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VNN3 is a potential novel biomarker for predicting prognosis in clear cell renal cell carcinoma
Animal Cells and Systems ( IF 2.9 ) Pub Date : 2019-03-01 , DOI: 10.1080/19768354.2019.1583126
Mihyang Ha 1 , Hoim Jeong 2 , Jong Seong Roh 2 , Beomgu Lee 2 , Dongjun Lee 3 , Myoung-Eun Han 1 , Sae-Ock Oh 1 , Dong Hyun Sohn 2 , Yun Hak Kim 1, 4, 5
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ABSTRACT Although pathological observations provide approximate prognoses, it is difficult to achieve prognosis in patients with existing prognostic factors. Therefore, it is very important to find appropriate biomarkers to achieve accurate cancer prognosis. Renal cell carcinoma (RCC) has several subtypes, the discrimination of which is crucial for proper treatment. Here, we present a novel biomarker, VNN3, which is used to prognose clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), the most common and aggressive subtype of kidney cancer. Patient information analyzed in our study was extracted from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and International Cancer Genome Consortium (ICGC) cohorts. VNN3 expression was considerably higher in stages III and IV than in stages I and II. Moreover, Kaplan–Meier curves associated high VNN3 expression with poor prognoses (TCGA, p < .0001; ICGC, p = .00076), confirming that ccRCC prognosis can be predicted via VNN3 expression patterns. Consistent with all patient results, the prognosis of patients with higher VNN3 expression was worse in both low stage (I and II) and high stage (III and IV) (TCGA, p < 0.0001 in stage I and II; ICGC, p = 0.028 in stage I and II; TCGA, p = 0.005 in stage III and IV). Area under the curve and receiver operating characteristic curves supported our results that highlighted VNN3 expression as a suitable ccRCC biomarker. Multivariate analysis also verified the prognostic performance of VNN3 expression (TCGA, p < .001; ICGC, p = .017). Altogether, we suggest that VNN3 is applicable as a new biomarker to establish prognosis in patients with ccRCC.

中文翻译:

VNN3是预测透明细胞肾细胞癌预后的潜在新型生物标志物

摘要 虽然病理观察提供了近似的预后,但很难在已有预后因素的患者中实现预后。因此,寻找合适的生物标志物以实现准确的癌症预后非常重要。肾细胞癌 (RCC) 有几种亚型,区分这些亚型对于正确治疗至关重要。在这里,我们提出了一种新的生物标志物 VNN3,它用于预测肾癌最常见和侵袭性亚型透明细胞肾细胞癌 (ccRCC)。我们研究中分析的患者信息来自癌症基因组图谱 (TCGA) 和国际癌症基因组联盟 (ICGC) 队列。VNN3 表达在 III 和 IV 阶段比 I 和 II 阶段高得多。此外,Kaplan-Meier 曲线将高 VNN3 表达与不良预后(TCGA、p < .0001;ICGC, p = .00076),证实可以通过 VNN3 表达模式预测 ccRCC 预后。与所有患者结果一致,具有较高 VNN3 表达的患者的预后在低分期(I 和 II)和高分期(III 和 IV)中均较差(TCGA,I 和 II 期 p < 0.0001;ICGC,p = 0.028 I 和 II 期;TCGA,III 和 IV 期 p = 0.005)。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。确认可以通过 VNN3 表达模式预测 ccRCC 预后。与所有患者结果一致,具有较高 VNN3 表达的患者的预后在低分期(I 和 II)和高分期(III 和 IV)中均较差(TCGA,I 和 II 期 p < 0.0001;ICGC,p = 0.028 I 和 II 期;TCGA,III 和 IV 期 p = 0.005)。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。确认可以通过 VNN3 表达模式预测 ccRCC 预后。与所有患者结果一致,具有较高 VNN3 表达的患者的预后在低分期(I 和 II)和高分期(III 和 IV)中均较差(TCGA,I 和 II 期 p < 0.0001;ICGC,p = 0.028 I 和 II 期;TCGA,III 和 IV 期 p = 0.005)。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。VNN3 高表达患者的预后在低期(I 和 II)和高期(III 和 IV)中均较差(TCGA,I 和 II 期 p < 0.0001;ICGC,I 和 II 期 p = 0.028; TCGA,在阶段 III 和 IV 中 p = 0.005)。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。VNN3 高表达患者的预后在低分期(I 和 II)和高分期(III 和 IV)中均较差(TCGA,I 和 II 期 p < 0.0001;ICGC,I 和 II 期 p = 0.028; TCGA,在阶段 III 和 IV 中 p = 0.005)。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。曲线下面积和接受者操作特征曲线支持我们的结果,即强调 VNN3 表达作为合适的 ccRCC 生物标志物。多变量分析还验证了 VNN3 表达的预后性能(TCGA,p < .001;ICGC,p = .017)。总之,我们建议 VNN3 可用作新的生物标志物来确定 ccRCC 患者的预后。
更新日期:2019-03-01
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