主要从事表观遗传学、基因组学、核酸修饰组学、临床组学和转化医学研究。以中山大学作为通讯作者第一单位，作为第一或通讯作者发表高水平文章20多篇，影响因子10分以上8篇，包括JAMA Oncol、J Natl Cancer Inst、J Natl Compr Canc Netw、Nat Commun、iScience、J Immunother Cancer、Clin Chem等国际权威杂志，多篇论文被选为封面论文。主持国家自然科学基金2项、广东省自然科学基金3项等多个国家级和省级科研项目。拥有多项落地成果，第一发明人获得国家发明专利授权5项、软件著作权2项，是入选2021年全国高价值专利项目的15项成果之一。目前为美国癌症研究协会（AACR）会员（Active Member）、Journal of Gene Medicine编委。代表性成果包括：研发了第三代甲基化特异性PCR技术QASM，实现在单碱基分辨率下检测基因组甲基化水平 (Clin Chem 2019)，解决了基因组CpG匮乏区甲基化PCR定量的难题，入选美国临床化学学会年度论文，并在国际上十个著名医疗中心进行了应用，揭示了表观基因组“暗物质”——CpG匮乏区甲基化的肿瘤标志物价值(JNCI 2022；期刊配发同期社评)；在表观遗传水平，开发了可以定量评估肿瘤微环境免疫细胞浸润的技术体系CD8+ MeTIL (J Immunother Cancer 2021)，评估疾病状态下的生物学衰老进程(Nat Commun 2022；F1000论文,ESI高被引论文)，揭示了基于非经典核酸构象转换的炎症因子调控机制(iScience 2022)；系统揭示了非转移性肿瘤免疫治疗中普遍存在的“假残留”影像-病理分离特征（JNCCN 2022），为环境暴露组和传感器组等组学领域设计了“去中心化”研究范式 (JAMA Oncol 2019)，构建了肿瘤生物标志物的时间异质性研究和应用范式（JNCCN 2023）。
单位主页: http://www.rig-sysu.org/qnyjy/info_93.aspx?itemid=542
Google Scholar: https://scholar.google.com.hk/citations?user=GPO5XIsAAAAJ&hl=zh-CN
Publons: https://publons.com/researcher/4301243/huichuan-yu/
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Huichuan-Yu
ORCID: 0000-0001-8357-1615
Email: yuhch5@mail.sysu.edu.cn
研究方向：
1. 检测万物、拟合万物：研发下一代化学生物学检测技术和算法工具，绘制和拟合不同生理和病理状态下人体组织和细胞的遗传学和表观遗传学特征
2. 表观时空：研究炎症和衰老相关性疾病中的表观遗传调控异常和免疫遗传学改变，开发下一代分子标志物和治疗靶标
教育工作背景：
2021-12～至今，中山大学附属第六医院，胃肠病学研究所，副研究员
2019-12～2020-07，美国Fred Hutchinson肿瘤研究中心，访问学者
2016-12～2021-12，中山大学附属第六医院，胃肠病学研究所，助理研究员
2014-07～2016-12，中山大学附属第六医院，结直肠外科，医师
2006-09～2014-06，中山大学中山医学院、中山大学附属第六医院，临床医学八年制，博士
主持科研项目：
1. 国家自然科学基金，面上项目，8227102866，基于DNA甲基化绘制的肿瘤微环境图谱在评估结直肠癌免疫特征中的研究
2. 国家自然科学基金，青年项目，81902877，A2BP1的表观沉默通过上调SNAI1的m6A甲基化促进结直肠癌侵袭转移的机制研究
3. 广东省自然科学基金，面上项目，2022A1515012656，ANKRD17的表观沉默通过上调MYC mRNA的m6A甲基化促进结直肠癌侵袭转移的机制研究
4. 广东省自然科学基金，面上项目，2018A0303130303，SNAI2介导HECW1基因启动子区甲基化修饰促进结直肠癌侵袭转移的机制研究
5. 广东省自然科学基金，青年项目，2016A030310222，CDO1基因启动子甲基化通过上调ROS/JAK-STAT3通路促进结直肠癌侵袭转移的机制研究
6. 广州市科技计划项目，一般项目，202201011004，RBFOX1介导NID2基因启动子区甲基化修饰促进结直肠癌侵袭转移的机制研究
7. 中山大学高校基本科研业务费，创新人才培育计划项目（青年拔尖人才培育项目），23ykbj007，肿瘤微环境表观遗传细胞图谱在结直肠癌免疫治疗中的研究
发表论文：
1. Yu H#, Wang X, Bai L, Tang G, Carter KT, Cui J, Huang P, Liang L, Ding Y, Cai M, Huang M, Liu H, Cao G, Gallinger S, Pai RK, Buchanan DD, Win AK, Newcomb PA, Wang JP*, Grady WM*, Luo Y*. DNA Methylation Profile in CpG-depleted Genomic Region Uncovers an Epigenetic Subtype with High Risk of Recurrence in Early-stage Colorectal Cancer. J Natl Cancer Inst. 2023 Jan 10;115(1):52-61.
