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如何简单粗暴地获得脂水分布系数logD?

诸位从事药物化学和有机化学相关工作的朋友对“脂溶性”这个词再熟悉不过了。脂-水分布系数(logD)是反映化合物脂溶性的一个重要参数,可以说这个概念和药物发现的诸多环节都有着密切联系。以往logD值都是通过高效液相色谱法(HPLC)来测定的,但是,如果化合物的紫外吸收很弱甚至没有紫外吸收,那么用HPLC来进行测定的难度就非常大了。近日,丹麦哥本哈根大学Matthias M. Herth研究小组在Bioorg. Med. Chem. Lett.杂志上报道了一种利用1H-NMR评估化合物在正辛醇-重水中生理pH值下脂溶性(logD7.4的方法。


大伙最关心的肯定是人家的方法了,咱还是直接立图吧。

图片来源:Bioorg. Med. Chem. Lett.


怎么样,大伙看完有没有觉得醍醐灌顶,豁然开朗啊?我估计用1H-NMR做过相对定量的朋友肯定会说,“我怎么没想到啊?”反正我看了这图以后,由衷佩服人家的想法,真是够简单!够粗暴!当然了,作者还给出了计算公式及推导过程,咱们也不妨看一看。

图片来源:Bioorg. Med. Chem. Lett.


通常,一种新方法的建立都需要原有方法的验证,这也可以说是固定套路了。这篇文章也不例外。作者利用1H-NMR方法对一些常见化合物的logD7.4值进行了测定,并同文献中用HPLC方法测得的logD7.4值进行了比较,结果见下表。

图片来源:Bioorg. Med. Chem. Lett.


文末,作者对他们建立的方法的优劣进行了总结。优点很明显:1. 不受化合物是否有紫外吸收的影响;2. 盐类化合物可以很容易被测定;3. 实验操作简便,无需校准曲线、内标及外标。这个方法的不足作者也谈到了,主要就是其logD7.4的检测范围在0.7-3.3之间。对于logD7.4值大于4.5的样品,该方法无法检测。这主要由于该类样品在重水缓冲溶液中的溶解度非常小,很难得到信噪比满意的氢谱信号。


当然,作者标题也说的很明白,得到的logD7.4值只是“近似值”,但考虑到标准方法所需要的时间和工作量,这一“简单粗暴”的方法还是很有用武之地的。还在为测定logD 值苦苦摸索液相方法的小伙伴们,快来试试看吧!


原文(扫描或长按二维码,识别后直达原文页面):

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960894X16312008

Development of a simple protonnuclear magnetic resonance-based procedure to estimate the approximate distribution coefficient at physiological pH (logD7.4): Evaluation and comparison to existing practices

Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016, DOI: 10.1016/j.bmcl.2016.11.048


(本文由乐只君子供稿)


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