Morphological studies and phylogenetic analyses of DNA sequences from three genomic regions - the internal transcribed spacer (ITS) regions of the nuclear ribosomal gene repeat, a partial sequence of RNA polymerase II subunit (rpb2), and a partial sequence of translation elongation factor (tef1) - were used to investigate the systematics of Hypocrea citrina and related species. A neotype specimen is designated for H. citrina that conforms to Persoon's description of a yellow effuse fungus occurring on leaf litter. Historical information and results obtained in this study provide the foundation for selection of a lectotype specimen from Fries's herbarium for H. lactea. The results indicate that (1) Hypocrea citrina and H. pulvinata are distinct species; (2) H. lactea sensu Fries is a synonym of the older name H. citrina; (3) H. pulvinata, H. protopulvinata, and H. americana are phylogenetically distinct species that form a well-supported polyporicolous clade; (4) H. citrina is situated in a clade closely related to H. pulvinata; and (5) H. microcitrina and H. pseudostraminea reside in a highly supported clade phylogenetically distinct from H. citrina. Hypocrea protopulvinata, H. microcitrina, H. megalocitrina, H. pseudostraminea, and a new species, H. aurantiistroma, are reported and described from North America. Variation in rpb2 and tef1 gene sequences suggests geographical subgroupings between European and North American isolates of H. pulvinata. The phylogenies inferred from ITS, rpb2, and tef1 gene sequences are concordant. Hypocrea citrina var. americana is elevated to species status, Hypocrea americana.

中文翻译：

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Hypocrea citrina 和相关分类群的系统学。

来自三个基因组区域的 DNA 序列的形态学研究和系统发育分析 - 核核糖体基因重复的内部转录间隔 (ITS) 区域、RNA 聚合酶 II 亚基 (rpb2) 的部分序列和翻译延伸因子的部分序列 (tef1 ) - 用于调查 Hypocrea citrina 和相关物种的系统学。为 H. citrina 指定了一个新型标本，该标本符合 Persoon 对出现在枯枝落叶上的黄色渗出真菌的描述。本研究中获得的历史信息和结果为从 Fries 植物标本馆中选择 H.lactea 选型标本提供了基础。结果表明：（1）Hypocrea citrina和H. pulvinata为不同种；(2) H. lactea sensu Fries 是旧名 H. citrina 的同义词；(3) H. pulvinata, H. protopulvinata 和 H. americana 是系统发育不同的物种，它们形成了一个得到充分支持的多孔进化枝；(4) H. citrina 位于与 H. pulvinata 密切相关的进化枝中；(5) H. microcitrina 和 H. pseudostraminea 位于高度支持的进化枝中，在系统发育上与 H. citrina 不同。Hypocrea protopulvinata、H. microcitrina、H. megalocitrina、H.pseudostraminea 和一个新物种，H. aurantiistroma，在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。americana 是系统发育上不同的物种，它们形成了一个得到充分支持的多孔进化枝；(4) H. citrina 位于与 H. pulvinata 密切相关的进化枝中；(5) H. microcitrina 和 H. pseudostraminea 位于高度支持的进化枝中，在系统发育上与 H. citrina 不同。Hypocrea protopulvinata、H. microcitrina、H. megalocitrina、H.pseudostraminea 和一个新物种，H. aurantiistroma，在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。americana 是系统发育上不同的物种，它们形成了一个得到充分支持的多孔进化枝；(4) H. citrina 位于与 H. pulvinata 密切相关的进化枝中；(5) H. microcitrina 和 H. pseudostraminea 位于高度支持的进化枝中，在系统发育上与 H. citrina 不同。Hypocrea protopulvinata、H. microcitrina、H. megalocitrina、H.pseudostraminea 和一个新物种，H. aurantiistroma，在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。citrina 位于与 H. pulvinata 密切相关的进化枝中；(5) H. microcitrina 和 H. pseudostraminea 位于高度支持的进化枝中，在系统发育上与 H. citrina 不同。Hypocrea protopulvinata、H. microcitrina、H. megalocitrina、H.pseudostraminea 和一个新物种，H. aurantiistroma，在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。citrina 位于与 H. pulvinata 密切相关的进化枝中；(5) H. microcitrina 和 H. pseudostraminea 位于高度支持的进化枝中，在系统发育上与 H. citrina 不同。Hypocrea protopulvinata、H. microcitrina、H. megalocitrina、H.pseudostraminea 和一个新物种，H. aurantiistroma，在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。H. pseudostraminea 和一个新物种 H. aurantiistroma 在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。H. pseudostraminea 和一个新物种 H. aurantistroma 在北美有报道和描述。rpb2 和 tef1 基因序列的变异表明欧洲和北美的 H. pulvinata 分离株之间存在地理亚群。从 ITS、rpb2 和 tef1 基因序列推断的系统发育是一致的。Hypocrea 柑橘变种。americana 被提升为物种状态，Hypocrea americana。