Predicting AID off-targets: A step forward,Journal of Experimental Medicine

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Predicting AID off-targets: A step forward
Journal of Experimental Medicine ( IF 12.6 ) Pub Date : 2018-03-05 , DOI: 10.1084/jem.20180231
Claude-Agnès Reynaud ₁ , Jean-Claude Weill ₁

Affiliation

In this issue of JEM, Álvarez-Prado et al. (https://doi.org/10.1084/jem.20171738) designed a DNA capture library allowing them to identify 275 genes targeted by AID in mouse germinal center B cells. Using the molecular features of these genes to feed a machine-learning algorithm, they determined that high-density RNA PolII and Spt5 binding—found in 2.3% of the genes—are the best predictors of AID specificity.

中文翻译：

预测 AID 脱靶：向前迈出了一步

在本期正义与平等运动中，阿尔瓦雷斯-普拉多等人。 (https://doi.org/10.1084/jem.20171738) 设计了一个 DNA 捕获库，使他们能够识别小鼠生发中心 B 细胞中 AID 靶向的 275 个基因。利用这些基因的分子特征为机器学习算法提供数据，他们确定，在 2.3% 的基因中发现的高密度 RNA PolII 和 Spt5 结合是 AID 特异性的最佳预测因子。

更新日期：2018-03-06

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