We investigated the gut microbiota of rabbit fish larvae at three locations in Vietnam (ThuanAn-northern, QuangNam-intermediate, BinhDinh-southern sampling site) over a three-year period. In the wild, the first food for rabbit fish larvae remains unknown, while the juveniles and adults are herbivores, forming schools near the coasts, lagoons, and river mouths, and feeding mainly on filamentous algae. This is the first study on the gut microbiota of the wild fish larvae and with a large number of individuals analyzed spatially and temporally. The Clostridiales order was the most predominant in the gut, and location-by-location alpha diversity showed significant differences in Chao-1, Hill number 1, and evenness. Analysis of beta diversity indicated that the location, not year, had an effect on the composition of the microbiota. In 2014, the gut microbiota of fish from QuangNam was different from that in BinhDinh; in 2015, the gut microbiota was different for all locations; and, in 2016, the gut microbiota in ThuanAn was different from that in the other locations. There was a time-dependent trend in the north-south axis for the gut microbiota, which is considered to be tentative awaiting larger datasets. We found limited variation in the gut microbiota geographically and in time and strong indications for a core microbiome. Five and fifteen OTUs were found in 100 and 99% of the individuals, respectively. This suggests that at this life stage the gut microbiota is under strong selection due to a combination of fish-microbe and microbe-microbe interactions.

中文翻译：

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迁徙野生兔鱼（Siganus guttatus）幼虫的肠道菌群具有较低的时空变异性。

我们在三年中调查了越南三个地方（顺安-北，广南中枢，平定-南采样点）兔子鱼幼虫的肠道菌群。在野外，兔子鱼幼虫的第一种食物仍然是未知的，而少年和成年动物是草食动物，在海岸，泻湖和河口附近形成了学校，主要以丝状藻类为食。这是首次关于野生鱼幼虫肠道菌群的研究，并且对大量个体进行了时空分析。梭状芽胞杆菌是肠道中最主要的菌种，并且不同位置的α多样性在Chao-1，Hill number 1和均匀度方面显示出显着差异。对β多样性的分析表明，位置而不是年份对微生物群的组成有影响。在2014年，QuangNam的鱼的肠道菌群与BinhDinh的不同。2015年，所有地区的肠道菌群都不同。并且在2016年，安川的肠道菌群不同于其他地区。肠道菌群在南北轴上呈时间依赖性趋势，被认为是暂时的，等待更大的数据集。我们发现肠道菌群的地理和时间变化有限，并且是核心微生物组的重要标志。在100％和99％的个体中分别发现了5个和15个OTU。这表明由于鱼-微生物和微生物-微生物相互作用的结合，在此生命阶段肠道菌群处于强烈选择之下。并且在2016年，安川的肠道菌群不同于其他地区。肠道菌群的南北轴呈时间依赖性，被认为是暂时的，等待更大的数据集。我们发现肠道菌群的地理和时间变化有限，并且是核心微生物组的重要标志。在100％和99％的个体中分别发现了5个和15个OTU。这表明由于鱼-微生物和微生物-微生物相互作用的结合，在此生命阶段肠道菌群处于强烈选择之下。并且在2016年，安川的肠道菌群不同于其他地区。肠道菌群的南北轴呈时间依赖性，被认为是暂时的，等待更大的数据集。我们发现肠道菌群在地理上和时间上的变化有限，并且是核心微生物组的强烈指示。在100％和99％的个体中分别发现了5个和15个OTU。这表明由于鱼-微生物和微生物-微生物相互作用的结合，在此生命阶段肠道菌群处于强烈选择之下。我们发现肠道菌群的地理和时间变化有限，并且是核心微生物组的重要标志。在100％和99％的个体中分别发现了5个和15个OTU。这表明由于鱼-微生物和微生物-微生物相互作用的结合，在此生命阶段肠道菌群处于强烈选择之下。我们发现肠道菌群的地理和时间变化有限，并且是核心微生物组的重要标志。在100％和99％的个体中分别发现了5个和15个OTU。这表明由于鱼-微生物和微生物-微生物相互作用的结合，在此生命阶段肠道菌群处于强烈选择之下。