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单细胞 RNA-Seq 揭示了原始卵泡形成过程中小鼠生殖细胞中高度协调的转录程序
Aging Cell ( IF 7.1 ) Pub Date : 2021-06-26 , DOI: 10.1111/acel.13424
Yuanlin He Qiuzhen Chen Juncheng Dai Yiqiang Cui Chi Zhang Xidong Wen Jiazhao Li Yue Xiao Xiaoxu Peng Mingxi Liu Bin Shen Jiahao Sha Zhibin Hu Jing Li Wenjie Shu

哺乳动物原始卵泡的组装是卵巢生物学中最关键的过程之一。它直接影响女性在整个生殖生命中可获得的卵母细胞数量。原始卵泡的过早耗竭导致卵巢病理学原发性卵巢功能不全(POI)。为了描绘卵母细胞在此过程中的发育轨迹和调控机制,我们对来自新生儿 (P0.5) 卵巢的单个生殖细胞进行了 RNA-seq。三个细胞簇被分类,它们对应于新生儿卵巢中的三种细胞状态(生殖细胞囊肿、囊肿破裂和卵泡)。通过Monocle分析,构建了一条卵母细胞发育的统一轨迹,一系列基因沿着伪时间线呈现动态变化。基因本体术语富集显示减数分裂相关基因显着减少,卵母细胞特异性基因显着增加,这标志着从生殖细胞向功能性卵母细胞的转变。然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节 然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节 然后,我们通过使用单细胞调节网络推理和聚类 (SCENIC) 算法建立了一个调节子网络,并确定了可能在卵泡形成过程中维持转录程序的候选转录因子。以下功能研究进一步揭示了已识别调节子的差异调节Id2及其家族成员Id1,关于使用 siRNA 敲低和转基因小鼠模型建立原始卵泡池。总之,我们的研究系统地重建了卵母细胞中的分子级联反应,并确定了卵泡形成和发育过程中的一系列基因和分子通路。



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更新日期:2021-07-16
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