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Functional metagenomics: a tool to gain knowledge for agronomic and veterinary sciences.
Biotechnology and Genetic Engineering Reviews ( IF 3.2 ) Pub Date : 2018-09-17 , DOI: 10.1080/02648725.2018.1513230
Francisco Vargas-Albores 1 , Luis R Martínez-Córdova 2 , Marcel Martínez-Porchas 1 , Kadiya Calderón 2 , Asunción Lago-Lestón 3
Affiliation  

The increased global demand for food production has motivated agroindustries to increase their own levels of production. Scientific efforts have contributed to improving these production systems, aiding to solve problems and establishing novel conceptual views and sustainable alternatives to cope with the increasing demand. Although microorganisms are key players in biological systems and may drive certain desired responses toward food production, little is known about the microbial communities that constitute the microbiomes associated with agricultural and veterinary activities. Understanding the diversity, structure and in situ interactions of microbes, together with how these interactions occur within microbial communities and with respect to their environments (including hosts), constitutes a major challenge with an enormous relevance for agriculture and biotechnology. The emergence of high-throughput sequencing technologies, together with novel and more accessible bioinformatics tools, has allowed researchers to learn more about the functional potential and functional activity of these microbial communities. These tools constitute a relevant approach for understanding the metabolic processes that can occur or are currently occurring in a given system and for implementing novel strategies focused on solving production problems or improving sustainability. Several 'omics' sciences and their applications in agriculture are discussed in this review, and the usage of functional metagenomics is proposed to achieve substantial advances for food agroindustries and veterinary sciences.

中文翻译:

功能宏基因组学:一种获得农艺学和兽医学知识的工具。

全球对粮食生产的需求增加,促使农业工业增加了自己的生产水平。科学的努力为改善这些生产系统做出了贡献,有助于解决问题并建立新颖的概念性观点和可持续的替代方案,以应对不断增长的需求。尽管微生物是生物系统中的关键角色,并可能推动某些期望的食品生产响应,但人们对构成与农业和兽医活动相关的微生物群落的微生物群落了解甚少。了解微生物的多样性,结构和原位相互作用,以及这些相互作用如何在微生物群落内部以及相对于其环境(包括宿主)发生,构成一项重大挑战,与农业和生物技术息息相关。高通量测序技术的出现,以及新颖且更易获得的生物信息学工具,使研究人员能够更多地了解这些微生物群落的功能潜力和功能活性。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以实现食品农业和兽医学的实质性进步。高通量测序技术的出现,以及新颖且更易获得的生物信息学工具,使研究人员能够更多地了解这些微生物群落的功能潜力和功能活性。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以实现食品农业和兽医学的实质性进步。高通量测序技术的出现,以及新颖且更易获得的生物信息学工具,使研究人员能够更多地了解这些微生物群落的功能潜力和功能活性。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以使食品农业和兽医学取得实质性进展。已经使研究人员能够更多地了解这些微生物群落的功能潜力和功能活性。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以实现食品农业和兽医学的实质性进步。已经使研究人员能够更多地了解这些微生物群落的功能潜力和功能活性。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以使食品农业和兽医学取得实质性进展。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以使食品农业和兽医学取得实质性进展。这些工具构成了一种相关方法,用于了解给定系统中可能发生或当前正在发生的代谢过程,以及实施旨在解决生产问题或改善可持续性的新颖策略。这篇综述讨论了几种“组学”科学及其在农业中的应用,并提出了使用功能宏基因组学的方法,以使食品农业和兽医学取得实质性进展。
更新日期:2020-03-07
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