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Discovery of widespread Type I and Type V CRISPR-Cas inhibitors
Science ( IF 44.7 ) Pub Date : 2018-09-06 , DOI: 10.1126/science.aau5174
Nicole D Marino 1 , Jenny Y Zhang 1 , Adair L Borges 1 , Alexander A Sousa 2, 3, 4 , Lina M Leon 1 , Benjamin J Rauch 1 , Russell T Walton 2, 3, 4 , Joel D Berry 1 , J Keith Joung 2, 3, 4, 5 , Benjamin P Kleinstiver 2, 3, 4, 5 , Joseph Bondy-Denomy 1, 6
Affiliation  

Cas12 inhibitors join the anti-CRISPR family Bacteria and their phages continually coevolve in a molecular arms race. For example, phages use anti-CRISPR proteins to inhibit the bacterial type I and II CRISPR systems (see the Perspective by Koonin and Makarova). Watters et al. and Marino et al. used bioinformatic and experimental approaches to identify inhibitors of type V CRISPR-Cas12a. Cas12a has been successfully engineered for gene editing and nucleic acid detection. Some of the anti-Cas12a proteins identified in these studies had broad-spectrum inhibitory effects on Cas12a orthologs and could block Cas12a-mediated genome editing in human cells. Science, this issue p. 236, p. 240; see also p. 156 CRISPR-Cas12a inhibitors that block gene editing in human cells are identified. Bacterial CRISPR-Cas systems protect their host from bacteriophages and other mobile genetic elements. Mobile elements, in turn, encode various anti-CRISPR (Acr) proteins to inhibit the immune function of CRISPR-Cas. To date, Acr proteins have been discovered for type I (subtypes I-D, I-E, and I-F) and type II (II-A and II-C) but not other CRISPR systems. Here, we report the discovery of 12 acr genes, including inhibitors of type V-A and I-C CRISPR systems. AcrVA1 inhibits a broad spectrum of Cas12a (Cpf1) orthologs—including MbCas12a, Mb3Cas12a, AsCas12a, and LbCas12a—when assayed in human cells. The acr genes reported here provide useful biotechnological tools and mark the discovery of acr loci in many bacteria and phages.

中文翻译:

发现广泛的 I 型和 V 型 CRISPR-Cas 抑制剂

Cas12 抑制剂加入了抗 CRISPR 家族细菌,它们的噬菌体在分子军备竞赛中不断共同进化。例如,噬菌体使用抗 CRISPR 蛋白来抑制细菌 I 型和 II 型 CRISPR 系统(参见 Koonin 和 Makarova 的观点)。沃特斯等人。和马里诺等人。使用生物信息学和实验方法来识别 V 型 CRISPR-Cas12a 的抑制剂。Cas12a 已成功设计用于基因编辑和核酸检测。这些研究中发现的一些抗 Cas12a 蛋白对 Cas12a 直系同源物具有广谱抑制作用,并且可以阻断 Cas12a 介导的人类细胞基因组编辑。科学,本期第 3 页。第 236 页,第 240; 另见第 鉴定了 156 种阻断人类细胞基因编辑的 CRISPR-Cas12a 抑制剂。细菌 CRISPR-Cas 系统保护它们的宿主免受噬菌体和其他可移动遗传元件的侵害。反过来,移动元件编码各种抗 CRISPR (Acr) 蛋白以抑制 CRISPR-Cas 的免疫功能。迄今为止,已发现 I 型(亚型 ID、IE 和 IF)和 II 型(II-A 和 II-C)的 Acr 蛋白,但其他 CRISPR 系统未发现。在这里,我们报告了 12 个 acr 基因的发现,包括 VA 型和 IC CRISPR 系统的抑制剂。在人体细胞中进行测定时,AcrVA1 抑制广谱的 Cas12a (Cpf1) 直系同源物,包括 MbCas12a、Mb3Cas12a、AsCas12a 和 LbCas12a。这里报道的 acr 基因提供了有用的生物技术工具,并标志着在许多细菌和噬菌体中发现了 acr 基因座。编码各种抗CRISPR(Acr)蛋白以抑制CRISPR-Cas的免疫功能。迄今为止,已发现 I 型(亚型 ID、IE 和 IF)和 II 型(II-A 和 II-C)的 Acr 蛋白,但其他 CRISPR 系统未发现。在这里,我们报告了 12 个 acr 基因的发现,包括 VA 型和 IC CRISPR 系统的抑制剂。在人体细胞中进行测定时,AcrVA1 抑制广谱的 Cas12a (Cpf1) 直系同源物,包括 MbCas12a、Mb3Cas12a、AsCas12a 和 LbCas12a。这里报道的 acr 基因提供了有用的生物技术工具,并标志着在许多细菌和噬菌体中发现了 acr 基因座。编码各种抗CRISPR(Acr)蛋白以抑制CRISPR-Cas的免疫功能。迄今为止,已发现 I 型(亚型 ID、IE 和 IF)和 II 型(II-A 和 II-C)的 Acr 蛋白,但其他 CRISPR 系统未发现。在这里,我们报告了 12 个 acr 基因的发现,包括 VA 型和 IC CRISPR 系统的抑制剂。在人体细胞中进行测定时,AcrVA1 抑制广谱的 Cas12a (Cpf1) 直系同源物,包括 MbCas12a、Mb3Cas12a、AsCas12a 和 LbCas12a。这里报道的 acr 基因提供了有用的生物技术工具,并标志着在许多细菌和噬菌体中发现了 acr 基因座。包括 VA 型和 IC CRISPR 系统的抑制剂。在人体细胞中进行测定时,AcrVA1 抑制广谱的 Cas12a (Cpf1) 直系同源物,包括 MbCas12a、Mb3Cas12a、AsCas12a 和 LbCas12a。这里报道的 acr 基因提供了有用的生物技术工具,并标志着在许多细菌和噬菌体中发现了 acr 基因座。包括 VA 型和 IC CRISPR 系统的抑制剂。在人体细胞中进行测定时,AcrVA1 抑制广谱的 Cas12a (Cpf1) 直系同源物,包括 MbCas12a、Mb3Cas12a、AsCas12a 和 LbCas12a。这里报道的 acr 基因提供了有用的生物技术工具,并标志着在许多细菌和噬菌体中发现了 acr 基因座。
更新日期:2018-09-06
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