Objective The diagnosis of dysplasia in Barrett’s oesophagus (BO) can be challenging, and reliable ancillary techniques are not available. This study examines if DNA content abnormality detected by flow cytometry can serve as a diagnostic marker of dysplasia and facilitate risk stratification of low-grade dysplasia (LGD) and indefinite for dysplasia (IND) patients using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) BO samples with varying degrees of dysplasia. Design DNA flow cytometry was performed on 80 FFPE BO samples with high-grade dysplasia (HGD), 38 LGD, 21 IND and 14 negative for dysplasia (ND). Three to four 60-micron thick sections were cut from each tissue block, and the area of interest was manually dissected. Results DNA content abnormality was identified in 76 HGD (95%), 8 LGD (21.1%), 2 IND (9.5%) and 0 ND samples. As a diagnostic marker of HGD, the estimated sensitivity and specificity of DNA content abnormality were 95% and 85%, respectively. For patients with DNA content abnormality detected at baseline LGD or IND, the univariate HRs for subsequent detection of HGD or oesophageal adenocarcinoma (OAC) were 7.0 and 20.0, respectively (p =<0.001). Conclusions This study demonstrates the promise of DNA flow cytometry using FFPE tissue in the diagnosis and risk stratification of dysplasia in BO. The presence of DNA content abnormality correlates with increasing levels of dysplasia, as 95% of HGD samples showed DNA content abnormality. DNA flow cytometry also identifies a subset of patients with LGD and IND who are at higher risk for subsequent detection of HGD or OAC.

中文翻译：

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石蜡包埋组织的流式细胞术 DNA 分析对 Barrett 发育不良的诊断和风险分层

目的 Barrett 食管 (BO) 发育不良的诊断具有挑战性，并且没有可靠的辅助技术。本研究检查流式细胞术检测到的 DNA 含量异常是否可以作为异常增生的诊断标志物，并促进使用福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) BO 对低度异常增生 (LGD) 和不定型异常增生 (IND) 患者进行风险分层具有不同程度异型增生的样本。设计 DNA 流式细胞术对 80 个具有高度不典型增生 (HGD)、38 个 LGD、21 个 IND 和 14 个不典型增生 (ND) 阴性的 FFPE BO 样本进行了分析。从每个组织块上切下三到四个 60 微米厚的切片，并手动解剖感兴趣的区域。结果 在 76 个 HGD (95%)、8 个 LGD (21.1%)、2 个 IND (9.5%) 和 0 个 ND 样本中发现 DNA 含量异常。作为 HGD 的诊断标志物，估计 DNA 含量异常的敏感性和特异性分别为 95% 和 85%。对于在基线 LGD 或 IND 检测到 DNA 含量异常的患者，后续检测 HGD 或食管腺癌 (OAC) 的单变量 HR 分别为 7.0 和 20.0 (p = <0.001)。结论 本研究证明了使用 FFPE 组织的 DNA 流式细胞术在 BO 不典型增生的诊断和风险分层中的前景。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。DNA 含量异常的估计敏感性和特异性分别为 95% 和 85%。对于在基线 LGD 或 IND 检测到 DNA 含量异常的患者，后续检测 HGD 或食管腺癌 (OAC) 的单变量 HR 分别为 7.0 和 20.0 (p = <0.001)。结论 本研究证明了使用 FFPE 组织的 DNA 流式细胞术在 BO 不典型增生的诊断和风险分层中的前景。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。DNA 含量异常的估计敏感性和特异性分别为 95% 和 85%。对于在基线 LGD 或 IND 检测到 DNA 含量异常的患者，后续检测 HGD 或食管腺癌 (OAC) 的单变量 HR 分别为 7.0 和 20.0 (p = <0.001)。结论 本研究证明了使用 FFPE 组织的 DNA 流式细胞术在 BO 不典型增生的诊断和风险分层中的前景。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可以识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。随后检测 HGD 或食管腺癌 (OAC) 的单变量 HR 分别为 7.0 和 20.0 (p = <0.001)。结论 本研究证明了使用 FFPE 组织的 DNA 流式细胞术在 BO 不典型增生的诊断和风险分层中的前景。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可以识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。随后检测 HGD 或食管腺癌 (OAC) 的单变量 HR 分别为 7.0 和 20.0 (p = <0.001)。结论 本研究证明了使用 FFPE 组织的 DNA 流式细胞术在 BO 不典型增生的诊断和风险分层中的前景。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可以识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可以识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。DNA 含量异常的存在与发育不良水平的增加相关，因为 95% 的 HGD 样本显示 DNA 含量异常。DNA 流式细胞术还可以识别出一部分 LGD 和 IND 患者，这些患者在随后检测到 HGD 或 OAC 的风险较高。