The DNA/RNA-binding KIN protein was discovered in 1989, and since then, it has been found to participate in several processes, e.g., as a transcription factor in bacteria, yeasts, and plants, in immunoglobulin isotype switching, and in the repair and resolution of double-strand breaks caused by ionizing radiation. However, the complete three-dimensional structure and biophysical properties of KIN remain important information for clarifying its function and to help elucidate mechanisms associated with it not yet completely understood. The present study provides data on phylogenetic analyses of the different domains, as well as a biophysical characterization of the human KIN protein (HSAKIN) using bioinformatics techniques, circular dichroism spectroscopy, and differential scanning calorimetry to estimate the composition of secondary structure elements; further studies were performed to determine the biophysical parameters ΔHm and Tm. The phylogenetic analysis indicated that the zinc-finger and winged helix domains are highly conserved in KIN, with mean identity of 90.37% and 65.36%, respectively. The KOW motif was conserved only among the higher eukaryotes, indicating that this motif emerged later on the evolutionary timescale. HSAKIN has more than 50% of its secondary structure composed by random coil and β-turns. The highest values of ΔHm and Tm were found at pH 7.4 suggesting a stable structure at physiological conditions. The characteristics found for HSAKIN are primarily due to its relatively low composition of α-helices and β-strands, making up less than half of the protein structure.

中文翻译：

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人KIN蛋白的生物物理表征和分子系统发育。

结合DNA / RNA的KIN蛋白于1989年被发现，此后，它被发现参与多种过程，例如，作为细菌，酵母和植物中的转录因子，免疫球蛋白同种型转换和修复过程。和电离辐射引起的双链断裂的分离。但是，KIN的完整三维结构和生物物理特性仍然是重要信息，有助于阐明其功能并帮助阐明与之相关的机制，但尚未完全了解。本研究提供了有关不同域的系统发育分析数据，以及使用生物信息学技术，圆二色性光谱学，人KIN蛋白（HSAKIN）的生物物理表征，差示扫描量热法估算二级结构元素的组成；进行了进一步的研究以确定生物物理参数ΔHm和Tm。系统发育分析表明，锌指和翼状螺旋结构域在KIN中高度保守，平均同一性分别为90.37％和65.36％。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构中有50％以上由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要是由于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。进行了进一步的研究以确定生物物理参数ΔHm和Tm。系统发育分析表明，锌指和翼状螺旋结构域在KIN中高度保守，平均同一性分别为90.37％和65.36％。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构超过50％由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要是由于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。进行了进一步的研究以确定生物物理参数ΔHm和Tm。系统发育分析表明，锌指和翼状螺旋结构域在KIN中高度保守，平均同一性分别为90.37％和65.36％。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构超过50％由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要是由于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。系统发育分析表明，锌指和翼状螺旋结构域在KIN中高度保守，平均同一性分别为90.37％和65.36％。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构超过50％由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要是由于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。系统发育分析表明，锌指和翼状螺旋结构域在KIN中高度保守，平均同一性分别为90.37％和65.36％。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构中有50％以上由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要归因于其相对较低的α螺旋和β链组成，仅占不到蛋白质结构的一半。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上出现得较晚。HSAKIN的二级结构超过50％由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要是由于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。KOW主题仅在高级真核生物中保守，表明该主题在进化时间尺度上较晚出现。HSAKIN的二级结构超过50％由随机线圈和β匝组成。在pH 7.4时发现ΔHm和Tm最高，表明在生理条件下结构稳定。HSAKIN的特征主要归因于其相对较低的α螺旋和β链组成，不到蛋白质结构的一半。