Lysine methylation is a widespread protein post-translational modification showing essentialities in versatile cellular process. EZH2, a methyltransferase specifically trimethylates the lysine 27 of histone H3 and its aberrance in several cancers promotes the development of its inhibitors against hematological tumors. In this study, we presented a deep exploration of lysine mono-, di- and trimethylomes in EZH2 wild-type and Y641 mutant lymphoma cell lines. Our results showed that several substrates were modified in different methylation levels. Moreover, these methylated lysine residues could also undergo other types of PTMs. Combined with the differences proved in protein expression, lysine acetylation, lysine ubiquitylation and protein N-termianl acetylation level, our study underlined the substrate specificity of lysine methylation and its crosstalk with other types of PTMs. Totally, our study raised new insights into the global cellular methylation features in hematological cell lines, which provided further inspects into the distribution and function of lysine methylation. SIGNIFICANCE: Our study showed the global landscape of mono-, di- and trimethylomes in the EZH2-aberrant DLBCL cell lines, revealing the molecular characteristics of lysine methylation. Combined with the protein abundance and potential crosstalk among different types of PTMs, our study raised new insights into the global cellular methylation features in hematological tumors and provided further inspects into the distribution and function of lysine methylation.

中文翻译：

---

EZH2野生型和突变淋巴瘤细胞系中蛋白质组和赖氨酸甲基化组特征的全局表征。

赖氨酸甲基化是一种广泛的蛋白质翻译后修饰，显示了多功能细胞过程中的必要性。EZH2是一种甲基转移酶，可特异性地对组蛋白H3的赖氨酸27进行三甲基化，其在多种癌症中的异常情况促进了其针对血液肿瘤的抑制剂的发展。在这项研究中，我们提出了EZH2野生型和Y641突变淋巴瘤细胞系中赖氨酸单，二和三甲基化组的深入探索。我们的结果表明，几种底物的甲基化程度不同。此外，这些甲基化的赖氨酸残基也可能经历其他类型的PTM。结合蛋白表达，赖氨酸乙酰化，赖氨酸泛素化和蛋白N末端乙酰化水平的差异，我们的研究强调了赖氨酸甲基化的底物特异性及其与其他类型PTM的串扰。总体而言，我们的研究对血液细胞系中的全球细胞甲基化特征提出了新的见解，从而进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。意义：我们的研究显示了EZH2异常DLBCL细胞系中单甲基，二甲基和三甲基基因组的全球格局，揭示了赖氨酸甲基化的分子特征。结合不同类型PTM之间的蛋白质丰度和潜在的串扰，我们的研究对血液肿瘤中的整体细胞甲基化特征提出了新的见解，并进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。我们的研究对血液细胞系中的全球细胞甲基化特征提出了新的见解，从而进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。意义：我们的研究显示了EZH2异常DLBCL细胞系中单甲基，二甲基和三甲基基因组的全球格局，揭示了赖氨酸甲基化的分子特征。结合不同类型PTM之间的蛋白质丰度和潜在的串扰，我们的研究对血液肿瘤中的整体细胞甲基化特征提出了新的见解，并进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。我们的研究对血液细胞系中的全球细胞甲基化特征提出了新的见解，从而进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。意义：我们的研究显示了EZH2异常DLBCL细胞系中单甲基，二甲基和三甲基基因组的全球格局，揭示了赖氨酸甲基化的分子特征。结合不同类型PTM之间的蛋白质丰度和潜在的串扰，我们的研究对血液肿瘤中的整体细胞甲基化特征提出了新的见解，并进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。我们的研究显示了EZH2异常DLBCL细胞系中单甲基，二甲基和三甲基基因组的全球格局，揭示了赖氨酸甲基化的分子特征。结合不同类型PTM之间的蛋白质丰度和潜在的串扰，我们的研究对血液肿瘤中的整体细胞甲基化特征提出了新的见解，并进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。我们的研究显示了EZH2异常DLBCL细胞系中单甲基，二甲基和三甲基基因组的全球格局，揭示了赖氨酸甲基化的分子特征。结合不同类型PTM之间的蛋白质丰度和潜在的串扰，我们的研究对血液肿瘤中的整体细胞甲基化特征提出了新的见解，并进一步研究了赖氨酸甲基化的分布和功能。