107316
当前位置: 首页   >  课题组新闻   >  古DNA实验和数据分析流程入选STAR Protocols 2024中国最受欢迎论文
古DNA实验和数据分析流程入选STAR Protocols 2024中国最受欢迎论文
发布时间:2025-03-01

       STAR Protocols是Cell Press细胞出版社旗下一本开放获取、同行评审期刊,主要发布来自生命、健康、地球和物质科学所有领域的结构化、透明和可重复的分步实验和计算方法。2024年4月30日,王传超教授课题组在STAR protocols上发表题为“Protocol for a comprehensive pipeline to study ancient human genomes”的论文,发布了古人基因组实验和数据分析的全套流程方案。厦门大学生命科学学院博士生朱孔阳、何海峰、陶乐为论文共同第一作者,社会与人类学院博士后郭建新(现为中国科学院昆明动物所助理研究员)和王传超教授为共同通讯作者。该论文近日入选了STAR Protocols期刊2024年中国作者发表的全球下载量最高的文章。

       Zhu K, He H, Tao L, Ma H, Yang X, Wang R, Guo J, Wang CC. Protocol for a comprehensive pipeline to study ancient human genomes. STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):102985. 

       古基因组学近年来彻底改变了我们对人类进化与迁徙历史的理解。本文提出了一份用于古基因组学研究的样本制备方案。我们描述了从人类遗骸中释放DNA的步骤,包括DNA文库构建、杂交捕获、定量和测序。随后详细说明了序列读段的比对流程和群体遗传学分析方法。该方案还概述了古DNA样本提取面临的挑战及古DNA验证方法,以揭示古代人群的遗传历史与多样性。关于本方案的具体操作和应用细节,请参考Tao等人的研究:

       Tao L, Yuan H, Zhu K, Liu X, Guo J, Min R, He H, Cao D, Yang X, Zhou Z, Wang R, Zhao D, Ma H, Chen J, Zhao J, Li Y, He Y, Suo D, Zhang R, Li S, Li L, Yang F, Li H, Zhang L, Jin L, Wang CC. Ancient genomes reveal millet farming-related demic diffusion from the Yellow River into southwest China. Curr Biol. 2023 Nov 20;33(22):4995-5002.e7.