Background Together with Treponema pallidum subspecies pertenue, Haemophilus ducreyi is a major cause of exudative cutaneous ulcers (CUs) in children. For H. ducreyi, both class I and class II strains, asymptomatic colonization, and environmental reservoirs have been found in endemic regions, but the epidemiology of this infection is unknown. Methods Based on published whole-genome sequences of H. ducreyi CU strains, a single-locus typing system was developed and applied to H. ducreyi-positive CU samples obtained prior to, 1 year after, and 2 years after the initiation of a mass drug administration campaign to eradicate CU on Lihir Island in Papua New Guinea. DNA from the CU samples was amplified with class I and class II dsrA-specific primers and sequenced; the samples were classified into dsrA types, which were geospatially mapped. Selection pressure analysis was performed on the dsrA sequences. Results Thirty-seven samples contained class I sequences, 27 contained class II sequences, and 13 contained both. There were 5 class I and 4 class II types circulating on the island; 3 types accounted for approximately 87% of the strains. The composition and geospatial distribution of the types varied little over time and there was no evidence of selection pressure. Conclusions Multiple strains of H. ducreyi cause CU on an endemic island and coinfections are common. In contrast to recent findings with T. pallidum pertenue, strain composition is not affected by antibiotic pressure, consistent with environmental reservoirs of H. ducreyi. Such reservoirs must be addressed to achieve eradication of H. ducreyi.

中文翻译：

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多个 I 类和 II 类杜克雷嗜血杆菌菌株在一个地方性岛屿上导致儿童皮肤溃疡。

背景 与梅毒螺旋体亚种持久性一样，杜克雷嗜血杆菌是儿童渗出性皮肤溃疡 (CU) 的主要原因。对于 H. ducreyi，在流行地区发现了 I 类和 II 类菌株、无症状定植和环境宿主，但这种感染的流行病学尚不清楚。方法 基于已发表的 H. ducreyi CU 菌株的全基因组序列，开发了一个单基因座分型系统，并将其应用于在质量开始之前、之后 1 年和之后 2 年获得的 H. ducreyi 阳性 CU 样本在巴布亚新几内亚的利希尔岛上开展了根除 CU 的药物管理运动。来自 CU 样品的 DNA 用 I 类和 II 类 dsrA 特异性引物扩增并测序；样本被分类为 dsrA 类型，并进行了地理空间映射。对 dsrA 序列进行选择压力分析。结果 37个样本包含I类序列，27个包含II类序列，13个包含两者。岛上流通的Ⅰ类5种，Ⅱ类4种；3种类型约占菌株的87%。随着时间的推移，这些类型的组成和地理空间分布变化不大，没有证据表明存在选择压力。结论 多株H. ducreyi在一个地方性岛屿上引起CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。结果 37个样本包含I类序列，27个包含II类序列，13个包含两者。岛上流通的Ⅰ类5种，Ⅱ类4种；3种类型约占菌株的87%。随着时间的推移，这些类型的组成和地理空间分布变化不大，没有证据表明存在选择压力。结论 多株H. ducreyi在一个地方性岛屿上引起CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。结果 37个样本包含I类序列，27个包含II类序列，13个包含两者。岛上流通的Ⅰ类5种，Ⅱ类4种；3种类型约占菌株的87%。随着时间的推移，这些类型的组成和地理空间分布变化不大，没有证据表明存在选择压力。结论 多株H. ducreyi在一个地方性岛屿上引起CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。岛上流通的Ⅰ类5种，Ⅱ类4种；3种类型约占菌株的87%。随着时间的推移，这些类型的组成和地理空间分布变化不大，没有证据表明存在选择压力。结论 多株H. ducreyi在一个地方性岛屿上引起CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。岛上流通的Ⅰ类5种，Ⅱ类4种；3种类型约占菌株的87%。随着时间的推移，这些类型的组成和地理空间分布变化不大，没有证据表明存在选择压力。结论 多株H. ducreyi在一个地方性岛屿上引起CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。ducreyi 在一个地方性岛屿上引起 CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。ducreyi 在一个地方性岛屿上引起 CU，并且共同感染很常见。与 T. pallidum pertenue 最近的发现相反，菌株组成不受抗生素压力的影响，这与 H. ducreyi 的环境储库一致。必须解决这些水库以实现根除 H. ducreyi。