The RNA Characterization of Secondary Structure Motifs, RNA CoSSMos, database is a freely accessible online database that allows users to identify secondary structure motifs among RNA 3D structures and explore their structural features. RNA CoSSMos 2.0 now requires two closing base pairs for all RNA loop motifs to create a less redundant database of secondary structures. Furthermore, RNA CoSSMos 2.0 represents an upgraded database with new features that summarize search findings and aid in the search for 3D structural patterns among RNA secondary structure motifs. Previously, users were limited to viewing search results individually, with no built-in tools to compare search results. RNA CoSSMos 2.0 provides two new features, allowing users to summarize, analyze and compare their search result findings. A function has been added to the website that calculates the average and representative structures of the search results. Additionally, users can now view a summary page of their search results that reports percentages of each structural feature found, including sugar pucker, glycosidic linkage, hydrogen bonding patterns and stacking interactions. Other upgrades include a newly embedded NGL structural viewer, the option to download the clipped structure coordinates in *.pdb format and improved NMR structure results. RNA CoSSMos 2.0 is no longer simply a search engine for a structure database; it now has the capability of analyzing, comparing and summarizing search results. Database URL: http://rnacossmos.com.

中文翻译：

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RNA CoSSMos 2.0：RNA三维结构中二级结构基序的改进的可搜索数据库。

二级结构基元的RNA表征RNA CoSSMos数据库是一个可免费访问的在线数据库，它使用户可以识别RNA 3D结构中的二级结构基序并探索其结构特征。现在，RNA CoSSMos 2.0需要为所有RNA环基序使用两个闭合碱基对，以创建较少冗余的二级结构数据库。此外，RNA CoSSMos 2.0代表了具有新功能的升级数据库，该功能总结了搜索结果并有助于在RNA二级结构基序中搜索3D结构模式。以前，用户仅限于单独查看搜索结果，而没有内置的工具可以比较搜索结果。RNA CoSSMos 2.0提供了两个新功能，允许用户总结，分析和比较搜索结果。网站上已添加了一项功能，用于计算搜索结果的平均值和代表性结构。此外，用户现在可以查看其搜索结果的摘要页面，其中报告了发现的每个结构特征的百分比，包括糖褶，糖苷键，氢键模式和堆积相互作用。其他升级包括新嵌入的NGL结构查看器，以* .pdb格式下载剪辑的结构坐标的选项以及改进的NMR结构结果。RNA CoSSMos 2.0不再仅仅是结构数据库的搜索引擎；现在，它具有分析，比较和汇总搜索结果的功能。数据库URL：http：//rnacossmos.com。用户现在可以查看其搜索结果的摘要页面，其中报告了发现的每个结构特征的百分比，包括糖褶，糖苷键，氢键模式和堆积相互作用。其他升级包括新嵌入的NGL结构查看器，以* .pdb格式下载剪辑的结构坐标的选项以及改进的NMR结构结果。RNA CoSSMos 2.0不再仅仅是结构数据库的搜索引擎；现在，它具有分析，比较和汇总搜索结果的功能。数据库URL：http：//rnacossmos.com。用户现在可以查看其搜索结果的摘要页面，其中报告了发现的每个结构特征的百分比，包括糖褶，糖苷键，氢键模式和堆积相互作用。其他升级包括新嵌入的NGL结构查看器，以* .pdb格式下载剪辑的结构坐标的选项以及改进的NMR结构结果。RNA CoSSMos 2.0不再仅仅是结构数据库的搜索引擎；现在，它具有分析，比较和汇总搜索结果的功能。数据库URL：http：//rnacossmos.com。可以下载* .pdb格式的裁剪后的结构坐标的选项，并改善了NMR结构的结果。RNA CoSSMos 2.0不再仅仅是结构数据库的搜索引擎；现在，它具有分析，比较和汇总搜索结果的功能。数据库URL：http：//rnacossmos.com。可以下载* .pdb格式的裁剪后的结构坐标的选项，并改善了NMR结构的结果。RNA CoSSMos 2.0不再仅仅是结构数据库的搜索引擎；现在，它具有分析，比较和汇总搜索结果的功能。数据库URL：http：//rnacossmos.com。