2. Shen D#, Lin J#, Xie Y, Zhuang Z, Xu G, Peng S, Tang G, Bai L, Zhu M, Zhang Y, Huang Z, Wang P, Liu X, Huang M, Luo Y*, Wang X*, Yu H*. RNA demethylase ALKBH5 promotes colorectal cancer progression by posttranscriptional activation of RAB5A in an m6A-YTHDF2-dependent manner. Clin Transl Med. 2023 May;13(5):e1279.
3. Xie Y#, Lin J#, Zhang N#, Wang X, Wang P, Peng S, Li J, Wu Y, Huang Y, Zhuang Z, Shen D, Zhu M, Liu X, Liu G, Meng X, Huang M, Yu H*, Luo Y*. Prevalent Pseudoprogression and Pseudoresidue in Rectal Cancer Patients Treated with Neoadjuvant Immune Checkpoint Inhibitors. J Natl Compr Canc Netw. 2023 Feb;21(2):133-142.e3.
4. Cao X#, Li W, Wang T, Ran D, Davalos V, Planas-Serra L, Pujol A, Esteller M, Wang X, Yu H*. Accelerated biological aging in COVID-19 patients. Nat Commun. 2022 Apr 19;13(1):2135.
5. Shen D#, Wang X, Wang H, Xu G, Xie Y, Zhuang Z, Huang Z, Li J, Lin J, Wang P, Huang M, Luo Y, Yu H*. Current Surveillance After Treatment is Not Sufficient for Patients With Rectal Cancer With Negative Baseline CEA. J Natl Compr Canc Netw. 2022 Mar 1:1-10.
6. Zou Q#, Wang X#, Ren D#, Hu B, Tang G, Zhang Y, Huang M, Pai RK, Buchanan DD, Win AK, Newcomb PA, Grady WM, Yu H*, Luo Y*. DNA methylation-based signature of CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes enables evaluation of immune response and prognosis in colorectal cancer. J Immunother Cancer. 2021;9.
7. Yu H#, Bai L, Tang G, Wang X, Huang M, Cao G, Wang J, Luo Y*. Novel Assay for Quantitative Analysis of DNA Methylation at Single-Base Resolution. Clin Chem. 2019;65:664-673.
8. Yu H#, Luo Y*. Decentered Crowdfunded Clinical Studies-Open a New Era of Medical Research. JAMA Oncol. 2019;5:9-10.
9. Li L#, Xu B#, Zhuang Z#, Li J, Hu Y, Yang H, Wang X, Lin J, Zhou R, Chen W, Ran D, Huang M, Wang D*, Luo Y*, Yu H*. Accurate tumor segmentation and treatment outcome prediction with DeepTOP. Radiother Oncol. 2023 Feb 21;183:109550.
10. Wang X#, Chen S#, Zhao Z, Chen F, Huang Y, Guo X, Lei L, Wang W, Luo Y, Yu H*, Wang J*. Genomic G-quadruplex Folding Triggers a Cytokine-mediated Inflammatory Feedback Loop to Aggravate Inflammatory Diseases. iScience. 2022.
11. Chen Z#, Huang Z#, Luo Y, Zou Q, Bai L, Tang G, Wang X, Cao G, Huang M, Xiang J*, Yu H*. Genome-wide analysis identifies critical DNA methylations within NTRKs genes in colorectal cancer. J Transl Med. 2021;19:73.
12. Xie Y#, Lin J#, Wang X, Wang P, Zhuang Z, Zou Q, Cai D, Huang Z, Bai L, Tang G, Huang M, Wang J, Yu H*, Luo Y*. The Addition of Preoperative Radiation Is Insufficient for Lateral Pelvic Control in a Subgroup of Patients with Low Locally Advanced Rectal Cancer: A Post-Hoc Study of a Randomized Controlled Trial. Dis Colon Rectum. 2021.
13. Zhuang Z#, Liu Z#, Li J#, Wang X, Xie P, Xiong F, Hu J, Meng X, Huang M, Deng Y, Lan P, Yu H*, Luo Y*. Radiomic signature of the FOWARC trial predicts pathological response to neoadjuvant treatment in rectal cancer. J Transl Med. 2021;19:256.
14. Li X#, Cai D, Huang Y, Xie Y, Shen D, Yuan Z, Liu X, Huang M, Luo Y, Yu H*, Wang X*. Aberrant methylation in neurofunctional gene serves as a hallmark of tumorigenesis and progression in colorectal cancer. BMC Cancer. 2023 Apr 6;23(1):315.
15. Zhao Z#, Lin J#, Chen S#, Wang X, Wang H, Xu G, Wang J, Zhou R, Huang Z, Li Y, Zhang Y, Liu X, Wang P, Huang M, Luo Y, Yu H*. Clinical atlas of rectal cancer highlights the barriers and insufficient interventions underlying the unfavorable outcomes in older patients. Heliyon. 2023;9.
