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Fossil Calibration of Mitochondrial Phylogenetic Relationships of North American Pine Martens, Martes, Suggests an Older Divergence of M. americana and M. caurina than Previously Hypothesized
Journal of Mammalian Evolution ( IF 1.9 ) Pub Date : 2019-07-02 , DOI: 10.1007/s10914-019-09476-7
Leigha M. Lynch

As molecularly derived phylogenies have become more prominent in determining evolutionary relationships, researchers have developed multiple methods of time-calibration to estimate ages of speciation or dispersal events. These methods, however, do not always arrive at congruent node ages. Fossil evidence is one of the most common forms of calibration for phylogenies, but age estimates can vary greatly depending on fossil choice, the taxa in question, and methodologies chosen. Using the North American pine martens, Martes americana and M. caurina , as exemplar taxa, previously calculated divergence dates derived from mutation rates and dates estimated using fossil-informed time-calibration are compared. Two fossil calibrated Bayesian phylogenies are generated: one constructed from cytochrome b; and another from a concatenated sequence matrix of 12S, 16S, cytochrome b, and Dloop. Both phylogenies are calibrated based on the fossil record of Martes at three nodes: divergence between ingroup and outgroup clades; node for crown M. americana; and node for crown M. caurina. Both phylogenies support the presence of two clades within Martes and estimate these clades, and thus species, diverged between 540 kya and 234 kya. This is approximately 200,000 years older than divergence ages calculated from mutation rates. The older dates generated here place Martes divergence within the Pre-Illinoan glacial episode instead of the younger Wisconsin glaciation as was previously hypothesized. The results of this study suggest that this clade likely evolved under the climatic influence of multiple glacial cycles throughout the Pleistocene.

中文翻译:

北美松貂线粒体系统发育关系的化石校准,Martes,表明 M. americana 和 M. caurina 的分歧比以前假设的要早

随着分子衍生的系统发育在确定进化关系方面变得更加突出,研究人员开发了多种时间校准方法来估计物种形成或扩散事件的年龄。然而,这些方法并不总是达到一致的节点年龄。化石证据是最常见的系统发育校准形式之一,但年龄估计可能因化石选择、所讨论的分类群和选择的方法而有很大差异。使用北美松貂、Martes americana 和M. caurina 作为示例分类群,比较先前从突变率得出的分歧日期和使用化石信息时间校准估计的日期。生成了两种化石校准的贝叶斯系统发育:一种由细胞色素 b 构建;另一个来自 12S 的级联序列矩阵,16S、细胞色素 b 和 Dloop。两种系统发育都基于 Martes 在三个节点的化石记录进行校准:内群和外群进化枝之间的分歧;冠 M. americana 的节点;和冠 M. caurina 的节点。两种系统发育都支持 Martes 中存在两个进化枝,并估计这些进化枝和物种在 540 kya 和 234 kya 之间存在分歧。这比根据突变率计算的分歧年龄大约早 200,000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。两种系统发育都基于 Martes 在三个节点的化石记录进行校准:内群和外群进化枝之间的分歧;冠 M. americana 的节点;和冠 M. caurina 的节点。两种系统发育都支持 Martes 中存在两个进化枝,并估计这些进化枝和物种在 540 kya 和 234 kya 之间存在分歧。这比根据突变率计算的分歧年龄大约早 200,000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。两种系统发育都基于 Martes 在三个节点的化石记录进行校准:内群和外群进化枝之间的分歧;冠 M. americana 的节点;和冠 M. caurina 的节点。两种系统发育都支持 Martes 中存在两个进化枝,并估计这些进化枝和物种在 540 kya 和 234 kya 之间存在分歧。这比根据突变率计算的分歧年龄大约早 200,000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。冠 M. americana 的节点;和冠 M. caurina 的节点。两种系统发育都支持 Martes 中存在两个进化枝,并估计这些进化枝和物种在 540 kya 和 234 kya 之间存在分歧。这比根据突变率计算的分歧年龄大约早 200,000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。冠 M. americana 的节点;和冠 M. caurina 的节点。两种系统发育都支持 Martes 中存在两个进化枝,并估计这些进化枝和物种在 540 kya 和 234 kya 之间存在分歧。这比根据突变率计算的分歧年龄大约早 200,000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。比根据突变率计算的分歧年龄早 000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。比根据突变率计算的分歧年龄早 000 年。此处生成的较旧日期将 Martes 分歧置于前伊利诺斯冰期事件中,而不是先前假设的较年轻的威斯康星冰期。这项研究的结果表明,这个进化枝可能是在整个更新世多个冰川周期的气候影响下进化而来的。
更新日期:2019-07-02
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