psychrophilic and psychrotolerant Bacillus group and Paenibacillus spp.

中文翻译:

开发用于鉴定和定量组特异性芽孢杆菌属的多重实时PCR分析方法。和Paenibacillus属。

腐败微生物可以在整个食品生产系统的许多地方发生。芽孢杆菌 和Paenibacillus spp。是食品工业各个部门中重要的好氧腐败细菌。在这项研究中,我们通过使用多重定量PCR(mqPCR)开发了一种快速检测和定量技术,用于特定的芽孢杆菌群和Paenibacillus属。第一个是蜡状芽孢杆菌组,其中包含蜡状芽孢杆菌和魏亨斯蒂芬芽孢杆菌。第二个是枯草芽孢杆菌组,其中包含枯草芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌,安全芽孢杆菌和短小芽孢杆菌。第三个是含有巨大芽孢杆菌和单纯芽孢杆菌的单纯芽孢杆菌组。第四位是Paenibacillus属。取决于测定,检测极限是10个拷贝数。此外,mqPCR分析通过向马铃薯色拉和牛奶样品中添加4种菌株来验证;B.weihenstephanensis,地衣芽孢杆菌,巨大芽孢杆菌和月桂芽孢杆菌。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL。所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。地衣,巨大芽孢杆菌和月桂假单胞菌。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL。所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。地衣,巨大芽孢杆菌和月桂假单胞菌。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL,而牛奶中所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。劳特斯。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL,而牛奶中所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。劳特斯。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL。所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL。所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。魏氏史氏杆菌和地衣芽孢杆菌的马铃薯色拉的检测动态范围为105 CFU / mL-101 CFU / mL,巨型芽孢杆菌和月桂假单胞菌的马铃薯沙拉的检测动态范围为105 CFU / mL-102 CFU / mL。所有菌株均为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。牛奶中的所有菌株都为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,在马铃薯色拉中,魏芬斯德汉芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌均能够生长,而牛奶中的魏森斯德潘芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌和月桂果芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。牛奶中的所有菌株都为105 CFU / mL-102 CFU / mL。我们还在不同温度下存储了掺有四种细菌悬浮液(约103 CFU / mL)的这些食品基质。结果表明,马铃薯沙拉中可以生长魏氏史氏菌和地衣芽孢杆菌,而牛奶中的魏氏史氏菌,地衣芽孢杆菌和月桂芽孢杆菌的种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。马铃薯沙拉中可以生长weihenstephanensis和地衣芽孢杆菌,而牛奶中的weihenstephanensis,B。licheniformis和P. lautus种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。马铃薯沙拉中可以生长weihenstephanensis和地衣芽孢杆菌,而牛奶中的weihenstephanensis,B。licheniformis和P. lautus种群增加。因此,此处开发的mqPCR分析有助于区分,定量和确认嗜冷和耐精神芽孢杆菌组和Paenibacillus spp的存在。
更新日期:2020-03-16
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