16. Hu Y#, Li J#, Zhuang Z#, Xu B#, Wang D*, Yu H*, Li L*. Automatic treatment outcome prediction with DeepInteg based on multimodal radiological images in rectal cancer. Heliyon. 2023 Jan 25;9(2):e13094.
17. Shen D#, Wang P#, Xie Y, Zhuang Z, Zhu M, Wang X, Huang M, Luo Y, Yu H*. Clinical spectrum of rectal cancer identifies hallmarks of early-onset patients and next-generation treatment strategies. Cancer Med. 2022.
18. Cao X#, Wang X, Wang H, Xu G, Yu H*. Systemic Inflammation Status Relates to Anti-Inflammatory Drug Benefit and Survival in Rectal Cancer. J Surg Res. 2022 Jan;269:249-259.
19. Li J#, Xie Y#, Huang Z, Shen D, Zhuang Z, Zhu M, Huang Y, He R, Wang X, Huang M, Luo Y, Yu H*. Current treatment and surveillance modalities are not sufficient for advanced stage III colon cancer: Result from a multicenter cohort analysis. Cancer Med. 2021;10:8924-8933.
20. Zhuang Z#, Wang X#, Huang M, Luo Y*, Yu H*. Serum calcium improved systemic inflammation marker for predicting survival outcome in rectal cancer. J Gastrointest Oncol. 2021;12:568-579.
21. Huang Z#, Wang X, Zou Q, Zhuang Z, Xie Y, Cai D, Bai L, Tang G, Huang M, Luo Y*, Yu H*. High platelet-to-lymphocyte ratio predicts improved survival outcome for perioperative NSAID use in patients with rectal cancer. Int J Colorectal Dis. 2020;35:695-704.
22. Zou Q#, Ren D#, Wang X, Bai L, Tang G, Huang M, Luo Y*, Yu H*. Improved Survival Outcome and Access to Cancer Screening from Hemorrhoid in Patients with Rectal Cancer. Gastroenterol Res Pract. 2020;2020:5045142.
23. Yu HC#, Luo YX*, Peng H, Wang XL, Yang ZH, Huang MJ, Kang L, Wang L, Wang JP*. Association of perioperative blood pressure with long-term survival in rectal cancer patients. Cancer Commun. 2016;35:38.
24. Yu HC#, Luo YX*, Peng H, Kang L, Huang MJ, Wang JP*. Avoiding perioperative dexamethasone may improve the outcome of patients with rectal cancer. Eur J Surg Oncol. 2015;41:667-673.
25. Yu HC#, Peng H#*, He XS, Zhao RS. Comparison of short- and long-term outcomes after extralevator abdominoperineal excision and standard abdominoperineal excision for rectal cancer: a systematic review and meta-analysis. Int J Colorectal Dis. 2014;29:183-191.
26. 禹汇川#, 骆衍新, 王小琳, 康亮, 黄美近, 邓艳红, 王磊, 汪建平*. 直肠癌根治术后的复发类型对复发后远期生存的影响. 中华医学杂志. 2016;96:625-628.
发明专利：
1. 禹汇川，骆衍新，白亮亮，唐冠楠，王小琳，李英杰，黄增鸿，黄美近，汪建平. 一种DNA甲基化定量系统，发明专利，ZL201810845927.3，2018年07月27日，2019年12月24日，中山大学附属第六医院、中山大学
2. 禹汇川，骆衍新，邹齐，王小琳，申鼎成，任东林，唐冠楠，张宇，黄美近. 用于评估组织免疫反应和诊断预后的DNA甲基化检测试剂盒，发明专利，ZL202011176816.1，2020年10月29日，2022年09月02日，中山大学附属第六医院、中山大学
3. 禹汇川，骆衍新，白亮亮，唐冠楠，王小琳，黄品助，黄安培，李英杰，黄美近，王磊，汪建平. KAZN基因甲基化检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用，发明专利，ZL201910045367.8，2019年01月17日，2023年08月01日，中山大学附属第六医院、中山大学
4. 禹汇川，骆衍新，白亮亮，唐冠楠，王小琳，黄品助，黄安培，李英杰，黄美近，王磊，汪建平. FAT3基因甲基化检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用，发明专利，ZL201910045385.6，2019年01月17日，2023年08月01日，中山大学附属第六医院、中山大学
5. 禹汇川，骆衍新，白亮亮，唐冠楠，王小琳，黄品助，黄安培，李英杰，黄美近，王磊，汪建平. DUSP3基因甲基化检测试剂在制备结直肠癌预后诊断试剂中的应用，发明专利，ZL201910045812.0，2019年01月17日，2023年08月11日，中山大学附属第六医院、中山大学
软件著作权：
1. 禹汇川、骆衍新，MeTIL甲基化免疫细胞分析软件，2022SR1440273
2. 禹汇川、骆衍新、庄卓凯，MoRad影像基因组分析软件，2022SR1415335
科技奖励：
禹汇川、骆衍新、白亮亮、唐冠楠、王小琳、李英杰、黄增鸿、黄美近、汪建平，一种DNA甲基化定量系统，2021年度高价值专利项目，中国生物工程学会，成果第一完成人，2021-10.
