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单细胞 RNA-Seq 揭示了原始卵泡形成过程中小鼠生殖细胞中高度协调的转录程序
Aging Cell ( IF 7.1 ) Pub Date : 2021-06-26 , DOI: 10.1111/acel.13424 Yuanlin He , Qiuzhen Chen , Juncheng Dai , Yiqiang Cui , Chi Zhang , Xidong Wen , Jiazhao Li , Yue Xiao , Xiaoxu Peng , Mingxi Liu , Bin Shen , Jiahao Sha , Zhibin Hu , Jing Li , Wenjie Shu
Aging Cell ( IF 7.1 ) Pub Date : 2021-06-26 , DOI: 10.1111/acel.13424 Yuanlin He , Qiuzhen Chen , Juncheng Dai , Yiqiang Cui , Chi Zhang , Xidong Wen , Jiazhao Li , Yue Xiao , Xiaoxu Peng , Mingxi Liu , Bin Shen , Jiahao Sha , Zhibin Hu , Jing Li , Wenjie Shu
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哺乳动物原始卵泡的组装是卵巢生物学中最关键的过程之一。它直接影响女性在整个生殖生命中可获得的卵母细胞数量。原始卵泡的过早耗竭导致卵巢病理学原发性卵巢功能不全(POI)。为了描绘卵母细胞在此过程中的发育轨迹和调控机制,我们对来自新生儿 (P0.5) 卵巢的单个生殖细胞进行了 RNA-seq。三个细胞簇被分类,它们对应于新生儿卵巢中的三种细胞状态(生殖细胞囊肿、囊肿破裂和卵泡)。通过Monocle分析,构建了一条卵母细胞发育的统一轨迹,一系列基因沿着伪时间线呈现动态变化。基因本体术语富集显示减数分裂相关基因显着减少,卵母细胞特异性基因显着增加,这标志着从生殖细胞向功能性卵母细胞的转变。然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节 然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节 然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节Id2及其家族成员Id1,关于使用 siRNA 敲低和转基因小鼠模型建立原始卵泡池。总之,我们的研究系统地重建了卵母细胞中的分子级联反应,并确定了卵泡形成和发育过程中的一系列基因和分子通路。
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更新日期:2021-07-16
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