Noncoding RNA plays an important role in all aspects of the cellular life cycle, from the very basic process of protein synthesis to specialized roles in cell development and differentiation. However, many noncoding RNAs remain uncharacterized and the function of most of them remains unknown. Mid-size noncoding RNAs (mncRNAs), which range in length from 50 to 400 nucleotides, have diverse regulatory functions but share many fundamental characteristics. Most mncRNAs are produced from independent promoters although others are produced from the introns of other genes. Many are found in multiple copies in genomes. mncRNAs are highly structured and carry many posttranscriptional modifications. Both of these facets dictate their RNA-binding protein partners and ultimately their function. mncRNAs have already been implicated in translation, catalysis, as guides for RNA modification, as spliceosome components and regulatory RNA. However, recent studies are adding new mncRNA functions including regulation of gene expression and alternative splicing. In this review, we describe the different classes, characteristics and emerging functions of mncRNAs and their relative expression patterns. Finally, we provide a portrait of the challenges facing their detection and annotation in databases. This article is categorized under: Regulatory RNAs/RNAi/Riboswitches > Regulatory RNAs RNA Structure and Dynamics > RNA Structure, Dynamics, and Chemistry RNA Structure and Dynamics > Influence of RNA Structure in Biological Systems RNA Evolution and Genomics > RNA and Ribonucleoprotein Evolution.

中文翻译：

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中型非编码RNA的细胞景观。

从蛋白质合成的最基本过程到细胞发育和分化中的特殊作用，非编码RNA在细胞生命周期的各个方面都发挥着重要作用。但是，许多非编码RNA仍未鉴定，其中大多数功能仍然未知。中型非编码RNA（mncRNA）的长度在50到400个核苷酸之间，具有多种调节功能，但具有许多基本特征。大多数mncRNA由独立的启动子产生，而其他mncRNA由其他基因的内含子产生。在基因组中有多个副本。mncRNA具有高度结构，并带有许多转录后修饰。这两个方面都决定了它们的RNA结合蛋白伴侣，并最终决定了它们的功能。mncRNA已经涉及翻译，催化，作为RNA修饰的指南，剪接体成分和调节性RNA。但是，最近的研究增加了新的mncRNA功能，包括基因表达的调控和选择性剪接。在这篇综述中，我们描述了mncRNA的不同类别，特征和新兴功能及其相对表达模式。最后，我们提供了在数据库中检测和注释面临的挑战的画像。本文的分类为：调节RNA / RNAi /核糖开关>调节RNA的RNA结构和动力学> RNA结构，动力学和化学RNA结构和动力学> RNA结构在生物系统中的影响RNA进化和基因组学> RNA和核糖核蛋白进化。最近的研究增加了新的mncRNA功能，包括调节基因表达和选择性剪接。在这篇综述中，我们描述了mncRNA的不同类别，特征和新兴功能及其相对表达模式。最后，我们提供了在数据库中检测和注释面临的挑战的画像。本文的分类为：调节RNA / RNAi /核糖开关>调节RNA的RNA结构和动力学> RNA结构，动力学和化学RNA结构和动力学> RNA结构在生物系统中的影响RNA进化和基因组学> RNA和核糖核蛋白进化。最近的研究正在增加新的mncRNA功能，包括调节基因表达和选择性剪接。在这篇综述中，我们描述了mncRNA的不同类别，特征和新兴功能及其相对表达模式。最后，我们提供了在数据库中检测和注释面临的挑战的画像。本文的分类为：调节RNA / RNAi /核糖开关>调节RNA的RNA结构和动力学> RNA结构，动力学和化学RNA结构和动力学> RNA结构在生物系统中的影响RNA进化和基因组学> RNA和核糖核蛋白进化。核糖核酸的特征和新兴功能及其相对表达模式。最后，我们提供了在数据库中检测和注释面临的挑战的画像。本文的分类为：调节RNA / RNAi /核糖开关>调节RNA的结构和动力学> RNA的结构，动力学和化学RNA的结构和动力学> RNA结构在生物系统中的影响RNA进化和基因组学> RNA和核糖核蛋白进化。核糖核酸的特征和新兴功能及其相对表达模式。最后，我们提供了在数据库中检测和注释面临的挑战的画像。本文的分类为：调节RNA / RNAi /核糖开关>调节RNA的RNA结构和动力学> RNA结构，动力学和化学RNA结构和动力学> RNA结构在生物系统中的影响RNA进化和基因组学> RNA和核糖核蛋白进化。