Revista Argentina de Microbiología

Revista Argentina de Microbiología

Volume 52, Issue 3, July–September 2020, Pages 183-188
Revista Argentina de Microbiología

Original article
Frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes in ArgentinaFrecuencia y distribución geográfica de genotipos y tipos sexuales de los complejos de especies Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en Argentina

https://doi.org/10.1016/j.ram.2019.07.005Get rights and content
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Highlights

  • This is the first multicentre study of cryptococcosis around the country.

  • The study shows the geographical distribution of genotypes and mating types.

  • The study reveals the presence of uncommon hybrids.

  • The study reveals regions with high frequencies of some genotypes.

  • The study highlights the necessity of more regional studies.

Abstract

The aim of this work was to know the frequency and geographical distribution of genotypes and mating types of Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes isolated from human infections in Argentina during the period from April 2009 to April 2011. A multicenter study was conducted, in which 372 isolates were obtained from 61 laboratories throughout the country. Of those, 98.8% of the isolates belonged to the C. neoformans species complex and 1.1% to the C. gattii species complex. Genotype VNI (MATα) was the most frequently isolated (n = 326, 87.6%), followed by VNII (MATα) (n = 22, 5.9%), the recently described VNII-VNIV (aADα) hybrid (n = 14, 3.8%), VNIV (MATα) (n = 4, 1.1%), VNIII (αADa) hybrid (n = 1, 0.3%), and VNIII (αADα) hybrid (n = 1, 0.3%). The Argentine Central region showed the greatest number of cases and genotype diversity. Interestingly, a relative high frequency was observed in genotype VNII (MATα) in the Cuyo, Northeast and Northwest regions and, also in VNII-VNIV (aADα) hybrids in the Northwest region. C. gattii species complex was isolated at a low rate; 3 VGI (MATα) and 1 VGII (MATα) isolates were obtained from the Northwest and Central regions. In conclusion, this study shows that genotype frequencies seem to vary among regions in Argentina and reveals a relatively high frequency of rare hybrids in the Northwest region. Further regional clinical and environmental studies may help to elucidate if those variations in frequencies are associated with the existence of regional ecological niches or any other regional factors.

Resumen

El objetivo del trabajo fue conocer la frecuencia y la distribución geográfica de genotipos y tipos sexuales de aislados pertenecientes a los complejos de especies Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii obtenidos de infecciones humanas en Argentina. Entre abril de 2009 y abril de 2011 se realizó un estudio multicéntrico del que se obtuvieron 372 aislados de 61 laboratorios de diferentes zonas del país. El 98,8% de los aislados pertenecieron al complejo C. neoformans y el 1,1% al complejo C. gattii. El genotipo VNI (MATα) fue el más frecuente (n = 326; 87,6%), le siguieron VNII (MATα) (n = 22; 5,9%), el híbrido VNII-VNIV (aADα) (n = 14; 3,8%), VNIV (MATα) (n = 4; 1,1%) y los híbridos VNIII (αADa) (n = 1; 0,3%) y VNIII (αADα) (n = 1; 0,3%). La región Centro mostró el mayor número de casos y la mayor diversidad de genotipos. Cabe destacar que el genotipo VNII (MATα) tuvo una frecuencia relativamente alta en las regiones de Cuyo, Noreste y Noroeste. En esta última región, también fue alta la frecuencia del híbrido VNII-VNIV (aADα). La frecuencia de aislamiento de miembros del complejo C. gattii fue baja: se obtuvieron 3 aislados VGI (MATα) y 1 VGII (MATα) de las regiones Centro y Noroeste. En conclusión, este estudio muestra que las frecuencias de genotipos varían entre las distintas regiones de Argentina y señala la presencia de híbridos poco comunes en una frecuencia relativamente alta dentro de la región Noroeste. Contar con mayor número de estudios clínicos y ambientales regionales podría ayudar a elucidar si tales variaciones están asociadas a la existencia de nichos ecológicos particulares o a algún otro factor regional.

Keywords

Cryptococcus neoformans species complex
Cryptococcus gattii species complex
Cryptococcosis
Genotyping
Mating type
Hybrids

Palabras clave

Complejo de especies Cryptococcus neoformans
Complejo de especies Cryptococcus gattii
Criptococosis
Genotipificación
Tipo sexual
Híbridos

Cited by (0)

1

AGC: Argentinean Group of Cryptococcosis. See Supplementary file 1 for a complete list of members.