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The use of spatial and genetic tools to assess Plasmodium falciparum transmission in Lusaka, Zambia between 2011 and 2015.
Malaria Journal ( IF 2.4 ) Pub Date : 2020-01-15 , DOI: 10.1186/s12936-020-3101-7
Daniel J Bridges 1, 2 , Sandra Chishimba 1, 2 , Mulenga Mwenda 1, 2 , Anna M Winters 2, 3 , Erik Slawsky 4 , Brenda Mambwe 1 , Conceptor Mulube 1 , Kelly M Searle 5 , Aves Hakalima 6 , Roy Mwenechanya 2, 7 , David A Larsen 2, 4
Affiliation  

BACKGROUND Zambia has set itself the ambitious target of eliminating malaria by 2021. To continue tracking transmission to zero, new interventions, tools and approaches are required. METHODS Urban reactive case detection (RCD) was performed in Lusaka city from 2011 to 2015 to better understand the location and drivers of malaria transmission. Briefly, index cases were followed to their home and all consenting individuals living in the index house and nine proximal houses were tested with a malaria rapid diagnostic test and treated if positive. A brief survey was performed and for certain responses, a dried blood spot sample collected for genetic analysis. Aggregate health facility data, individual RCD response data and genetic results were analysed spatially and against environmental correlates. RESULTS Total number of malaria cases remained relatively constant, while the average age of incident cases and the proportion of incident cases reporting recent travel both increased. The estimated R0 in Lusaka was < 1 throughout the study period. RCD responses performed within 250 m of uninhabited/vacant land were associated with a higher probability of identifying additional infections. CONCLUSIONS Evidence suggests that the majority of malaria infections are imported from outside Lusaka. However there remains some level of local transmission occurring on the periphery of urban settlements, namely in the wet season. Unfortunately, due to the higher-than-expected complexity of infections and the small number of samples tested, genetic analysis was unable to identify any meaningful trends in the data.

中文翻译:

在2011年至2015年期间,利用空间和遗传工具评估恶性疟原虫在赞比亚卢萨卡的传播情况。

背景技术赞比亚为自己设定了到2021年消除疟疾的雄心勃勃的目标。为了继续将传播降至零,需要新的干预措施,工具和方法。方法2011年至2015年在卢萨卡市进行了城市反应病例检测(RCD),以更好地了解疟疾传播的位置和驱动因素。简要地,将索引病例带到他们的家中,对生活在索引室和九个近端住房中的所有同意的个体进行疟疾快速诊断测试,如果阳性,则进行治疗。进行了简短的调查,对于某些反应,收集了干血斑样品进行遗传分析。在空间上并针对环境相关因素分析了总体卫生设施数据,个人RCD反应数据和遗传结果。结果疟疾病例总数保持相对稳定,而事件病例的平均年龄和报告近期旅行的事件病例的比例均增加了。在整个研究期间,卢萨卡市的估计R0 <1。在无人/空地250 m内进行的RCD响应与识别其他感染的可能性更高。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法确定数据中任何有意义的趋势。事件的平均年龄和报告最近旅行的事件的比例均在增加。在整个研究期间,卢萨卡市的估计R0 <1。在无人/空地250 m内进行的RCD响应与识别其他感染的可能性更高。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法确定数据中任何有意义的趋势。事件的平均年龄和报告最近旅行的事件的比例均在增加。在整个研究期间,卢萨卡市的估计R0 <1。在无人/空地250 m内进行的RCD响应与识别其他感染的可能性更高。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法识别数据中任何有意义的趋势。在整个研究期间,卢萨卡市的估计R0 <1。在无人/空地250 m内进行的RCD响应与识别其他感染的可能性更高。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法识别数据中任何有意义的趋势。在整个研究期间,卢萨卡市的估计R0 <1。在无人/空地250 m内进行的RCD响应与识别其他感染的可能性更高。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法识别数据中任何有意义的趋势。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法识别数据中任何有意义的趋势。结论证据表明,大多数疟疾感染是从卢萨卡以外地区进口的。但是,在城市居民区的外围,即在雨季,仍存在一定程度的局部传播。不幸的是,由于感染的复杂性超出了预期,并且测试的样本数量很少,因此遗传分析无法确定数据中任何有意义的趋势。
更新日期:2020-01-15
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