BACKGROUND There are limited data on potential dysbiosis of the airway microbiota in horses with asthma. HYPOTHESIS/OBJECTIVES We hypothesized that the respiratory microbiota of horses with moderate asthma is altered. Our objectives were (a) to quantify tracheal bacterial populations using culture and qPCR, (2) to compare aerobic culture and qPCR, and (c) to correlate bacterial populations with bronchoalveolar lavage fluid (BALF) cytology. ANIMALS Eighteen horses with moderate asthma from a hospital population and 10 controls. METHODS Prospective case-control study. Aerobic culture was performed on tracheal aspirates, and streptococci, Pasteurella multocida, Chlamydophila spp., Mycoplasma spp., as well as 16S (bacterial) and 18S (fungal) rRNA subunits were quantified by qPCR. RESULTS Potential pathogens such as Streptococcus spp., Actinobacillus spp., and Pasteurellaceae were isolated from 8, 5, and 6 horses with asthma and 3, 0, and 2 controls, respectively. There was a positive correlation between Streptococcus spp. DNA and 16S rRNA gene (r ≥ 0.7, P ≤ 0.02 in both groups), but the overall bacterial load (16S) was lower in asthma (1.5 ± 1.3 versus 2.5 ± 0.8 × 104 copy/μL, P < 0.05). There was no association between microbial populations and clinical signs, tracheal mucus or BALF inflammation. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPORTANCE This study does not support that bacterial overgrowth is a common feature of chronic moderate asthma in horses. Lower bacterial load could suggest dysbiosis of the lower airways, either as a consequence of chronic inflammation or previous treatments, or as a perpetuating factor of inflammation.

中文翻译：

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中度哮喘马的气管微生物种群。

背景技术关于患有哮喘的马中气道微生物群的潜在营养不良的数据有限。假设/目的我们假设患有中度哮喘的马的呼吸菌群发生了变化。我们的目标是（a）使用培养和qPCR定量气管细菌种群，（2）比较有氧培养和qPCR，（c）将细菌种群与支气管肺泡灌洗液（BALF）细胞学相关联。动物18匹来自医院人群的中度哮喘马和10例对照。方法前瞻性病例对照研究。对气管吸出物进行有氧培养，并通过qPCR定量测定链球菌，多杀巴斯德氏菌，嗜衣藻，支原体以及16S（细菌）和18S（真菌）rRNA亚基。结果潜在的病原体，例如链球菌，分别从8、5和6匹患有哮喘的马和3、0和2匹对照中分离出放线菌和巴斯德杆菌科。链球菌属之间有正相关。DNA和16S rRNA基因（两组均r≥0.7，P≤0.02），但哮喘患者的总细菌负荷（16S）较低（1.5±1.3对2.5±0.8×104复制/μL，P <0.05）。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。和6匹患有哮喘的马，分别为3、0和2个对照。链球菌属之间有正相关。DNA和16S rRNA基因（两组均r≥0.7，P≤0.02），但哮喘患者的总细菌负荷（16S）较低（1.5±1.3对2.5±0.8×104复制/μL，P <0.05）。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。和6匹患有哮喘的马，分别为3、0和2个对照。链球菌属之间有正相关。DNA和16S rRNA基因（两组均r≥0.7，P≤0.02），但哮喘患者的总细菌负荷（16S）较低（1.5±1.3对2.5±0.8×104复制/μL，P <0.05）。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。链球菌属之间有正相关。DNA和16S rRNA基因（两组均r≥0.7，P≤0.02），但哮喘患者的总细菌负荷（16S）较低（1.5±1.3对2.5±0.8×104复制/μL，P <0.05）。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。链球菌属之间有正相关。DNA和16S rRNA基因（两组均r≥0.7，P≤0.02），但哮喘患者的总细菌负荷（16S）较低（1.5±1.3对2.5±0.8×104复制/μL，P <0.05）。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。微生物种群与临床体征，气管粘液或BALF炎症之间没有关联。结论和临床意义本研究不支持细菌过度生长是马慢性中度哮喘的普遍特征。较低的细菌载量可能表明下呼吸道营养不良，这是慢性炎症或先前治疗的结果，或者是炎症的永久性因素。