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An Alu Element Insertion in Intron 1 Results in Aberrant Alternative Splicing of APOBEC3G Pre-mRNA in Northern Pig-Tailed Macaques (Macaca leonina) That May Reduce APOBEC3G-Mediated Hypermutation Pressure on HIV-1.
Journal of Virology ( IF 5.4 ) Pub Date : 2020-01-31 , DOI: 10.1128/jvi.01722-19
Xiao-Liang Zhang 1, 2 , Meng-Ting Luo 1, 3 , Jia-Hao Song 1, 4 , Wei Pang 1 , Yong-Tang Zheng 3, 5
Affiliation  

APOBEC3 family members, particularly APOBEC3F and APOBEC3G, inhibit the replication and spread of various retroviruses by inducing hypermutation in newly synthesized viral DNA. Viral hypermutation by APOBEC3 is associated with viral evolution, viral transmission, and disease progression. In recent years, increasing attention has been paid to targeting APOBEC3G for AIDS therapy. Thus, a controllable model system using species such as macaques, which provide a relatively ideal in vivo system, is needed for the study of APOBEC3-related issues. To appropriately utilize this animal model for biomedical research, important differences between human and macaque APOBEC3s must be considered. In this study, we found that the ratio of APOBEC3G-mediated/APOBEC3-mediated HIV-1 hypermutation footprints was much lower in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from northern pig-tailed macaques than in PBMCs from humans. Next, we identified a novel and conserved APOBEC3G pre-mRNA alternative splicing pattern in macaques, which differed from that in humans and resulted from an Alu element insertion into macaque APOBEC3G gene intron 1. This alternative splicing pattern generating an aberrant APOBEC3G mRNA isoform may significantly dilute full-length APOBEC3G and reduce APOBEC3G-mediated hypermutation pressure on HIV-1 in northern pig-tailed macaques, which was supported by the elimination of other possibilities accounting for this hypermutation difference between the two hosts.IMPORTANCE APOBEC3 family members, particularly APOBEC3F and APOBEC3G, are important cellular antiviral factors. Recently, more attention has been paid to targeting APOBEC3G for AIDS therapy. To appropriately utilize macaque animal models for the study of APOBEC3-related issues, it is important that the differences between human and macaque APOBEC3s are clarified. In this study, we identified a novel and conserved APOBEC3G pre-mRNA alternative splicing pattern in macaques, which differed from that in humans and which may reduce the APOBEC3G-mediated hypermutation pressure on HIV-1 in northern pig-tailed macaques (NPMs). Our work provides important information for the proper application of macaque animal models for APOBEC3-related issues in AIDS research and a better understanding of the biological functions of APOBEC3 proteins.

中文翻译:

在内含子1中插入Alu元素会导致北猪尾猕猴(Macaca leonina)的APOBEC3G Pre-mRNA异常剪接,这可能会降低APOBEC3G介导的HIV-1的超变压力。

APOBEC3家族成员,特别是APOBEC3F和APOBEC3G,通过在新合成的病毒DNA中诱导超突变来抑制各种逆转录病毒的复制和传播。APOBEC3引起的病毒超突变与病毒进化,病毒传播和疾病进展有关。近年来,针对APOBEC3G的艾滋病治疗越来越受到关注。因此,研究与APOBEC3相关的问题需要使用可控制的模型系统,例如猕猴,它们可提供相对理想的体内系统。为了将这种动物模型适当地用于生物医学研究,必须考虑人类和猕猴APOBEC3之间的重要差异。在这个研究中,我们发现,北部猪尾猕猴的外周血单核细胞(PBMC)中APOBEC3G介导的/ APOBEC3介导的HIV-1高突变足迹的比率比人类的PBMC低得多。接下来,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该模式与人类不同,并且是由于Alu元素插入猕猴APOBEC3G基因内含子1而产生的。这种替代剪接模式可能会产生异常的APOBEC3G mRNA同工型稀释全长APOBEC3G并降低APOBEC3G介导的北部猪尾猕猴对HIV-1的超变压力,这是由于消除了其他两种可能性的支持,从而消除了两个宿主之间的这种超变差异。重要APOBEC3家族成员,特别是APOBEC3F和APOBEC3G,是重要的细胞抗病毒因子。近来,已将更多注意力集中在针对APOBEC3G的AIDS治疗上。为了适当地使用猕猴动物模型来研究APOBEC3相关问题,弄清人类和猕猴APOBEC3之间的差异非常重要。在这项研究中,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该剪接模式与人类不同,并且可以降低APOBEC3G介导的北猪尾猕猴(HIV)上HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。已经将更多注意力集中在针对APOBEC3G的艾滋病治疗上。为了适当地使用猕猴动物模型来研究APOBEC3相关问题,弄清人类和猕猴APOBEC3之间的差异非常重要。在这项研究中,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该剪接模式与人类不同,并且可以降低APOBEC3G介导的北猪尾猕猴(HIV)上HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。已经将更多注意力集中在针对APOBEC3G的艾滋病治疗上。为了适当地使用猕猴动物模型来研究APOBEC3相关问题,弄清人类和猕猴APOBEC3之间的差异非常重要。在这项研究中,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该剪接模式与人类不同,并且可以降低APOBEC3G介导的北猪尾猕猴(HIV)上HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。弄清人类和猕猴APOBEC3之间的差异非常重要。在这项研究中,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该剪接模式与人类不同,并且可以降低APOBEC3G介导的北猪尾猕猴(HIV)上HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。弄清人类和猕猴APOBEC3之间的差异非常重要。在这项研究中,我们在猕猴中鉴定了一种新颖且保守的APOBEC3G pre-mRNA替代剪接模式,该剪接模式与人类不同,并且可以降低APOBEC3G介导的北猪尾猕猴(HIV)上HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。不同于人类,它可能会降低APOBEC3G介导的北部猪尾猕猴(NPM)对HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。不同于人类,它可能会降低APOBEC3G介导的北部猪尾猕猴(NPM)对HIV-1的超变压力。我们的工作为在猕猴动物模型中正确应用APOBEC3相关问题提供了重要信息,并为人们更好地理解APOBEC3蛋白的生物学功能提供了重要信息。
更新日期:2019-11-01
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