Cancer immunotherapy continues to make headway as a treatment for advanced stage tumors, revealing an urgent need to understand the fundamentals of anti-tumor immune responses. Noteworthy is a scarcity of data pertaining to the breadth and specificity of tumor-specific T cell responses in metastatic breast cancer. Autochthonous transgenic models of breast cancer display spontaneous metastasis in the FVB/NJ mouse strain, yet a lack of knowledge regarding tumor-bound MHC/peptide immune epitopes in this mouse model limits the characterization of tumor-specific T cell responses, and the mechanisms that regulate T cell responses in the metastatic setting. We recently generated the NetH2pan prediction tool for murine class I MHC ligands by building an FVB/NJ H-2q ligand database and combining it with public information from six other murine MHC alleles. Here, we deployed NetH2pan in combination with an advanced proteomics workflow to identify immunogenic T cell epitopes in the MMTV-PyMT transgenic model for metastatic breast cancer. Five unique MHC I/PyMT epitopes were identified. These tumor-specific epitopes were confirmed to be presented by the class I MHC of primary MMTV-PyMT tumors and their T cell immunogenicity was validated. Vaccination using a DNA construct encoding a truncated PyMT protein generated CD8 + T cell responses to these MHC class I/peptide complexes and prevented tumor development. In sum, we have established an MHC-ligand discovery pipeline in FVB/NJ mice, identified and tracked H-2Dq/PyMT neoantigen-specific T cells, and developed a vaccine that prevents tumor development in this metastatic model of breast cancer.

中文翻译：

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用于在转移性乳腺癌小鼠模型中识别和验证肿瘤特异性抗原的管道。

癌症免疫疗法作为晚期肿瘤的治疗方法继续取得进展，这表明迫切需要了解抗肿瘤免疫反应的基本原理。值得注意的是缺乏与转移性乳腺癌中肿瘤特异性 T 细胞反应的广度和特异性有关的数据。乳腺癌的本土转基因模型在 FVB/NJ 小鼠品系中显示出自发转移，但对该小鼠模型中肿瘤结合的 MHC/肽免疫表位缺乏了解限制了肿瘤特异性 T 细胞反应的表征，以及调节转移环境中的 T 细胞反应。我们最近通过建立 FVB/NJ H-2q 配体数据库并将其与来自其他六个鼠 MHC 等位基因的公共信息相结合，生成了鼠 I 类 MHC 配体的 NetH2pan 预测工具。在这里，我们将 NetH2pan 与先进的蛋白质组学工作流程相结合，以识别转移性乳腺癌 MMTV-PyMT 转基因模型中的免疫原性 T 细胞表位。鉴定了五个独特的 MHC I/PyMT 表位。这些肿瘤特异性表位被证实由原发性 MMTV-PyMT 肿瘤的 I 类 MHC 呈递，并验证了它们的 T 细胞免疫原性。使用编码截短的 PyMT 蛋白的 DNA 构建体进行疫苗接种产生了对这些 MHC I 类/肽复合物的 CD8 + T 细胞反应并阻止了肿瘤的发展。总之，我们在 FVB/NJ 小鼠中建立了 MHC 配体发现管道，识别和跟踪 H-2Dq/PyMT 新抗原特异性 T 细胞，并开​​发了一种疫苗，可防止这种乳腺癌转移模型中的肿瘤发展。我们将 NetH2pan 与先进的蛋白质组学工作流程相结合，以识别转移性乳腺癌 MMTV-PyMT 转基因模型中的免疫原性 T 细胞表位。鉴定了五个独特的 MHC I/PyMT 表位。这些肿瘤特异性表位被证实由原发性 MMTV-PyMT 肿瘤的 I 类 MHC 呈递，并验证了它们的 T 细胞免疫原性。使用编码截短的 PyMT 蛋白的 DNA 构建体进行疫苗接种产生了对这些 MHC I 类/肽复合物的 CD8 + T 细胞反应并阻止了肿瘤的发展。总之，我们在 FVB/NJ 小鼠中建立了 MHC 配体发现管道，识别和跟踪 H-2Dq/PyMT 新抗原特异性 T 细胞，并开​​发了一种疫苗，可防止这种乳腺癌转移模型中的肿瘤发展。我们将 NetH2pan 与先进的蛋白质组学工作流程相结合，以识别转移性乳腺癌 MMTV-PyMT 转基因模型中的免疫原性 T 细胞表位。鉴定了五个独特的 MHC I/PyMT 表位。这些肿瘤特异性表位被证实由原发性 MMTV-PyMT 肿瘤的 I 类 MHC 呈递，并验证了它们的 T 细胞免疫原性。使用编码截短的 PyMT 蛋白的 DNA 构建体进行疫苗接种产生了对这些 MHC I 类/肽复合物的 CD8 + T 细胞反应并阻止了肿瘤的发展。总之，我们在 FVB/NJ 小鼠中建立了 MHC 配体发现管道，识别和跟踪 H-2Dq/PyMT 新抗原特异性 T 细胞，并开​​发了一种疫苗，可防止这种乳腺癌转移模型中的肿瘤发展。