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空间组学

空间组学(Spatial Omics)是一门新兴的前沿交叉学科,旨在研究生物体内多种分子的空间分布特征、相互作用及其与疾病发生发展的关系。近年来,空间组学已成为生物医学研究的热点方向 (Science 2023。其中,空间转录组Nat Methods 2020空间蛋白质组Nat Methods 2024分别被评为2020和2024年度方法。

质谱成像(Mass Spectrometry Imaging)作为空间组学研究的核心技术之一,可以在组织空间维度检测多种生物分子(如代谢物、蛋白质、脂类、核酸等)和金属元素(包括同位素)的含量与分布特征,构建多维化学信息图谱,在基础研究和临床转化领域均展现出广阔的应用前景(Nat Methods 2023

2022年,高能所建成了空间组学质谱平台(Spatial Omics Mass Spectrometry Facility, SOMSF),仪器详情参见仪器设备,测试服务信息请见测试服务平台集成了多套国际先进的质谱成像系统,包括解吸电喷雾-静电场轨道阱质谱成像系统(DESI-Q Exactive)和激光剥蚀-电感耦合等离子体飞行时间质谱成像系统(LA-ICP-TOFMS),并配备了完善的前处理和数据处理系统。依托该平台,我们将围绕空间多组学技术,从单细胞-组织-整体动物等多个尺度,开展空间代谢组学Spatial Metabolomics)、空间金属组学Spatial Metallomics)和空间蛋白质组学(Spatial Proteomics)的方法学开发与应用研究。

平台正与高能所同步辐射装置——北京同步辐射装置(BSRF)和高能同步辐射光源(HEPS)——紧密结合,构建质谱与同步辐射技术的多模态空间组学解析体系,以获得更加全面、丰富的空间组学信息

    



空间组学请见如下报告。


中国科学院高能物理研究所 丰伟悦

《激光剥蚀-电感耦合等离子体质谱技术元素成像分析及生物医学应用》

https://www.bilibili.com/video/av845424685


中国医学科学院院药物研究所 贺玖明

《质谱成像新技术与空间分辨代谢组学新方法及其医药应用研究》

https://www.bilibili.com/video/av968901703


Bernd Bodenmiller,University of Zurich

Multiscale analysis of in situ tumor biology towards precision medicine

https://www.youtube.com/watch?v=lU_RmHlMz_I


更多关于空间组学的报告,可见:

https://spatialomics.net/talks/

Frontiers in Spatial Multi-omics: https://live.vhall.com/v3/lives/watch/931251429