Diabetic nephropathy (DN) is a highly complex syndrome involving multiple dysregulated biological processes. Long non‑coding RNAs (lncRNAs) are now believed to have an important function in various diseases. However, their roles in DN remain largely unknown. Therefore, the present study was performed in order to investigate the lncRNAs that have a crucial role in DN. db/db mice were used as a DN model while db/m mice served as a control to search for lncRNAs which may have important roles in DN. Microarray and bioinformatics analysis gave an overview of the features of differentially expressed genes. Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analysis demonstrated the typical biological alterations in DN. A co‑expression network of lncRNAs and mRNAs revealed the complex interaction pattern in DN conditions. Further data investigation indicated that SOX2‑overlapping transcript (SOX2OT), which was significantly downregulated in DN mice, may be the potentially functional lncRNA contributing to the onset of DN. The UCSC database demonstrated that SOX2OT was highly conserved in mice and humans. Additionally further study using cultured human podocytes and mesangial cells confirmed the downregulation of SOX2OT using reverse transcription‑quantitative polymerase chain reaction and fluorescence in situ hybridization. However, the cellular location of SOX2OT depended on certain cell types. Taken together, the results of the present study indicated that SOX2OT may act as an important regulator in the pathogenesis of DN by interacting with various mRNAs with critical roles in DN.

中文翻译：

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微阵列分析揭示了长链非编码 RNA SOX2OT 作为糖尿病肾病的新型候选调节因子。

糖尿病肾病 (DN) 是一种高度复杂的综合征，涉及多个失调的生物学过程。长链非编码 RNA (lncRNA) 现在被认为在各种疾病中具有重要作用。然而，他们在 DN 中的作用仍然很大程度上未知。因此，本研究旨在研究在 DN 中起关键作用的 lncRNA。db/db 小鼠用作 DN 模型，而 db/m 小鼠用作对照以搜索可能在 DN 中起重要作用的 lncRNA。微阵列和生物信息学分析概述了差异表达基因的特征。基因本体论和京都基因百科全书和基因组富集分析证明了 DN 的典型生物学改变。lncRNA 和 mRNA 的共表达网络揭示了 DN 条件下复杂的相互作用模式。进一步的数据研究表明，在 DN 小鼠中显着下调的 SOX2 重叠转录本 (SOX2OT) 可能是导致 DN 发病的潜在功能性 lncRNA。UCSC 数据库表明 SOX2OT 在小鼠和人类中高度保守。此外，使用培养的人足细胞和系膜细胞的进一步研究证实了使用逆转录定量聚合酶链反应和荧光原位杂交对 SOX2OT 的下调。然而，SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。在 DN 小鼠中显着下调，可能是导致 DN 发病的潜在功能性 lncRNA。UCSC 数据库表明 SOX2OT 在小鼠和人类中高度保守。此外，使用培养的人足细胞和系膜细胞的进一步研究证实了使用逆转录定量聚合酶链反应和荧光原位杂交对 SOX2OT 的下调。然而，SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。在 DN 小鼠中显着下调，可能是导致 DN 发病的潜在功能性 lncRNA。UCSC 数据库表明 SOX2OT 在小鼠和人类中高度保守。此外，使用培养的人足细胞和系膜细胞的进一步研究证实了使用逆转录定量聚合酶链反应和荧光原位杂交对 SOX2OT 的下调。然而，SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。UCSC 数据库表明 SOX2OT 在小鼠和人类中高度保守。此外，使用培养的人足细胞和系膜细胞的进一步研究证实了使用逆转录定量聚合酶链反应和荧光原位杂交对 SOX2OT 的下调。然而，SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。UCSC 数据库表明 SOX2OT 在小鼠和人类中高度保守。此外，使用培养的人足细胞和系膜细胞的进一步研究证实了使用逆转录定量聚合酶链反应和荧光原位杂交对 SOX2OT 的下调。然而，SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。SOX2OT 的细胞位置取决于某些细胞类型。总之，本研究的结果表明，SOX2OT 可能通过与各种在 DN 中起关键作用的 mRNA 相互作用，在 DN 的发病机制中发挥重要的调节作用。