Leymus cinereus and L. triticoides are large caespitose and rhizomatous perennial grasses, respectively. Previous studies detected quantitative trait loci (QTL) controlling rhizome spreading near the viviparous1 (vp1) gene markers on linkage groups LG3a and LG3b in two families, TTC1 and TTC2, derived from Leymus triticoides x Leymus cinereus hybrids. The wheat tiller inhibition gene (tin3) is located on Triticum monococcum chromosome 3 A(m)L near vp1. Triticeae group 3 is reportedly collinear with rice chromosome 1, which also contains the maize barren stalk1 and rice lax branching orthogene near vp1. However, previous studies lacked cross-species markers for comparative mapping and showed possible rearrangements of Leymus group 3 in wheat-Leymus racemosus chromosome addition lines. Here, we developed expressed sequence tag (EST) markers from Leymus tiller and rhizomes and mapped sequences aligned to rice chromosome 1. Thirty-eight of 44 informative markers detected loci on Leymus LG3a and LG3b that were collinear with homoeologous sequences on rice chromosome 1 and syntenous in homoeologous group 3 wheat-Leymus and wheat-Thinopyrum addition lines. A SCARECROW-like GRAS-family transcription factor candidate gene was identified in the Leymus EST library, which aligns to the Leymus chromosome group 3 growth habit QTL and a 324-kb rice chromosome 1 region thought to contain the wheat tin3 gene.

中文翻译：

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在莱姆斯（小麦科）中控制植物生长习性的基因：作为可能候选者的玉米贫瘠茎 1 (ba1)、水稻松散穗和小麦分蘖抑制 (tin3) 基因。

Leymus cinereus 和 L. triticoides 分别是大型丛生和根状多年生草本植物。先前的研究检测到数量性状基因座 (QTL) 控制根茎在胎生 1 (vp1) 基因标记附近传播的两个家族中的连锁群 LG3a 和 LG3b，TTC1 和 TTC2，源自 Leymus triticoides x Leymus cinereus 杂种。小麦分蘖抑制基因 (tin3) 位于单核小麦染色体 3 A(m)L 附近 vp1。据报道，小麦科 3 组与水稻 1 号染色体共线，其中还包含玉米不育茎 1 和 vp1 附近的水稻松散分枝正基因。然而，之前的研究缺乏用于比较作图的跨物种标记，并表明小麦-全状羊草染色体附加系中羊草第3组可能发生重排。这里，我们开发了来自羊草分蘖和根茎的表达序列标签 (EST) 标记，并绘制了与水稻 1 号染色体比对的序列。 44 个信息标记中的 38 个检测到莱姆斯 LG3a 和 LG3b 上的位点，它们与水稻 1 号染色体上的同源序列共线，在同源组3小麦-羊草和小麦-Thinopyrum添加系。在 Leymus EST 文库中鉴定出一个 SCARECROW 样 GRAS 家族转录因子候选基因，该基因与 Leymus 染色体组 3 生长习性 QTL 和一个 324-kb 的水稻染色体 1 区域一致，该区域被认为包含小麦 tin3 基因。44 个信息标记中的 38 个检测到 Leymus LG3a 和 LG3b 上的基因座与水稻 1 号染色体上的同源序列共线，并且在同源组 3 小麦-羊草和小麦-Thinopyrum 添加系中是同线的。在 Leymus EST 文库中鉴定出一个 SCARECROW 样 GRAS 家族转录因子候选基因，该基因与 Leymus 染色体组 3 生长习性 QTL 和一个 324-kb 的水稻染色体 1 区域一致，该区域被认为包含小麦 tin3 基因。44 个信息标记中的 38 个检测到 Leymus LG3a 和 LG3b 上的基因座与水稻 1 号染色体上的同源序列共线，并且在同源组 3 小麦-羊草和小麦-Thinopyrum 添加系中是同线的。在 Leymus EST 文库中鉴定出一个 SCARECROW 样 GRAS 家族转录因子候选基因，该基因与 Leymus 染色体组 3 生长习性 QTL 和一个 324-kb 的水稻染色体 1 区域一致，该区域被认为包含小麦 tin3 基因。