BACKGROUND We aimed to analyze for the first time in Morocco the integrase (IN) sequence variability among highly experienced HIV-1-infected patients with no prior IN strand transfer inhibitor (INSTI) exposure who failed on reverse transcriptase inhibitors and protease inhibitors. METHODS The HIV-1 IN region was sequenced from plasma samples of all 78 recruited patients. The amino acid IN sequences were HIV-1 subtyped and screened for the presence of polymorphisms against the HxB2 clade B consensus sequence by the geno2pheno subtyping tool and interpreted for drug resistance according to the Stanford algorithm. RESULTS The viral subtypes were subtype B (88.4%), CRF02_AG (8.9%), CRF01_AE (1.28%), and subtype C (1.28%). The major INSTI resistance mutations at positions 66, 92, 118, 138, 140, 143, 147, 148, 155, and 263 were absent, while two accessory mutations, L74M/I, known to have no clinical impact to INSTIs in the absence of the major resistance mutations, were detected in three samples (3.84%; two CRF02_AG and one CRF01_AE). Others specific substitutions with an uncertain role on the HIV-1 susceptibility to INSTIs at positions 72, 101, 119, 124, 156, 165, 193, 201, 203, 206, 230, 232, and 249 were found to be relatively common. CONCLUSION This study demonstrated that INSTIs should be an excellent alternative for salvage therapy in highly experienced patients with multidrug resistant viruses in Morocco.

中文翻译：

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来自摩洛哥的高抗逆转录病毒经验丰富患者中的HIV-1整合抗性。

背景我们旨在首次在摩洛哥分析在没有逆转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂失败的，以前没有IN链转移抑制剂（INSTI）暴露的经验丰富的HIV-1感染患者中的整合酶（IN）序列变异性。方法从所有78名新招募患者的血浆样本中对HIV-1 IN区域进行测序。对氨基酸IN序列进行HIV-1亚型分析，并通过geno2pheno亚型分析工具针对HxB2进化枝B共有序列进行多态性筛选，并根据Stanford算法解释其耐药性。结果病毒亚型为B亚型（88.4％），CRF02_AG（8.9％），CRF01_AE（1.28％）和C亚型（1.28％）。在66、92、118、138、140、143、147、148、155和263位没有主要的INSTI抗性突变，在三个样本中（3.84％；两个CRF02_AG和一个CRF01_AE）检测到两个辅助突变L74M / I，在没有主要抗药性突变的情况下对INSTIs没有临床影响。已发现在位置72、101、119、124、156、165、193、201、203、206、230、232和249的HIV-1对INSTI易感性方面不确定的其他特定替代是相对常见的。结论这项研究表明，对于摩洛哥经验丰富的多药耐药性病毒患者，INSITs应该是挽救疗法的极佳替代品。已发现在位置72、101、119、124、156、165、193、201、203、206、230、232和249的HIV-1对INSTI易感性方面不确定的其他特定替代是相对常见的。结论这项研究表明，对于摩洛哥经验丰富的多药耐药性病毒患者，INSITs应该是挽救疗法的极佳替代品。已发现在位置72、101、119、124、156、165、193、201、203、206、230、232和249的HIV-1对INSTI易感性方面不确定的其他特定替代是相对常见的。结论这项研究表明，对于摩洛哥经验丰富的多药耐药性病毒患者，INSITs应该是挽救疗法的极佳替代品。