Endothelial cell protein C receptor (EPCR), the cellular receptor for protein C (PC), facilitates PC activation through the thrombin/thrombomodulin complex and regulates thrombin generation. Under pathophysiological conditions like sepsis, the interactions between EPCR and PC become impaired. Previous studies have demonstrated that the EPCR contains a phospholipid in the antigen-binding groove that is responsible for the structural stability of the EPCR and for PC recognition. However, an understanding at the atomic level during ligand recognition is not fully developed. Molecular dynamics simulations along with potential of mean force (PMF) calculations were carried out in order to provide molecular insight into the dynamics and free energies of EPCR–PC in the absence/presence of phospholipid, namely lysophosphatidylcholine (lysoPCh) and phosphatidylcholine (PCh) in the antigen-binding groove of the EPCR. Our data reveal that the presence of lipid maintains the optimal conformation of the EPCR for PC binding. PMF data further suggest that the PCh system is the most stable in comparison with the other systems (lysoPCh and no lipid). With regards to the two hydrophobic tails of PCh, one lipid tail regulates EPCR conformation while the other promotes ligand recognition by interacting with the keel residue (Phe-4) of PC. Due to the lack of one hydrophobic tail for the lysoPCh system, the EPCR conformation is retained but the affinity of the EPCR towards the ligand (PC) is reduced. Our studies for the first time explore the possible mode of ligand recognition by the EPCR via the involvement of phosphatidylcholine within its hydrophobic groove. The present work provides insight into PCh-dependent ligand recognition and hence regulation of the protein C/EPCR complex formation.

中文翻译：

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内皮细胞蛋白C受体（EPCR）沟中的磷脂酰胆碱调节EPCR构象和蛋白C识别

内皮细胞蛋白C受体（EPCR）是蛋白C（PC）的细胞受体，可通过凝血酶/血栓调节蛋白复合物促进PC活化并调节凝血酶的产生。在脓毒症等病理生理条件下，EPCR和PC之间的相互作用会受损。先前的研究表明，EPCR在抗原结合槽中包含磷脂，该磷脂负责EPCR的结构稳定性和PC识别。然而，在配体识别过程中对原子水平的理解还没有得到充分发展。进行了分子动力学模拟以及平均力（PMF）的计算，以提供分子对不存在/存在磷脂的情况下EPCR-PC的动力学和自由能的洞察力，即EPCR抗原结合槽中的溶血磷脂酰胆碱（lysoPCh）和磷脂酰胆碱（PCh）。我们的数据表明脂质的存在保持了PC结合EPCR的最佳构象。PMF数据进一步表明，与其他系统（lysoPCh和无脂质）相比，PCh系统最稳定。关于PCh的两个疏水尾，一个脂质尾调节EPCR构象，而另一个通过与PC的龙骨残基（Phe-4）相互作用来促进配体识别。由于lysoPCh系统缺少一个疏水尾，因此保留了EPCR构象，但EPCR对配体（PC）的亲和力降低了。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 我们的数据表明脂质的存在保持了PC结合EPCR的最佳构象。PMF数据进一步表明，与其他系统（lysoPCh和无脂质）相比，PCh系统最稳定。关于PCh的两个疏水尾，一个脂质尾调节EPCR构象，而另一个通过与PC的龙骨残基（Phe-4）相互作用来促进配体识别。由于lysoPCh系统缺少一个疏水尾，因此保留了EPCR构象，但EPCR对配体（PC）的亲和力降低了。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 我们的数据表明脂质的存在保持了PC结合EPCR的最佳构象。PMF数据进一步表明，与其他系统（lysoPCh和无脂质）相比，PCh系统最稳定。关于PCh的两个疏水尾，一个脂质尾调节EPCR构象，而另一个通过与PC的龙骨残基（Phe-4）相互作用来促进配体识别。由于lysoPCh系统缺少一个疏水尾，因此保留了EPCR构象，但EPCR对配体（PC）的亲和力降低了。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 PMF数据进一步表明，与其他系统（lysoPCh和无脂质）相比，PCh系统最稳定。关于PCh的两个疏水尾，一个脂质尾调节EPCR构象，而另一个通过与PC的龙骨残基（Phe-4）相互作用来促进配体识别。由于lysoPCh系统缺少一个疏水尾，因此保留了EPCR构象，但EPCR对配体（PC）的亲和力降低了。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 PMF数据进一步表明，与其他系统（lysoPCh和无脂质）相比，PCh系统最稳定。关于PCh的两个疏水尾，一个脂质尾调节EPCR构象，而另一个通过与PC的龙骨残基（Phe-4）相互作用来促进配体识别。由于lysoPCh系统缺少一个疏水尾，因此保留了EPCR构象，但EPCR对配体（PC）的亲和力降低了。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 EPCR构象被保留，但是EPCR对配体（PC）的亲和力降低。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式 EPCR构象被保留，但是EPCR对配体（PC）的亲和力降低。我们的研究首次探索了EPCR识别配体的可能模式通过磷脂酰胆碱在其疏水沟内的参与。本工作提供了对PCh依赖配体识别的见解，并因此调节了蛋白C / EPCR复合物的形成。