Background It is difficult to distinguish benign pulmonary nodules (PNs) from malignant PNs by conventional examination. Therefore, novel biomarkers that can identify the nature of PNs are needed. Exosomes have recently been identified as an attractive alternative approach since tumor-specific molecules can be found in exosomes isolated from biological fluids. Methods Plasma exosomes were extracted via the exoEasy reagent method. The major proteins from plasma exosomes in patients with PNs were identified via labelfree analysis and screened for differentially expressed proteins. A GO classification analysis and KEGG pathway analysis were performed on plasma exosomal protein from patients with benign and malignant PNs. Results Western blot confirmed that protein expression of CD63 and CD9 could be detected in the exosome extract. Via a search of the human Uniprot database, 736 plasma exosome proteins from patients with PNs were detected using high-confidence peptides. There were 33 differentially expressed proteins in the benign and malignant PNs. Of these, 12 proteins were only expressed in the benign PNs group, while 9 proteins were only expressed in the malignant PNs group. We further obtained important information on signaling pathways and nodal proteins related to differential benign and malignant PNs via bioinformatic analysis methods such as GO, KEGG, and String. Conclusions This study provides a new perspective on the identification of novel detection strategies for benign and malignant PNs. We hope our findings can provide clues for the identification of benign and malignant PNs.

中文翻译：

---

血浆外泌体的蛋白质组学分析以区分恶性和良性肺结节。

背景通过常规检查很难区分良性肺结节（PNs）和恶性PNs。因此，需要能够识别 PN 特性的新型生物标志物。外泌体最近被确定为一种有吸引力的替代方法，因为可以在从生物体液中分离的外泌体中发现肿瘤特异性分子。方法采用exoEasy试剂法提取血浆外泌体。通过无标记分析鉴定了来自 PN 患者血浆外泌体的主要蛋白质，并筛选了差异表达的蛋白质。对良性和恶性 PNs 患者的血浆外泌体蛋白进行 GO 分类分析和 KEGG 通路分析。结果Western blot证实外泌体提取物中可检测到CD63和CD9蛋白表达。通过搜索人类 Uniprot 数据库，使用高置信度肽检测到来自 PN 患者的 736 种血浆外泌体蛋白。良性和恶性PNs中有33个差异表达蛋白。其中，12种蛋白仅在良性PNs组中表达，9种蛋白仅在恶性PNs组中表达。我们通过GO、KEGG和String等生物信息学分析方法进一步获得了与鉴别良恶性PN相关的信号通路和淋巴结蛋白的重要信息。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。使用高置信度肽检测了来自 PN 患者的 736 种血浆外泌体蛋白。良性和恶性PNs中有33个差异表达蛋白。其中，12种蛋白仅在良性PNs组中表达，9种蛋白仅在恶性PNs组中表达。我们通过GO、KEGG和String等生物信息学分析方法进一步获得了与鉴别良恶性PN相关的信号通路和淋巴结蛋白的重要信息。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。使用高置信度肽检测了来自 PN 患者的 736 种血浆外泌体蛋白。良性和恶性PNs中有33个差异表达蛋白。其中，12种蛋白仅在良性PNs组中表达，9种蛋白仅在恶性PNs组中表达。我们通过GO、KEGG和String等生物信息学分析方法进一步获得了与鉴别良恶性PN相关的信号通路和淋巴结蛋白的重要信息。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。12种蛋白仅在良性PNs组中表达，9种蛋白仅在恶性PNs组中表达。我们通过GO、KEGG和String等生物信息学分析方法进一步获得了与鉴别良恶性PN相关的信号通路和淋巴结蛋白的重要信息。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。12种蛋白仅在良性PNs组中表达，9种蛋白仅在恶性PNs组中表达。我们通过GO、KEGG和String等生物信息学分析方法进一步获得了与鉴别良恶性PN相关的信号通路和淋巴结蛋白的重要信息。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。和字符串。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。和字符串。结论 本研究为识别良性和恶性 PN 的新检测策略提供了新的视角。我们希望我们的研究结果可以为鉴别良恶性 PNs 提供线索。