Microorganisms directly and indirectly contribute to production of diverse biofuels. Heterotrophic microorganisms are being used for commercial production of biofuels such as biogas and fuel alcohols from organic matter. Photosynthetic microorganisms convert inorganic carbon and water to potential fuels (e.g. fuel alcohols, biohydrogen) and fuel precursors (e.g. biomass, starch, lipids). Only a few microbial processes are used for commercial production of biofuels, but this will certainly change with the enhanced production capabilities being achieved through microbial metabolic engineering. Processes that previously required multiple steps of feedstock pretreatment and subsequent conversion to fuel are being consolidated into single-step microbial processes using metabolically engineered species. Microorganisms with the ability to produce fuels from feedstock they could not use previously, are being engineered. This review discusses some of the metabolic engineering approaches being used to enhance the commercialization potential of microbial biofuels including fuel alcohols, biodiesel and biohydrogen. At present, all biogas production relies on native populations of methanogens and this does not seem likely to change in the near term. Potential fuels from microalgae, cyanobacteria and other photosynthetic bacteria, whether native or engineered, have distant prospects of commercial use. Metabolically engineered yeasts surface displaying various hydrolytic enzymes appear to hold the greatest potential for near term commercial use in generating bioethanol from starch, pretreated lignocellulose and other polysaccharides. The bacterium Zymomonas mobilis metabolically engineered to make bioethanol from pentose sugars is already being commercialized. Other similar examples are likely to emerge as more engineered microorganisms become available.

微生物直接和间接地促进了多种生物燃料的生产。异养微生物被用于商业生产生物燃料，例如来自有机物的沼气和燃料醇。光合微生物将无机碳和水转化为潜在的燃料（例如燃料酒精，生物氢）和燃料前体（例如生物质，淀粉，脂质）。仅有少数微生物工艺可用于生物燃料的商业生产，但是随着通过微生物代谢工程技术实现更高的生产能力，这必将改变。以前需要多步进行原料预处理并随后转化为燃料的过程已通过代谢工程物质被合并为一步微生物过程。具有从以前无法使用的原料生产燃料的能力的微生物正在被工程化。这篇综述讨论了一些代谢工程方法，这些方法可用于增强微生物生物燃料的商业化潜力，包括燃料醇，生物柴油和生物氢。目前，所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这似乎在短期内不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 正在设计中。这篇综述讨论了一些代谢工程方法，这些方法可用于增强微生物生物燃料的商业化潜力，包括燃料醇，生物柴油和生物氢。目前，所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这似乎在短期内不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 正在设计中。这篇综述讨论了一些代谢工程方法，这些方法可用于增强微生物生物燃料的商业化潜力，包括燃料醇，生物柴油和生物氢。目前，所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这似乎在短期内不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 这篇综述讨论了一些代谢工程方法，这些方法可用于增强微生物生物燃料的商业化潜力，包括燃料醇，生物柴油和生物氢。目前，所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这似乎在短期内不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 这篇综述讨论了一些代谢工程方法，这些方法可用于增强微生物生物燃料的商业化潜力，包括燃料醇，生物柴油和生物氢。目前，所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这似乎在短期内不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 所有沼气的生产都依赖于甲烷源的原生种群，这在短期内似乎不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 所有沼气的生产都依赖于产甲烷菌的原生种群，这在短期内似乎不会改变。来自微藻类，蓝细菌和其他光合细菌的潜在燃料，无论是天然的还是工程的，都具有广泛的商业应用前景。经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 经代谢工程改造的酵母表面显示出多种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可以从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌 经代谢工程改造的酵母表面显示出各种水解酶，似乎在近期商业用途中具有最大的潜力，可用于从淀粉，预处理的木质纤维素和其他多糖中产生生物乙醇。细菌代谢工程化的运动发酵单胞菌（Zymomonas mobilis）已由戊糖制得生物乙醇，已经商业化。随着更多的工程微生物的出现，其他类似的例子也可能出现。