陈善元 - 云南大学 - 生命科学学院

个人简介

个人简历 2018/12，入选2018年云南省“万人计划”青年拔尖人才专项 2018/10–至今，2018-2022年教育部高等学校大学生物学课程教学指导委员会委员 2018/04–至今，2018-2022年云南省高等学校大学生物学课程教学指导委员会主任委员 2017/10–至今，云南大学国家级生命科学实验教学示范中心，主任 2016/01–至今，云南大学生命科学学院，副院长 2014/11–至今，云南大学生命科学学院，教授 2014/06，入选第四批云南省百名海外高层次人才引进计划 2014/01–2014/10，云南大学生命科学学院，讲师 2010/02–2013/12，葡萄牙波尔图大学生物多样性与遗传资源研究中心（CIBIO），项目负责人 2007/03–2010/01，葡萄牙波尔图大学生物多样性与遗传资源研究中心（CIBIO），博士后 2003/09–2006/07，云南大学生命科学学院，博士 2000/09–2003/07，云南大学生命科学学院，硕士 1996/09–2000/07，云南农业大学动物科学与技术学院，学士教授课程本科生课程：遗传学（双语教学），动物生物学实验硕士研究生课程：科研论文的写作，科技论文写作与科研道德规范

研究领域

1、动物基因组多样性与群体基因组学以家牛和山羊为研究对象，旨在摸清云南及周边地区家牛和山羊地方品种资源的基因组多样性状况、群体遗传结构及遗传混合程度、受到选择作用的基因或基因组区域。 2、动物系统发育与进化以我国特有的金线鲃属（Sinocyclocheilus）鱼类和部分鸟类物种为研究对象，构建分子系统发育关系及解析重要表型性状的演化过程。 3、整合组学采用多组学包括表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学、功能基因组学等手段，以商业化家牛和山羊品种为对照，解析部分云南地方家牛和山羊品种高抗病力性状产生的分子遗传基础。

近期论文

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1.ChenH,LiC,LiuT,ChenS*,XiaoH*.2019.Ametagenomicstudyofintestinalmicrobialdiversityinrelationtofeedinghabitsofsurfaceandcave-dwellingSinocyclocheilusspecies.MicrobialEcology,FirstOnline:06July2019;https://doi.org/10.1007/s00248-019-01409-4 2.ChenY,ZengB,ShiP*,XiaoH*,ChenS*.2019.ComparativeanalysisoftheliverandspleentranscriptomesbetweenHolsteinandYunnanhumpedcattle.Animals,9:527;https://doi.org/10.3390/ani9080527 3.LiR,LiC,ChenH,LiuX,XiaoH,ChenS*.2019.GenomicdiversityandadmixturepatternsamongsixChineseindigenouscattlebreedsinYunnan.Asian-AustralasianJournalofAnimalSciences,32:1069-1076. 4.Pérez-PardalL#,ChenS#(共享第一作者),CostaV,LiuX,CarvalheiraJ,Beja-PereiraA.2018.Genomicdifferentiationbetweenswampandriverbuffalousingacattlehigh-densitysinglenucleotidepolymorphismspanel.Animal12:464-471. 5.LiC,ChenY,NingT,ZhangS,ChenS*,XiaoH*.2018.ThecompletemitochondrialgenomeofSinocyclocheilustingi(Cypriniformes:Cyprinidae):characterizationandphylogeneticposition.ConservationGeneticsResources.https://link.springer.com/article/10.1007/s12686-017-0976-x 6.LiC,HuangH,YangS,HeH,FuQ,ChenS*,XiaoH*.2018.CompletemitochondrialgenomeandphylogeneticanalysisofSinocyclocheilusoxycephalus(Cypriniformes:Cyprinidae).MitochondrialDNAPartB3:243-244. 7.李蓉,陈艳艳,和忠廷,杨洪福,李春青,曾本娟,陈善元*,肖蘅*.2018.云南丘北仙女虾一物种的分子鉴定.生物学杂志35:46-51. 8.ChenY,YanH,SunJ,LiC,XiaoH,ChenS*.2017.CharacterizationandphylogeneticanalysisofthecompletemitochondrialgenomesequenceofRhyticerosundulatus(Bucerotiformes:Bucerotidae).ConservationGeneticsResources.https://link.springer.com/article/10.1007/s12686-017-0957-0 9.ChenH,LiC,ChenS*,XiaoH*.2017.ThecompletemitochondrialgenomesequenceandphylogeneticpositionofSinocyclocheiluswumengshanensis(Cypriniformes:Cyprinidae).MitochondrialDNAPartB2:821-822. 10.LiR,ChenY,YanH,LiC,XiaoH,ChenS*.2017.ThecompletemitochondrialgenomesequenceofAnthracoceroscoronatus(Bucerotiformes:Bucerotidae).ConservationGeneticsResources.https://link.springer.com/article/10.1007/s12686-017-0835-9 11.LiC,XiangX,NingT,ChenS*,XiaoH*.2017.ThecompletemitochondrialgenomesequenceofSinocyclocheilusjii(Cypriniformes:Cyprinidae)andphylogeneticimplications.MitochondrialDNAPartB2:638-639. 12.ChenY,LiC,YanH,XiaoH,ChenS*.2017.ThecompletemitochondrialgenomesequenceofBucerosbicornis(Bucerotiformes:Bucerotidae).ConservationGeneticsResources.https://link.springer.com/article/10.1007/s12686-017-0803-4 13.陈泓宇,陈艳艳,李蓉,肖蘅*,陈善元*.2017.代表性鱼类物种全基因组测序研究进展.生物学杂志34:73-77. 14.段昕妤,肖蘅,陈善元*.2017.动物类群中水平基因转移的研究进展.生命科学研究21:360-364. 15.李蓉,郑雨田,李春青,陈艳艳,杨振升,陈善元*,肖蘅*.2017.基于线粒体COI基因序列的壮真蝎与普洱真蝎的分子鉴定.四川动物36:139-144. 16.曾本娟,李蓉,肖蘅,陈善元*.2017.家养牛品种间抗病力差异的分子遗传基础研究进展.畜牧兽医学报48:193-200. 17.RosenbomS,CostaV,ChenS,KhalatbariL,YusefiGH,AbdukadirA,YangzomC,KebedeF,TeclaiR,YohannesH,etal.2015.Reassessingtheevolutionaryhistoryofass-likeequids:Insightsfrompatternsofgeneticvariationincontemporaryextantpopulations.MolecularPhylogeneticsandEvolution85:88-96. 18.ChenS,GomesR,CostaV,SantosP,CharnecaR,ZhangY-p,LiuX-h,WangS-q,BentoP,NunesJ-L,etal.2013.Howimmunogeneticallydifferentaredomesticpigsfromwildboars:aperspectivefromsingle-nucleotidepolymorphismsof19immunity-relatedcandidategenes.Immunogenetics65:737-748. 19.ChenS,GomesR,CostaV,RochaI,ZsolnaiA,AntonI,CharnecaR,SantosP,NunesJL,BuzgóJ,etal.2012.NovelcodinggeneticvariantsoftheGBP1geneinwildanddomesticpigs(Susscrofa).LivestockScience146:1-4. 20.ChenS,CostaV,Beja-PereiraA.2011.Evolutionarypatternsoftwomajorreproductioncandidategenes(Zp2andZp3)revealnocontributiontoreproductiveisolationbetweenbovinespecies.BMCEvolutionaryBiology11:24. 21.CosartT,Beja-PereiraA,ChenS,NgS,ShendureJ,LuikartG.2011.Exome-wideDNAcaptureandnextgenerationsequencingindomesticandwildspecies.BMCGenomics12:347. 22.KimuraB,MarshallFB,ChenS,RosenbomS,MoehlmanPD,TurossN,SabinRC,PetersJ,BarichB,YohannesH,etal.2011.AncientDNAfromNubianandSomaliwildassprovidesinsightsintodonkeyancestryanddomestication.ProceedingsoftheRoyalSocietyB:BiologicalSciences278:50-57. 23.ChenS,LinB-Z,BaigM,MitraB,LopesRJ,SantosAM,MageeDA,AzevedoM,TarrosoP,SasazakiS,etal.2010.ZebucattleareanexclusivelegacyoftheSouthAsiaNeolithic.MolecularBiologyandEvolution27:1-6.